RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497552.5

PRRT1-211, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRT1, Length 543 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-211ENST00000497552 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.35■■■■■ 4.21
PRRT1-211ENST00000497552 ABCC9O60706 1549 aa37.54■■■■□ 3.6
PRRT1-211ENST00000497552 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.18■■■■□ 3.54
PRRT1-211ENST00000497552 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.51■■■■□ 3.28
PRRT1-211ENST00000497552 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.51■■■■□ 3.28
PRRT1-211ENST00000497552 NACADO15069 1562 aa35.2■■■■□ 3.23
PRRT1-211ENST00000497552 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35■■■■□ 3.19
PRRT1-211ENST00000497552 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.18
PRRT1-211ENST00000497552 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.81■■■■□ 3.16
PRRT1-211ENST00000497552 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.61■■■■□ 3.13
PRRT1-211ENST00000497552 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.6■■■■□ 3.13
PRRT1-211ENST00000497552 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
PRRT1-211ENST00000497552 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.08■■■■□ 3.05
PRRT1-211ENST00000497552 SCRIBQ14160 1630 aa33.96■■■■□ 3.03
PRRT1-211ENST00000497552 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.94■■■■□ 3.02
PRRT1-211ENST00000497552 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.88■■■■□ 3.01
PRRT1-211ENST00000497552 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.8■■■■□ 3
PRRT1-211ENST00000497552 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PRRT1-211ENST00000497552 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.67■■■□□ 2.82
PRRT1-211ENST00000497552 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
PRRT1-211ENST00000497552 NCAPD3P42695 1498 aa32.52■■■□□ 2.8
PRRT1-211ENST00000497552 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.43■■■□□ 2.78
PRRT1-211ENST00000497552 CUX2O14529 1486 aa32.37■■■□□ 2.77
PRRT1-211ENST00000497552 ERCC6Q03468 1493 aa32.35■■■□□ 2.77
PRRT1-211ENST00000497552 SMARCA4P51532 1647 aa32.33■■■□□ 2.77
PRRT1-211ENST00000497552 HMGXB3Q12766 1538 aa32.26■■■□□ 2.76
PRRT1-211ENST00000497552 SMARCA2P51531 1590 aa32.25■■■□□ 2.75
PRRT1-211ENST00000497552 NESP48681 1621 aa32.21■■■□□ 2.75
PRRT1-211ENST00000497552 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
PRRT1-211ENST00000497552 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
PRRT1-211ENST00000497552 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.98■■■□□ 2.71
PRRT1-211ENST00000497552 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.92■■■□□ 2.7
PRRT1-211ENST00000497552 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
PRRT1-211ENST00000497552 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.81■■■□□ 2.68
PRRT1-211ENST00000497552 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.75■■■□□ 2.67
PRRT1-211ENST00000497552 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.61■■■□□ 2.65
PRRT1-211ENST00000497552 WIZO95785 1651 aa31.53■■■□□ 2.64
PRRT1-211ENST00000497552 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.53■■■□□ 2.64
PRRT1-211ENST00000497552 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.46■■■□□ 2.63
PRRT1-211ENST00000497552 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.42■■■□□ 2.62
PRRT1-211ENST00000497552 WDR62O43379 1518 aa31.37■■■□□ 2.61
PRRT1-211ENST00000497552 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.23■■■□□ 2.59
PRRT1-211ENST00000497552 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.2■■■□□ 2.58
PRRT1-211ENST00000497552 TRIM41Q8WV44 630 aa31.18■■■□□ 2.58
PRRT1-211ENST00000497552 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
PRRT1-211ENST00000497552 CFTRP13569 1480 aa31.13■■■□□ 2.57
PRRT1-211ENST00000497552 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
PRRT1-211ENST00000497552 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
