RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.76■■■□□ 2.68
PGGT1B-204ENST00000503638 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PGGT1B-204ENST00000503638 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.33■■■□□ 2.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC9O60706 1549 aa28.1■■■□□ 2.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.1■■■□□ 2.09
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.77■■□□□ 1.88
PGGT1B-204ENST00000503638 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.67■■□□□ 1.86
PGGT1B-204ENST00000503638 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
PGGT1B-204ENST00000503638 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PGGT1B-204ENST00000503638 NACADO15069 1562 aa26.37■■□□□ 1.81
PGGT1B-204ENST00000503638 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
PGGT1B-204ENST00000503638 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.21■■□□□ 1.79
PGGT1B-204ENST00000503638 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.2■■□□□ 1.79
PGGT1B-204ENST00000503638 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.91■■□□□ 1.74
PGGT1B-204ENST00000503638 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.85■■□□□ 1.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SCRIBQ14160 1630 aa25.79■■□□□ 1.72
PGGT1B-204ENST00000503638 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.45■■□□□ 1.66
PGGT1B-204ENST00000503638 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.31■■□□□ 1.64
PGGT1B-204ENST00000503638 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.3■■□□□ 1.64
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PGGT1B-204ENST00000503638 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PGGT1B-204ENST00000503638 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.67■■□□□ 1.54
PGGT1B-204ENST00000503638 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 SMARCA4P51532 1647 aa24.61■■□□□ 1.53
PGGT1B-204ENST00000503638 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.5■■□□□ 1.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SMARCA2P51531 1590 aa24.4■■□□□ 1.5
PGGT1B-204ENST00000503638 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.39■■□□□ 1.5
PGGT1B-204ENST00000503638 NCAPD3P42695 1498 aa24.35■■□□□ 1.49
PGGT1B-204ENST00000503638 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.28■■□□□ 1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 WIZO95785 1651 aa24.27■■□□□ 1.48
PGGT1B-204ENST00000503638 CUX2O14529 1486 aa24.23■■□□□ 1.47
PGGT1B-204ENST00000503638 HMGXB3Q12766 1538 aa24.22■■□□□ 1.47
PGGT1B-204ENST00000503638 ERCC6Q03468 1493 aa24.19■■□□□ 1.46
PGGT1B-204ENST00000503638 NESP48681 1621 aa24.1■■□□□ 1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PGGT1B-204ENST00000503638 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PGGT1B-204ENST00000503638 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.74■■□□□ 1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.74■■□□□ 1.39
PGGT1B-204ENST00000503638 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.67■■□□□ 1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.65■■□□□ 1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.64■■□□□ 1.38
PGGT1B-204ENST00000503638 CFTRP13569 1480 aa23.55■■□□□ 1.36
PGGT1B-204ENST00000503638 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.47■■□□□ 1.35
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIM41Q8WV44 630 aa23.46■■□□□ 1.35
PGGT1B-204ENST00000503638 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.43■■□□□ 1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR62O43379 1518 aa23.41■■□□□ 1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 PRDM2Q13029 1718 aa23.39■■□□□ 1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.39■■□□□ 1.34
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXD1Q16676 465 aa23.33■■□□□ 1.33
PGGT1B-204ENST00000503638 OSCARQ8IYS5 282 aa23.19■■□□□ 1.3
PGGT1B-204ENST00000503638 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC8Q09428 1581 aa23.06■■□□□ 1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 TOPBP1Q92547 1522 aa23.06■■□□□ 1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.06■■□□□ 1.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CUX1P39880 1505 aa22.98■■□□□ 1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PGGT1B-204ENST00000503638 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.89■■□□□ 1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 SYNJ1O43426 1573 aa22.87■■□□□ 1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 IFT140Q96RY7 1462 aa22.86■■□□□ 1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 TOP2BQ02880 1626 aa22.84■■□□□ 1.25
PGGT1B-204ENST00000503638 SOGA1O94964 1423 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.81■■□□□ 1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.78■■□□□ 1.24
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGEF11O15085 1522 aa22.75■■□□□ 1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.71■■□□□ 1.23
PGGT1B-204ENST00000503638 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.63■■□□□ 1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 FBLN2P98095 1184 aa22.62■■□□□ 1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR97A6NE52 1622 aa22.61■■□□□ 1.21
PGGT1B-204ENST00000503638 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.56■■□□□ 1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CHD1O14646 1710 aa22.56■■□□□ 1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 ARAP1Q96P48 1450 aa22.54■■□□□ 1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.52■■□□□ 1.2
PGGT1B-204ENST00000503638 GRIN2BQ13224 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PBRM1Q86U86 1689 aa22.49■■□□□ 1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF27Q86VH2 1401 aa22.48■■□□□ 1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.47■■□□□ 1.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PGGT1B-204ENST00000503638 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.37■■□□□ 1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.34■■□□□ 1.17
PGGT1B-204ENST00000503638 SYNJ2O15056 1496 aa22.33■■□□□ 1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.32■■□□□ 1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTS12P58397 1594 aa22.32■■□□□ 1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.3■■□□□ 1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 IGF1RP08069 1367 aa22.29■■□□□ 1.16
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