RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.96■■■□□ 2.39
CNOT4-211ENST00000498534 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CNOT4-211ENST00000498534 ABCC9O60706 1549 aa26.96■■□□□ 1.91
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.86■■□□□ 1.89
CNOT4-211ENST00000498534 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.41■■□□□ 1.82
CNOT4-211ENST00000498534 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.65■■□□□ 1.7
CNOT4-211ENST00000498534 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.49■■□□□ 1.67
CNOT4-211ENST00000498534 NACADO15069 1562 aa25.46■■□□□ 1.67
CNOT4-211ENST00000498534 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.35■■□□□ 1.65
CNOT4-211ENST00000498534 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
CNOT4-211ENST00000498534 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
CNOT4-211ENST00000498534 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.97■■□□□ 1.59
CNOT4-211ENST00000498534 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.83■■□□□ 1.57
CNOT4-211ENST00000498534 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CNOT4-211ENST00000498534 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.74■■□□□ 1.55
CNOT4-211ENST00000498534 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.53■■□□□ 1.52
CNOT4-211ENST00000498534 SCRIBQ14160 1630 aa24.48■■□□□ 1.51
CNOT4-211ENST00000498534 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.32■■□□□ 1.48
CNOT4-211ENST00000498534 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.31■■□□□ 1.48
CNOT4-211ENST00000498534 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CNOT4-211ENST00000498534 NCAPD3P42695 1498 aa23.52■■□□□ 1.36
CNOT4-211ENST00000498534 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.42■■□□□ 1.34
CNOT4-211ENST00000498534 SMARCA2P51531 1590 aa23.37■■□□□ 1.33
CNOT4-211ENST00000498534 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.37■■□□□ 1.33
CNOT4-211ENST00000498534 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CNOT4-211ENST00000498534 SMARCA4P51532 1647 aa23.35■■□□□ 1.33
CNOT4-211ENST00000498534 ERCC6Q03468 1493 aa23.32■■□□□ 1.32
CNOT4-211ENST00000498534 HMGXB3Q12766 1538 aa23.28■■□□□ 1.32
CNOT4-211ENST00000498534 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CNOT4-211ENST00000498534 CUX2O14529 1486 aa23.25■■□□□ 1.31
CNOT4-211ENST00000498534 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CNOT4-211ENST00000498534 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CNOT4-211ENST00000498534 NESP48681 1621 aa23.12■■□□□ 1.29
CNOT4-211ENST00000498534 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.12■■□□□ 1.29
CNOT4-211ENST00000498534 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.07■■□□□ 1.28
CNOT4-211ENST00000498534 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.97■■□□□ 1.27
CNOT4-211ENST00000498534 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
CNOT4-211ENST00000498534 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.83■■□□□ 1.25
CNOT4-211ENST00000498534 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CNOT4-211ENST00000498534 WIZO95785 1651 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT4-211ENST00000498534 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT4-211ENST00000498534 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.66■■□□□ 1.22
CNOT4-211ENST00000498534 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CNOT4-211ENST00000498534 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.57■■□□□ 1.2
CNOT4-211ENST00000498534 WDR62O43379 1518 aa22.56■■□□□ 1.2
CNOT4-211ENST00000498534 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.54■■□□□ 1.2
CNOT4-211ENST00000498534 CFTRP13569 1480 aa22.53■■□□□ 1.2
CNOT4-211ENST00000498534 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CNOT4-211ENST00000498534 TRIM41Q8WV44 630 aa22.35■■□□□ 1.17
CNOT4-211ENST00000498534 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CNOT4-211ENST00000498534 OSCARQ8IYS5 282 aa22.31■■□□□ 1.16
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.28■■□□□ 1.16
CNOT4-211ENST00000498534 PRDM2Q13029 1718 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT4-211ENST00000498534 IFT140Q96RY7 1462 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT4-211ENST00000498534 ABCC8Q09428 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT4-211ENST00000498534 TOPBP1Q92547 1522 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CNOT4-211ENST00000498534 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT4-211ENST00000498534 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CNOT4-211ENST00000498534 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.11e-7■■■■□ 23.2
CNOT4-211ENST00000498534 FBLN2P98095 1184 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT4-211ENST00000498534 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT4-211ENST00000498534 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT4-211ENST00000498534 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CNOT4-211ENST00000498534 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT4-211ENST00000498534 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CNOT4-211ENST00000498534 SOGA1O94964 1423 aa21.83■■□□□ 1.09
CNOT4-211ENST00000498534 FOXD1Q16676 465 aa21.82■■□□□ 1.08
CNOT4-211ENST00000498534 ARHGEF11O15085 1522 aa21.8■■□□□ 1.08
CNOT4-211ENST00000498534 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.79■■□□□ 1.08
CNOT4-211ENST00000498534 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CNOT4-211ENST00000498534 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.78■■□□□ 1.08
CNOT4-211ENST00000498534 CHD1O14646 1710 aa21.75■■□□□ 1.07
CNOT4-211ENST00000498534 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.71■■□□□ 1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CUX1P39880 1505 aa21.67■■□□□ 1.06
CNOT4-211ENST00000498534 WDR97A6NE52 1622 aa21.66■■□□□ 1.06
CNOT4-211ENST00000498534 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.64■■□□□ 1.05
CNOT4-211ENST00000498534 GRIN2BQ13224 1484 aa21.61■■□□□ 1.05
CNOT4-211ENST00000498534 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CNOT4-211ENST00000498534 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CNOT4-211ENST00000498534 ARAP1Q96P48 1450 aa21.58■■□□□ 1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SYNJ1O43426 1573 aa21.54■■□□□ 1.04
CNOT4-211ENST00000498534 SYNJ2O15056 1496 aa21.53■■□□□ 1.04
CNOT4-211ENST00000498534 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.53■■□□□ 1.04
CNOT4-211ENST00000498534 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.5■■□□□ 1.03
CNOT4-211ENST00000498534 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.47■■□□□ 1.03
CNOT4-211ENST00000498534 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
CNOT4-211ENST00000498534 PBRM1Q86U86 1689 aa21.44■■□□□ 1.02
CNOT4-211ENST00000498534 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.39■■□□□ 1.01
CNOT4-211ENST00000498534 TOP2BQ02880 1626 aa21.32■■□□□ 1
CNOT4-211ENST00000498534 GRIN2AQ12879 1464 aa21.31■■□□□ 1
CNOT4-211ENST00000498534 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.29■■□□□ 1
CNOT4-211ENST00000498534 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.29■■□□□ 1
CNOT4-211ENST00000498534 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.26■□□□□ 0.99
CNOT4-211ENST00000498534 ADAMTS12P58397 1594 aa21.23■□□□□ 0.99
CNOT4-211ENST00000498534 NUP160Q12769 1436 aa21.22■□□□□ 0.99
CNOT4-211ENST00000498534 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.21■□□□□ 0.99
CNOT4-211ENST00000498534 CEP170Q5SW79 1584 aa21.19■□□□□ 0.98
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