RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCC9O60706 1549 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NACADO15069 1562 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.75
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.68■□□□□ 0.74
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.53■□□□□ 0.72
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.38■□□□□ 0.69
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.34■□□□□ 0.69
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.19■□□□□ 0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCRIBQ14160 1630 aa19.17■□□□□ 0.66
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
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HOXC-AS1-202ENST00000512427 CUX2O14529 1486 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NCAPD3P42695 1498 aa18.46■□□□□ 0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERCC6Q03468 1493 aa18.44■□□□□ 0.54
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMARCA2P51531 1590 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HMGXB3Q12766 1538 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMARCA4P51532 1647 aa18.28■□□□□ 0.52
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HOXC-AS1-202ENST00000512427 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.84■□□□□ 0.45
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR62O43379 1518 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM41Q8WV44 630 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WIZO95785 1651 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.69■□□□□ 0.42
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CFTRP13569 1480 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OSCARQ8IYS5 282 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
HOXC-AS1-202ENST00000512427 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRDM2Q13029 1718 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFT140Q96RY7 1462 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCC8Q09428 1581 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOPBP1Q92547 1522 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGEF11O15085 1522 aa17.26■□□□□ 0.35
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.24■□□□□ 0.35
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHD1O14646 1710 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FBLN2P98095 1184 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARAP1Q96P48 1450 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SOGA1O94964 1423 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR97A6NE52 1622 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.03■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SYNJ1O43426 1573 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRIN2BQ13224 1484 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CUX1P39880 1505 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SYNJ2O15056 1496 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PBRM1Q86U86 1689 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.8■□□□□ 0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GRIN2AQ12879 1464 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADAMTS12P58397 1594 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUP160Q12769 1436 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CEP170Q5SW79 1584 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOP2BQ02880 1626 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SHROOM2Q13796 1616 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 JPH4Q96JJ6 628 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
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