RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513406.1

ZBED3-AS1-210, ZBED3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED3-AS1, Length 713 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.45■■□□□ 1.83
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.85■■□□□ 1.25
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.81■■□□□ 1.24
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.13■■□□□ 1.13
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.79■■□□□ 1.08
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 SCRIBQ14160 1630 aa21.76■■□□□ 1.07
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.7■■□□□ 1.06
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 CUX2O14529 1486 aa20.88■□□□□ 0.93
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 NESP48681 1621 aa20.72■□□□□ 0.91
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 SMARCA4P51532 1647 aa20.65■□□□□ 0.9
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.41■□□□□ 0.86
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 OSCARQ8IYS5 282 aa20.09■□□□□ 0.81
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.08■□□□□ 0.81
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 CHD1O14646 1710 aa19.42■□□□□ 0.7
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 GRIN2BQ13224 1484 aa19.19■□□□□ 0.66
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 SYNJ1O43426 1573 aa19.18■□□□□ 0.66
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 CUX1P39880 1505 aa19.17■□□□□ 0.66
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.15■□□□□ 0.66
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.11■□□□□ 0.65
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 WDR97A6NE52 1622 aa19.1■□□□□ 0.65
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 PBRM1Q86U86 1689 aa19.01■□□□□ 0.63
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 GRIN2AQ12879 1464 aa18.92■□□□□ 0.62
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.92■□□□□ 0.62
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 CEP170Q5SW79 1584 aa18.85■□□□□ 0.61
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.84■□□□□ 0.61
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 JPH4Q96JJ6 628 aa18.84■□□□□ 0.61
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 NUP160Q12769 1436 aa18.83■□□□□ 0.61
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 ADAMTS12P58397 1594 aa18.81■□□□□ 0.6
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.6
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.78■□□□□ 0.6
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ZBED3-AS1-210ENST00000513406 SHROOM2Q13796 1616 aa18.72■□□□□ 0.59
ZBED3-AS1-210ENST00000513406 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.71■□□□□ 0.59
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