RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507549.7

GTF2H2B-202, Transcript of general transcription factor IIH subunit 2B (pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene GTF2H2B, Length 1,055 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2B-202ENST00000507549 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.41■■■■■ 4.06
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GTF2H2B-202ENST00000507549 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.23■■■■□ 3.39
GTF2H2B-202ENST00000507549 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.6■■■■□ 3.13
GTF2H2B-202ENST00000507549 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.4■■■■□ 3.1
GTF2H2B-202ENST00000507549 NACADO15069 1562 aa34.32■■■■□ 3.08
GTF2H2B-202ENST00000507549 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.09■■■■□ 3.05
GTF2H2B-202ENST00000507549 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.95■■■■□ 3.03
GTF2H2B-202ENST00000507549 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.75■■■□□ 2.99
GTF2H2B-202ENST00000507549 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.62■■■□□ 2.97
GTF2H2B-202ENST00000507549 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
GTF2H2B-202ENST00000507549 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.47■■■□□ 2.95
GTF2H2B-202ENST00000507549 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.32■■■□□ 2.92
GTF2H2B-202ENST00000507549 SCRIBQ14160 1630 aa33.14■■■□□ 2.9
GTF2H2B-202ENST00000507549 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.1■■■□□ 2.89
GTF2H2B-202ENST00000507549 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.81■■■□□ 2.84
GTF2H2B-202ENST00000507549 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.8■■■□□ 2.84
GTF2H2B-202ENST00000507549 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
GTF2H2B-202ENST00000507549 NCAPD3P42695 1498 aa31.66■■■□□ 2.66
GTF2H2B-202ENST00000507549 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.59■■■□□ 2.65
GTF2H2B-202ENST00000507549 ERCC6Q03468 1493 aa31.54■■■□□ 2.64
GTF2H2B-202ENST00000507549 SMARCA2P51531 1590 aa31.53■■■□□ 2.64
GTF2H2B-202ENST00000507549 SMARCA4P51532 1647 aa31.53■■■□□ 2.64
GTF2H2B-202ENST00000507549 HMGXB3Q12766 1538 aa31.43■■■□□ 2.62
GTF2H2B-202ENST00000507549 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
GTF2H2B-202ENST00000507549 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.39■■■□□ 2.62
GTF2H2B-202ENST00000507549 CUX2O14529 1486 aa31.37■■■□□ 2.61
GTF2H2B-202ENST00000507549 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
GTF2H2B-202ENST00000507549 NESP48681 1621 aa31.23■■■□□ 2.59
GTF2H2B-202ENST00000507549 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.15■■■□□ 2.58
GTF2H2B-202ENST00000507549 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.14■■■□□ 2.58
GTF2H2B-202ENST00000507549 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.98■■■□□ 2.55
GTF2H2B-202ENST00000507549 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.89■■■□□ 2.53
GTF2H2B-202ENST00000507549 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
GTF2H2B-202ENST00000507549 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.76■■■□□ 2.51
GTF2H2B-202ENST00000507549 WIZO95785 1651 aa30.75■■■□□ 2.51
GTF2H2B-202ENST00000507549 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.75■■■□□ 2.51
GTF2H2B-202ENST00000507549 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.6■■■□□ 2.49
GTF2H2B-202ENST00000507549 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.5■■■□□ 2.47
GTF2H2B-202ENST00000507549 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
GTF2H2B-202ENST00000507549 WDR62O43379 1518 aa30.46■■■□□ 2.47
GTF2H2B-202ENST00000507549 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.44■■■□□ 2.46
GTF2H2B-202ENST00000507549 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
GTF2H2B-202ENST00000507549 CFTRP13569 1480 aa30.36■■■□□ 2.45
GTF2H2B-202ENST00000507549 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
GTF2H2B-202ENST00000507549 TRIM41Q8WV44 630 aa30.18■■■□□ 2.42
GTF2H2B-202ENST00000507549 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
