RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512168.1

WDR41-221, Transcript of WD repeat domain 41, humanhuman

TSL 4

Gene WDR41, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41-221ENST00000512168 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42■■■■■ 4.31
WDR41-221ENST00000512168 ABCC9O60706 1549 aa37.77■■■■□ 3.64
WDR41-221ENST00000512168 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.74■■■■□ 3.63
WDR41-221ENST00000512168 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.91■■■■□ 3.34
WDR41-221ENST00000512168 NACADO15069 1562 aa35.68■■■■□ 3.3
WDR41-221ENST00000512168 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.62■■■■□ 3.29
WDR41-221ENST00000512168 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.23■■■■□ 3.23
WDR41-221ENST00000512168 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.22■■■■□ 3.23
WDR41-221ENST00000512168 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.21■■■■□ 3.23
WDR41-221ENST00000512168 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
WDR41-221ENST00000512168 BICRAQ9NZM4 1560 aa35■■■■□ 3.19
WDR41-221ENST00000512168 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
WDR41-221ENST00000512168 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.73■■■■□ 3.15
WDR41-221ENST00000512168 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.46■■■■□ 3.11
WDR41-221ENST00000512168 SCRIBQ14160 1630 aa34.31■■■■□ 3.08
WDR41-221ENST00000512168 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.16■■■■□ 3.06
WDR41-221ENST00000512168 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
WDR41-221ENST00000512168 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.04■■■■□ 3.04
WDR41-221ENST00000512168 NCAPD3P42695 1498 aa32.97■■■□□ 2.87
WDR41-221ENST00000512168 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.84■■■□□ 2.85
WDR41-221ENST00000512168 SMARCA4P51532 1647 aa32.78■■■□□ 2.84
WDR41-221ENST00000512168 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.72■■■□□ 2.83
WDR41-221ENST00000512168 HMGXB3Q12766 1538 aa32.71■■■□□ 2.83
WDR41-221ENST00000512168 SMARCA2P51531 1590 aa32.7■■■□□ 2.82
WDR41-221ENST00000512168 CUX2O14529 1486 aa32.61■■■□□ 2.81
WDR41-221ENST00000512168 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
WDR41-221ENST00000512168 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.53■■■□□ 2.8
WDR41-221ENST00000512168 ERCC6Q03468 1493 aa32.53■■■□□ 2.8
WDR41-221ENST00000512168 NESP48681 1621 aa32.47■■■□□ 2.79
WDR41-221ENST00000512168 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
WDR41-221ENST00000512168 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.36■■■□□ 2.77
WDR41-221ENST00000512168 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.21■■■□□ 2.75
WDR41-221ENST00000512168 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
WDR41-221ENST00000512168 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.05■■■□□ 2.72
WDR41-221ENST00000512168 WIZO95785 1651 aa31.96■■■□□ 2.71
WDR41-221ENST00000512168 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.96■■■□□ 2.71
WDR41-221ENST00000512168 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.91■■■□□ 2.7
WDR41-221ENST00000512168 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.73■■■□□ 2.67
WDR41-221ENST00000512168 WDR62O43379 1518 aa31.72■■■□□ 2.67
WDR41-221ENST00000512168 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
WDR41-221ENST00000512168 CFTRP13569 1480 aa31.57■■■□□ 2.64
WDR41-221ENST00000512168 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.56■■■□□ 2.64
WDR41-221ENST00000512168 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.54■■■□□ 2.64
WDR41-221ENST00000512168 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
WDR41-221ENST00000512168 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
WDR41-221ENST00000512168 PRDM2Q13029 1718 aa31.24■■■□□ 2.59
WDR41-221ENST00000512168 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.18■■■□□ 2.58
WDR41-221ENST00000512168 TRIM41Q8WV44 630 aa31.08■■■□□ 2.57
WDR41-221ENST00000512168 OSCARQ8IYS5 282 aa31.03■■■□□ 2.56
