RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497318.1

SUPT20H-223, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, human

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUPT20H-223	ENST00000497318	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.9	■■■■■ 4.3
SUPT20H-223	ENST00000497318	ABCC9	O60706	1549 aa		38.29	■■■■□ 3.72
SUPT20H-223	ENST00000497318	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.72	■■■■□ 3.63
SUPT20H-223	ENST00000497318	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.37	■■■■□ 3.41
SUPT20H-223	ENST00000497318	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.24	■■■■□ 3.39
SUPT20H-223	ENST00000497318	NACAD	O15069	1562 aa		35.89	■■■■□ 3.34
SUPT20H-223	ENST00000497318	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.78	■■■■□ 3.32
SUPT20H-223	ENST00000497318	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.65	■■■■□ 3.3
SUPT20H-223	ENST00000497318	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.26	■■■■□ 3.23
SUPT20H-223	ENST00000497318	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.17	■■■■□ 3.22
SUPT20H-223	ENST00000497318	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.09	■■■■□ 3.21
SUPT20H-223	ENST00000497318	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.73	■■■■□ 3.15
SUPT20H-223	ENST00000497318	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.6	■■■■□ 3.13
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.58	■■■■□ 3.13
SUPT20H-223	ENST00000497318	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.58	■■■■□ 3.13
SUPT20H-223	ENST00000497318	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.51	■■■■□ 3.11
SUPT20H-223	ENST00000497318	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.36	■■■■□ 3.09
SUPT20H-223	ENST00000497318	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.33	■■■■□ 3.09
SUPT20H-223	ENST00000497318	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.87	■■■■□ 3.01
SUPT20H-223	ENST00000497318	CUX2	O14529	1486 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SUPT20H-223	ENST00000497318	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SUPT20H-223	ENST00000497318	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SUPT20H-223	ENST00000497318	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SUPT20H-223	ENST00000497318	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SUPT20H-223	ENST00000497318	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SUPT20H-223	ENST00000497318	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SUPT20H-223	ENST00000497318	NES	P48681	1621 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SUPT20H-223	ENST00000497318	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SUPT20H-223	ENST00000497318	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SUPT20H-223	ENST00000497318	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.45	■■■□□ 2.78
SUPT20H-223	ENST00000497318	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SUPT20H-223	ENST00000497318	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SUPT20H-223	ENST00000497318	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
SUPT20H-223	ENST00000497318	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SUPT20H-223	ENST00000497318	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SUPT20H-223	ENST00000497318	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SUPT20H-223	ENST00000497318	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SUPT20H-223	ENST00000497318	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SUPT20H-223	ENST00000497318	WDR62	O43379	1518 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SUPT20H-223	ENST00000497318	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SUPT20H-223	ENST00000497318	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SUPT20H-223	ENST00000497318	WIZ	O95785	1651 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SUPT20H-223	ENST00000497318	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SUPT20H-223	ENST00000497318	CFTR	P13569	1480 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SUPT20H-223	ENST00000497318	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
SUPT20H-223	ENST00000497318	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
SUPT20H-223	ENST00000497318	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
SUPT20H-223	ENST00000497318	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.26	■■■□□ 2.59
SUPT20H-223	ENST00000497318	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SUPT20H-223	ENST00000497318	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SUPT20H-223	ENST00000497318	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SUPT20H-223	ENST00000497318	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SUPT20H-223	ENST00000497318	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SUPT20H-223	ENST00000497318	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SUPT20H-223	ENST00000497318	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SUPT20H-223	ENST00000497318	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SUPT20H-223	ENST00000497318	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SUPT20H-223	ENST00000497318	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SUPT20H-223	ENST00000497318	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.91	■■■□□ 2.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	FBLN2	P98095	1184 aa		30.9	■■■□□ 2.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.9	■■■□□ 2.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.89	■■■□□ 2.54
SUPT20H-223	ENST00000497318	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.88	■■■□□ 2.53	8e-6	■■■■□ 23.2
SUPT20H-223	ENST00000497318	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.76	■■■□□ 2.51
SUPT20H-223	ENST00000497318	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.74	■■■□□ 2.51
SUPT20H-223	ENST00000497318	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.72	■■■□□ 2.51
SUPT20H-223	ENST00000497318	CHD1	O14646	1710 aa		30.72	■■■□□ 2.51
SUPT20H-223	ENST00000497318	SOGA1	O94964	1423 aa		30.67	■■■□□ 2.5
SUPT20H-223	ENST00000497318	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.66	■■■□□ 2.5
SUPT20H-223	ENST00000497318	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.62	■■■□□ 2.49
SUPT20H-223	ENST00000497318	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.61	■■■□□ 2.49
SUPT20H-223	ENST00000497318	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.52	■■■□□ 2.48
SUPT20H-223	ENST00000497318	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.49	■■■□□ 2.47
SUPT20H-223	ENST00000497318	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.47	■■■□□ 2.47
SUPT20H-223	ENST00000497318	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.46	■■■□□ 2.47
SUPT20H-223	ENST00000497318	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.45	■■■□□ 2.46
SUPT20H-223	ENST00000497318	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.44	■■■□□ 2.46
SUPT20H-223	ENST00000497318	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.43	■■■□□ 2.46
SUPT20H-223	ENST00000497318	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	30.39	■■■□□ 2.46
SUPT20H-223	ENST00000497318	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.38	■■■□□ 2.45
SUPT20H-223	ENST00000497318	CUX1	P39880	1505 aa		30.32	■■■□□ 2.44
SUPT20H-223	ENST00000497318	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.25	■■■□□ 2.43
SUPT20H-223	ENST00000497318	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.12	■■■□□ 2.41
SUPT20H-223	ENST00000497318	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.07	■■■□□ 2.41
SUPT20H-223	ENST00000497318	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SUPT20H-223	ENST00000497318	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SUPT20H-223	ENST00000497318	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.99	■■■□□ 2.39
SUPT20H-223	ENST00000497318	NUP160	Q12769	1436 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SUPT20H-223	ENST00000497318	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SUPT20H-223	ENST00000497318	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SUPT20H-223	ENST00000497318	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SUPT20H-223	ENST00000497318	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SUPT20H-223	ENST00000497318	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
SUPT20H-223	ENST00000497318	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SUPT20H-223	ENST00000497318	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SUPT20H-223	ENST00000497318	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
SUPT20H-223	ENST00000497318	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SUPT20H-223	ENST00000497318	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SUPT20H-223	ENST00000497318	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.7	■■■□□ 2.35
SUPT20H-223	ENST00000497318	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.66	■■■□□ 2.34

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