GTF2H2B-202ENST00000507549 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.06■■■□□ 2.4
GTF2H2B-202ENST00000507549 OSCARQ8IYS5 282 aa30■■■□□ 2.39
GTF2H2B-202ENST00000507549 PRDM2Q13029 1718 aa29.94■■■□□ 2.38
GTF2H2B-202ENST00000507549 IFT140Q96RY7 1462 aa29.87■■■□□ 2.37
GTF2H2B-202ENST00000507549 TOPBP1Q92547 1522 aa29.82■■■□□ 2.36
GTF2H2B-202ENST00000507549 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
GTF2H2B-202ENST00000507549 ABCC8Q09428 1581 aa29.77■■■□□ 2.36
GTF2H2B-202ENST00000507549 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.7■■■□□ 2.35
GTF2H2B-202ENST00000507549 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
GTF2H2B-202ENST00000507549 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
GTF2H2B-202ENST00000507549 FBLN2P98095 1184 aa29.53■■■□□ 2.32
GTF2H2B-202ENST00000507549 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.52■■■□□ 2.32
GTF2H2B-202ENST00000507549 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.52■■■□□ 2.32
GTF2H2B-202ENST00000507549 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.52■■■□□ 2.32
GTF2H2B-202ENST00000507549 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
GTF2H2B-202ENST00000507549 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GTF2H2B-202ENST00000507549 ARHGEF11O15085 1522 aa29.45■■■□□ 2.31
GTF2H2B-202ENST00000507549 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF2H2B-202ENST00000507549 SOGA1O94964 1423 aa29.43■■■□□ 2.3
GTF2H2B-202ENST00000507549 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
GTF2H2B-202ENST00000507549 CHD1O14646 1710 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF2H2B-202ENST00000507549 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.36■■■□□ 2.29
GTF2H2B-202ENST00000507549 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.34■■■□□ 2.29
GTF2H2B-202ENST00000507549 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
GTF2H2B-202ENST00000507549 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.27■■■□□ 2.28
GTF2H2B-202ENST00000507549 CUX1P39880 1505 aa29.26■■■□□ 2.27
GTF2H2B-202ENST00000507549 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
GTF2H2B-202ENST00000507549 WDR97A6NE52 1622 aa29.21■■■□□ 2.27
GTF2H2B-202ENST00000507549 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.21■■■□□ 2.27
GTF2H2B-202ENST00000507549 GRIN2BQ13224 1484 aa29.17■■■□□ 2.26
GTF2H2B-202ENST00000507549 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
GTF2H2B-202ENST00000507549 ARAP1Q96P48 1450 aa29.15■■■□□ 2.26
GTF2H2B-202ENST00000507549 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
GTF2H2B-202ENST00000507549 SYNJ1O43426 1573 aa29.1■■■□□ 2.25
GTF2H2B-202ENST00000507549 SYNJ2O15056 1496 aa29.06■■■□□ 2.24
GTF2H2B-202ENST00000507549 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.06■■■□□ 2.24
GTF2H2B-202ENST00000507549 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.02■■■□□ 2.24
GTF2H2B-202ENST00000507549 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.98■■■□□ 2.23
GTF2H2B-202ENST00000507549 PBRM1Q86U86 1689 aa28.96■■■□□ 2.23
GTF2H2B-202ENST00000507549 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
GTF2H2B-202ENST00000507549 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.9■■■□□ 2.22
GTF2H2B-202ENST00000507549 GRIN2AQ12879 1464 aa28.78■■■□□ 2.2
GTF2H2B-202ENST00000507549 TOP2BQ02880 1626 aa28.77■■■□□ 2.2
GTF2H2B-202ENST00000507549 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.75■■■□□ 2.19
GTF2H2B-202ENST00000507549 ADAMTS12P58397 1594 aa28.73■■■□□ 2.19
GTF2H2B-202ENST00000507549 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.69■■■□□ 2.18
GTF2H2B-202ENST00000507549 CEP170Q5SW79 1584 aa28.63■■■□□ 2.17
GTF2H2B-202ENST00000507549 NUP160Q12769 1436 aa28.63■■■□□ 2.17
GTF2H2B-202ENST00000507549 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.62■■■□□ 2.17
GTF2H2B-202ENST00000507549 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.58■■■□□ 2.17
GTF2H2B-202ENST00000507549 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
GTF2H2B-202ENST00000507549 SHROOM2Q13796 1616 aa28.45■■■□□ 2.14
GTF2H2B-202ENST00000507549 JPH4Q96JJ6 628 aa28.42■■■□□ 2.14
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