RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508059.5

XPNPEP1-223, Transcript of X-prolyl aminopeptidase 1, human

TSL 4

Gene XPNPEP1, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPNPEP1-223	ENST00000508059	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		16.71	■□□□□ 0.27
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		14.86	□□□□□ -0.03
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ABCC9	O60706	1549 aa		14.46	□□□□□ -0.1
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
XPNPEP1-223	ENST00000508059	NACAD	O15069	1562 aa		13.9	□□□□□ -0.18
XPNPEP1-223	ENST00000508059	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		13.9	□□□□□ -0.18
XPNPEP1-223	ENST00000508059	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		13.86	□□□□□ -0.19
XPNPEP1-223	ENST00000508059	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		13.83	□□□□□ -0.2
XPNPEP1-223	ENST00000508059	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		13.74	□□□□□ -0.21
XPNPEP1-223	ENST00000508059	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		13.71	□□□□□ -0.21
XPNPEP1-223	ENST00000508059	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		13.6	□□□□□ -0.23
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SCRIB	Q14160	1630 aa		13.56	□□□□□ -0.24
XPNPEP1-223	ENST00000508059	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		13.36	□□□□□ -0.27
XPNPEP1-223	ENST00000508059	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		13.24	□□□□□ -0.29
XPNPEP1-223	ENST00000508059	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		13.1	□□□□□ -0.31
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		13.05	□□□□□ -0.32
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SMARCA4	P51532	1647 aa		12.99	□□□□□ -0.33
XPNPEP1-223	ENST00000508059	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
XPNPEP1-223	ENST00000508059	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		12.91	□□□□□ -0.34
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		12.87	□□□□□ -0.35
XPNPEP1-223	ENST00000508059	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		12.86	□□□□□ -0.35
XPNPEP1-223	ENST00000508059	NCAPD3	P42695	1498 aa		12.84	□□□□□ -0.35
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SMARCA2	P51531	1590 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XPNPEP1-223	ENST00000508059	HMGXB3	Q12766	1538 aa		12.81	□□□□□ -0.36
XPNPEP1-223	ENST00000508059	WIZ	O95785	1651 aa		12.77	□□□□□ -0.36
XPNPEP1-223	ENST00000508059	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
XPNPEP1-223	ENST00000508059	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
XPNPEP1-223	ENST00000508059	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
XPNPEP1-223	ENST00000508059	NES	P48681	1621 aa		12.56	□□□□□ -0.4
XPNPEP1-223	ENST00000508059	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		12.49	□□□□□ -0.41
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.45	□□□□□ -0.42
XPNPEP1-223	ENST00000508059	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		12.44	□□□□□ -0.42
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		12.43	□□□□□ -0.42
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CFTR	P13569	1480 aa		12.41	□□□□□ -0.42
XPNPEP1-223	ENST00000508059	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
XPNPEP1-223	ENST00000508059	PRDM2	Q13029	1718 aa		12.37	□□□□□ -0.43
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ERCC6	Q03468	1493 aa		12.37	□□□□□ -0.43
XPNPEP1-223	ENST00000508059	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		12.33	□□□□□ -0.44
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
XPNPEP1-223	ENST00000508059	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		12.31	□□□□□ -0.44
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		12.28	□□□□□ -0.44
XPNPEP1-223	ENST00000508059	WDR62	O43379	1518 aa		12.28	□□□□□ -0.44
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CUX2	O14529	1486 aa		12.27	□□□□□ -0.44
XPNPEP1-223	ENST00000508059	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.27	□□□□□ -0.44
XPNPEP1-223	ENST00000508059	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
XPNPEP1-223	ENST00000508059	TOPBP1	Q92547	1522 aa		12.15	□□□□□ -0.46
XPNPEP1-223	ENST00000508059	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		12.14	□□□□□ -0.47
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CUX1	P39880	1505 aa		12.11	□□□□□ -0.47
XPNPEP1-223	ENST00000508059	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
XPNPEP1-223	ENST00000508059	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.05	□□□□□ -0.48
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SYNJ1	O43426	1573 aa		12.04	□□□□□ -0.48
XPNPEP1-223	ENST00000508059	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		12.03	□□□□□ -0.48
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
XPNPEP1-223	ENST00000508059	WDR97	A6NE52	1622 aa		12.02	□□□□□ -0.49
XPNPEP1-223	ENST00000508059	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		12.02	□□□□□ -0.49
XPNPEP1-223	ENST00000508059	IFT140	Q96RY7	1462 aa		12.02	□□□□□ -0.49
XPNPEP1-223	ENST00000508059	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		12	□□□□□ -0.49
XPNPEP1-223	ENST00000508059	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
XPNPEP1-223	ENST00000508059	TOP2B	Q02880	1626 aa		12	□□□□□ -0.49
XPNPEP1-223	ENST00000508059	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SOGA1	O94964	1423 aa		11.93	□□□□□ -0.5
XPNPEP1-223	ENST00000508059	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.91	□□□□□ -0.5
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.91	□□□□□ -0.5
XPNPEP1-223	ENST00000508059	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
XPNPEP1-223	ENST00000508059	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.87	□□□□□ -0.51
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CHD1	O14646	1710 aa		11.84	□□□□□ -0.51
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.83	□□□□□ -0.52
XPNPEP1-223	ENST00000508059	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.82	□□□□□ -0.52
XPNPEP1-223	ENST00000508059	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.81	□□□□□ -0.52
XPNPEP1-223	ENST00000508059	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		11.79	□□□□□ -0.52
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.79	□□□□□ -0.52
XPNPEP1-223	ENST00000508059	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.72	□□□□□ -0.53
XPNPEP1-223	ENST00000508059	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		11.7	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.69	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.68	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.68	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.68	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		11.67	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CUL7	Q14999	1698 aa		11.66	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	NUP160	Q12769	1436 aa		11.66	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	IGF1R	P08069	1367 aa		11.66	□□□□□ -0.54
XPNPEP1-223	ENST00000508059	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.64	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.64	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.64	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	FBLN2	P98095	1184 aa		11.63	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.63	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.6	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	TRIM41	Q8WV44	630 aa		11.6	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.59	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		11.59	□□□□□ -0.55
XPNPEP1-223	ENST00000508059	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.57	□□□□□ -0.56
XPNPEP1-223	ENST00000508059	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.56	□□□□□ -0.56

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