RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501371.5

CACNA1C-AS1-201, CACNA1C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CACNA1C-AS1, Length 2,191 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.93■■■□□ 2.38
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.37■■□□□ 1.81
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ABCC9O60706 1549 aa25.22■■□□□ 1.63
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.8■■□□□ 1.56
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.77■■□□□ 1.56
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.71■■□□□ 1.55
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 NACADO15069 1562 aa24.66■■□□□ 1.54
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.55■■□□□ 1.52
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SCRIBQ14160 1630 aa24.08■■□□□ 1.45
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24■■□□□ 1.43
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.96■■□□□ 1.43
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.76■■□□□ 1.39
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.23■■□□□ 1.31
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SMARCA4P51532 1647 aa23.1■■□□□ 1.29
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.06■■□□□ 1.28
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.88■■□□□ 1.25
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.86■■□□□ 1.25
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 WIZO95785 1651 aa22.85■■□□□ 1.25
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SMARCA2P51531 1590 aa22.84■■□□□ 1.25
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.82■■□□□ 1.24
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 NCAPD3P42695 1498 aa22.74■■□□□ 1.23
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 HMGXB3Q12766 1538 aa22.68■■□□□ 1.22
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.6■■□□□ 1.21
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.37■■□□□ 1.17
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.1■■□□□ 1.13
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CFTRP13569 1480 aa22.09■■□□□ 1.13
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.06■■□□□ 1.12
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 PRDM2Q13029 1718 aa22.01■■□□□ 1.11
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 NESP48681 1621 aa21.99■■□□□ 1.11
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.89■■□□□ 1.09
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.84■■□□□ 1.09
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.78■■□□□ 1.08
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.77■■□□□ 1.08
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ABCC8Q09428 1581 aa21.72■■□□□ 1.07
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ERCC6Q03468 1493 aa21.71■■□□□ 1.07
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.67■■□□□ 1.06
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.61■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CUX1P39880 1505 aa21.6■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SYNJ1O43426 1573 aa21.59■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.59■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 TOP2BQ02880 1626 aa21.59■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.59■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 TRIM41Q8WV44 630 aa21.58■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 TOPBP1Q92547 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 WDR62O43379 1518 aa21.53■■□□□ 1.04
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.44■■□□□ 1.02
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SOGA1O94964 1423 aa21.34■■□□□ 1.01
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CUX2O14529 1486 aa21.32■■□□□ 1
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.3■■□□□ 1
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 IFT140Q96RY7 1462 aa21.29■■□□□ 1
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.27■■□□□ 1
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 WDR97A6NE52 1622 aa21.25■□□□□ 0.99
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 KIF27Q86VH2 1401 aa21.2■□□□□ 0.98
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 EEA1Q15075 1411 aa21.19■□□□□ 0.98
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.15■□□□□ 0.98
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.13■□□□□ 0.97
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.11■□□□□ 0.97
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.06■□□□□ 0.96
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.04■□□□□ 0.96
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 PBRM1Q86U86 1689 aa21.04■□□□□ 0.96
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 IGF1RP08069 1367 aa21.03■□□□□ 0.96
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 GRIN2BQ13224 1484 aa21.02■□□□□ 0.96
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CUL7Q14999 1698 aa20.97■□□□□ 0.95
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 PRXQ9BXM0 1461 aa20.92■□□□□ 0.94
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.92■□□□□ 0.94
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 KIF21BO75037 1637 aa20.91■□□□□ 0.94
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.9■□□□□ 0.94
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.89■□□□□ 0.93
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 ADAMTS12P58397 1594 aa20.88■□□□□ 0.93
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.87■□□□□ 0.93
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 GOLGA3Q08378 1498 aa20.84■□□□□ 0.93
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 SYNJ2O15056 1496 aa20.82■□□□□ 0.92
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.77■□□□□ 0.92
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.76■□□□□ 0.91
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 GRIN2AQ12879 1464 aa20.76■□□□□ 0.91
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 FBLN2P98095 1184 aa20.73■□□□□ 0.91
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CHD1O14646 1710 aa20.72■□□□□ 0.91
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.68■□□□□ 0.9
CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms