RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511669.1

CXCL3-204, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL3, Length 1,641 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-204ENST00000511669 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.37■■■■□ 3.41
CXCL3-204ENST00000511669 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.69■■■□□ 2.66
CXCL3-204ENST00000511669 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CXCL3-204ENST00000511669 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.16■■■□□ 2.42
CXCL3-204ENST00000511669 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.92■■■□□ 2.38
CXCL3-204ENST00000511669 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.81■■■□□ 2.36
CXCL3-204ENST00000511669 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.7■■■□□ 2.34
CXCL3-204ENST00000511669 ABCC9O60706 1549 aa29.5■■■□□ 2.31
CXCL3-204ENST00000511669 NACADO15069 1562 aa29.41■■■□□ 2.3
CXCL3-204ENST00000511669 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.1■■■□□ 2.25
CXCL3-204ENST00000511669 SCRIBQ14160 1630 aa29.07■■■□□ 2.24
CXCL3-204ENST00000511669 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CXCL3-204ENST00000511669 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.41■■■□□ 2.14
CXCL3-204ENST00000511669 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CXCL3-204ENST00000511669 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CXCL3-204ENST00000511669 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.13■■■□□ 2.09
CXCL3-204ENST00000511669 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL3-204ENST00000511669 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL3-204ENST00000511669 SMARCA4P51532 1647 aa27.92■■■□□ 2.06
CXCL3-204ENST00000511669 WIZO95785 1651 aa27.87■■■□□ 2.05
CXCL3-204ENST00000511669 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
CXCL3-204ENST00000511669 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.82■■■□□ 2.04
CXCL3-204ENST00000511669 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CXCL3-204ENST00000511669 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.57■■■□□ 2
CXCL3-204ENST00000511669 SMARCA2P51531 1590 aa27.45■■□□□ 1.98
CXCL3-204ENST00000511669 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.34■■□□□ 1.97
CXCL3-204ENST00000511669 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.32■■□□□ 1.96
CXCL3-204ENST00000511669 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CXCL3-204ENST00000511669 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CXCL3-204ENST00000511669 TRIM41Q8WV44 630 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL3-204ENST00000511669 HMGXB3Q12766 1538 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-204ENST00000511669 NCAPD3P42695 1498 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-204ENST00000511669 ABCC8Q09428 1581 aa26.82■■□□□ 1.88
CXCL3-204ENST00000511669 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.75■■□□□ 1.87
CXCL3-204ENST00000511669 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
CXCL3-204ENST00000511669 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.7■■□□□ 1.86
CXCL3-204ENST00000511669 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
CXCL3-204ENST00000511669 EEA1Q15075 1411 aa26.63■■□□□ 1.85
CXCL3-204ENST00000511669 PRDM2Q13029 1718 aa26.57■■□□□ 1.84
CXCL3-204ENST00000511669 CFTRP13569 1480 aa26.56■■□□□ 1.84
CXCL3-204ENST00000511669 SYNJ1O43426 1573 aa26.51■■□□□ 1.83
CXCL3-204ENST00000511669 TOP2BQ02880 1626 aa26.46■■□□□ 1.83
CXCL3-204ENST00000511669 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.44■■□□□ 1.82
CXCL3-204ENST00000511669 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.41■■□□□ 1.82
CXCL3-204ENST00000511669 SOGA1O94964 1423 aa26.37■■□□□ 1.81
CXCL3-204ENST00000511669 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.32■■□□□ 1.8
CXCL3-204ENST00000511669 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.31■■□□□ 1.8
CXCL3-204ENST00000511669 CUX1P39880 1505 aa26.23■■□□□ 1.79
CXCL3-204ENST00000511669 GOLGA3Q08378 1498 aa26.2■■□□□ 1.78
CXCL3-204ENST00000511669 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.19■■□□□ 1.78
CXCL3-204ENST00000511669 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.19■■□□□ 1.78
CXCL3-204ENST00000511669 KIF21BO75037 1637 aa26.18■■□□□ 1.78
CXCL3-204ENST00000511669 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.18■■□□□ 1.78
CXCL3-204ENST00000511669 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
CXCL3-204ENST00000511669 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.16■■□□□ 1.78
CXCL3-204ENST00000511669 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.13■■□□□ 1.77
CXCL3-204ENST00000511669 KIF27Q86VH2 1401 aa26.05■■□□□ 1.76
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CXCL3-204ENST00000511669 CEP162Q5TB80 1403 aa26■■□□□ 1.75
CXCL3-204ENST00000511669 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.99■■□□□ 1.75
CXCL3-204ENST00000511669 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.97■■□□□ 1.75
CXCL3-204ENST00000511669 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.96■■□□□ 1.75
CXCL3-204ENST00000511669 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CXCL3-204ENST00000511669 NESP48681 1621 aa25.95■■□□□ 1.74
CXCL3-204ENST00000511669 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.93■■□□□ 1.74
CXCL3-204ENST00000511669 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.93■■□□□ 1.74
CXCL3-204ENST00000511669 PRXQ9BXM0 1461 aa25.87■■□□□ 1.73
CXCL3-204ENST00000511669 TOPBP1Q92547 1522 aa25.87■■□□□ 1.73
CXCL3-204ENST00000511669 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.85■■□□□ 1.73
CXCL3-204ENST00000511669 CUX2O14529 1486 aa25.85■■□□□ 1.73
CXCL3-204ENST00000511669 CLIP1P30622 1438 aa25.76■■□□□ 1.71
CXCL3-204ENST00000511669 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
CXCL3-204ENST00000511669 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-204ENST00000511669 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.74■■□□□ 1.71
CXCL3-204ENST00000511669 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CXCL3-204ENST00000511669 IGF1RP08069 1367 aa25.67■■□□□ 1.7
CXCL3-204ENST00000511669 WDR97A6NE52 1622 aa25.62■■□□□ 1.69
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CXCL3-204ENST00000511669 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.61■■□□□ 1.69
CXCL3-204ENST00000511669 CUL7Q14999 1698 aa25.6■■□□□ 1.69
CXCL3-204ENST00000511669 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.59■■□□□ 1.69
CXCL3-204ENST00000511669 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.58■■□□□ 1.68
CXCL3-204ENST00000511669 HRCP23327 699 aa25.5■■□□□ 1.67
CXCL3-204ENST00000511669 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.49■■□□□ 1.67
CXCL3-204ENST00000511669 APLP2Q06481 763 aa25.49■■□□□ 1.67
CXCL3-204ENST00000511669 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.44■■□□□ 1.66
CXCL3-204ENST00000511669 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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CXCL3-204ENST00000511669 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CXCL3-204ENST00000511669 WDR62O43379 1518 aa25.4■■□□□ 1.66
CXCL3-204ENST00000511669 ERCC6Q03468 1493 aa25.39■■□□□ 1.65
CXCL3-204ENST00000511669 ARAP1Q96P48 1450 aa25.39■■□□□ 1.65
CXCL3-204ENST00000511669 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CXCL3-204ENST00000511669 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.35■■□□□ 1.65
CXCL3-204ENST00000511669 IFT140Q96RY7 1462 aa25.34■■□□□ 1.65
CXCL3-204ENST00000511669 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.33■■□□□ 1.64
CXCL3-204ENST00000511669 PBRM1Q86U86 1689 aa25.3■■□□□ 1.64
CXCL3-204ENST00000511669 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.28■■□□□ 1.64
CXCL3-204ENST00000511669 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CXCL3-204ENST00000511669 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.22■■□□□ 1.63
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