WDR41-221ENST00000512168 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
WDR41-221ENST00000512168 TOPBP1Q92547 1522 aa30.96■■■□□ 2.55
WDR41-221ENST00000512168 IFT140Q96RY7 1462 aa30.95■■■□□ 2.55
WDR41-221ENST00000512168 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
WDR41-221ENST00000512168 ABCC8Q09428 1581 aa30.83■■■□□ 2.53
WDR41-221ENST00000512168 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.83■■■□□ 2.53
WDR41-221ENST00000512168 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
WDR41-221ENST00000512168 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
WDR41-221ENST00000512168 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.74■■■□□ 2.51
WDR41-221ENST00000512168 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.74■■■□□ 2.51
WDR41-221ENST00000512168 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.74■■■□□ 2.51
WDR41-221ENST00000512168 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
WDR41-221ENST00000512168 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
WDR41-221ENST00000512168 ARHGEF11O15085 1522 aa30.63■■■□□ 2.49
WDR41-221ENST00000512168 CHD1O14646 1710 aa30.56■■■□□ 2.48
WDR41-221ENST00000512168 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.51■■■□□ 2.48
WDR41-221ENST00000512168 SOGA1O94964 1423 aa30.44■■■□□ 2.46
WDR41-221ENST00000512168 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.41■■■□□ 2.46
WDR41-221ENST00000512168 CUX1P39880 1505 aa30.41■■■□□ 2.46
WDR41-221ENST00000512168 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
WDR41-221ENST00000512168 WDR97A6NE52 1622 aa30.39■■■□□ 2.46
WDR41-221ENST00000512168 ARAP1Q96P48 1450 aa30.34■■■□□ 2.45
WDR41-221ENST00000512168 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.31■■■□□ 2.44
WDR41-221ENST00000512168 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.29■■■□□ 2.44
WDR41-221ENST00000512168 FBLN2P98095 1184 aa30.28■■■□□ 2.44
WDR41-221ENST00000512168 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.27■■■□□ 2.44
WDR41-221ENST00000512168 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
WDR41-221ENST00000512168 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.21■■■□□ 2.43
WDR41-221ENST00000512168 GRIN2BQ13224 1484 aa30.2■■■□□ 2.43
WDR41-221ENST00000512168 SYNJ2O15056 1496 aa30.13■■■□□ 2.41
WDR41-221ENST00000512168 SYNJ1O43426 1573 aa30.13■■■□□ 2.41
WDR41-221ENST00000512168 PBRM1Q86U86 1689 aa30.11■■■□□ 2.41
WDR41-221ENST00000512168 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
WDR41-221ENST00000512168 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.09■■■□□ 2.41
WDR41-221ENST00000512168 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.09■■■□□ 2.41
WDR41-221ENST00000512168 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.08■■■□□ 2.41
WDR41-221ENST00000512168 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
WDR41-221ENST00000512168 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.91■■■□□ 2.38
WDR41-221ENST00000512168 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
WDR41-221ENST00000512168 TOP2BQ02880 1626 aa29.89■■■□□ 2.37
WDR41-221ENST00000512168 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
WDR41-221ENST00000512168 GRIN2AQ12879 1464 aa29.84■■■□□ 2.37
WDR41-221ENST00000512168 ADAMTS12P58397 1594 aa29.84■■■□□ 2.37
WDR41-221ENST00000512168 NUP160Q12769 1436 aa29.79■■■□□ 2.36
WDR41-221ENST00000512168 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.78■■■□□ 2.36
WDR41-221ENST00000512168 CEP170Q5SW79 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
WDR41-221ENST00000512168 SHROOM2Q13796 1616 aa29.71■■■□□ 2.35
WDR41-221ENST00000512168 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.7■■■□□ 2.34
WDR41-221ENST00000512168 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.7■■■□□ 2.34
WDR41-221ENST00000512168 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.44■■■□□ 2.3
WDR41-221ENST00000512168 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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