PRRT1-211ENST00000497552 OSCARQ8IYS5 282 aa30.82■■■□□ 2.52
PRRT1-211ENST00000497552 PRDM2Q13029 1718 aa30.78■■■□□ 2.52
PRRT1-211ENST00000497552 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.73■■■□□ 2.51
PRRT1-211ENST00000497552 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
PRRT1-211ENST00000497552 IFT140Q96RY7 1462 aa30.6■■■□□ 2.49
PRRT1-211ENST00000497552 TOPBP1Q92547 1522 aa30.59■■■□□ 2.49
PRRT1-211ENST00000497552 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.56■■■□□ 2.48
PRRT1-211ENST00000497552 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.56■■■□□ 2.48
PRRT1-211ENST00000497552 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.56■■■□□ 2.48
PRRT1-211ENST00000497552 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PRRT1-211ENST00000497552 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.43■■■□□ 2.46
PRRT1-211ENST00000497552 ARHGEF11O15085 1522 aa30.42■■■□□ 2.46
PRRT1-211ENST00000497552 ABCC8Q09428 1581 aa30.37■■■□□ 2.45
PRRT1-211ENST00000497552 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PRRT1-211ENST00000497552 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.452e-19■■■■■ 71.9
PRRT1-211ENST00000497552 CHD1O14646 1710 aa30.29■■■□□ 2.44
PRRT1-211ENST00000497552 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PRRT1-211ENST00000497552 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.2■■■□□ 2.43
PRRT1-211ENST00000497552 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.17■■■□□ 2.42
PRRT1-211ENST00000497552 ARAP1Q96P48 1450 aa30.14■■■□□ 2.42
PRRT1-211ENST00000497552 FBLN2P98095 1184 aa30.13■■■□□ 2.41
PRRT1-211ENST00000497552 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PRRT1-211ENST00000497552 SOGA1O94964 1423 aa30.08■■■□□ 2.41
PRRT1-211ENST00000497552 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.05■■■□□ 2.4
PRRT1-211ENST00000497552 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.03■■■□□ 2.4
PRRT1-211ENST00000497552 CUX1P39880 1505 aa30■■■□□ 2.39
PRRT1-211ENST00000497552 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.94■■■□□ 2.38
PRRT1-211ENST00000497552 WDR97A6NE52 1622 aa29.91■■■□□ 2.38
PRRT1-211ENST00000497552 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PRRT1-211ENST00000497552 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
PRRT1-211ENST00000497552 GRIN2BQ13224 1484 aa29.85■■■□□ 2.37
PRRT1-211ENST00000497552 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PRRT1-211ENST00000497552 SYNJ1O43426 1573 aa29.82■■■□□ 2.36
PRRT1-211ENST00000497552 SYNJ2O15056 1496 aa29.77■■■□□ 2.36
PRRT1-211ENST00000497552 PBRM1Q86U86 1689 aa29.76■■■□□ 2.35
PRRT1-211ENST00000497552 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.72■■■□□ 2.35
PRRT1-211ENST00000497552 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.67■■■□□ 2.34
PRRT1-211ENST00000497552 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.66■■■□□ 2.34
PRRT1-211ENST00000497552 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PRRT1-211ENST00000497552 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.53■■■□□ 2.32
PRRT1-211ENST00000497552 GRIN2AQ12879 1464 aa29.48■■■□□ 2.31
PRRT1-211ENST00000497552 ADAMTS12P58397 1594 aa29.47■■■□□ 2.31
PRRT1-211ENST00000497552 CEP170Q5SW79 1584 aa29.45■■■□□ 2.31
PRRT1-211ENST00000497552 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.3
PRRT1-211ENST00000497552 NUP160Q12769 1436 aa29.41■■■□□ 2.3
PRRT1-211ENST00000497552 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.41■■■□□ 2.3
PRRT1-211ENST00000497552 TOP2BQ02880 1626 aa29.39■■■□□ 2.3
PRRT1-211ENST00000497552 SHROOM2Q13796 1616 aa29.31■■■□□ 2.28
PRRT1-211ENST00000497552 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.31■■■□□ 2.28
PRRT1-211ENST00000497552 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.25■■■□□ 2.27
PRRT1-211ENST00000497552 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PRRT1-211ENST00000497552 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.08■■■□□ 2.25
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