RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495695.1

LAMA5-212, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 780 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-212ENST00000495695 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.18■■■■■ 5.62
LAMA5-212ENST00000495695 ABCC9O60706 1549 aa45.42■■■■■ 4.86
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.16■■■■■ 4.82
LAMA5-212ENST00000495695 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.19■■■■■ 4.5
LAMA5-212ENST00000495695 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.92■■■■■ 4.46
LAMA5-212ENST00000495695 NACADO15069 1562 aa42.84■■■■■ 4.45
LAMA5-212ENST00000495695 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.51■■■■■ 4.4
LAMA5-212ENST00000495695 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.363e-11■■■□□ 17.1
LAMA5-212ENST00000495695 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.21■■■■■ 4.35
LAMA5-212ENST00000495695 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.02■■■■■ 4.32
LAMA5-212ENST00000495695 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.84■■■■■ 4.29
LAMA5-212ENST00000495695 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.51■■■■■ 4.24
LAMA5-212ENST00000495695 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
LAMA5-212ENST00000495695 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.45■■■■■ 4.23
LAMA5-212ENST00000495695 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.02■■■■■ 4.16
LAMA5-212ENST00000495695 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.02■■■■■ 4.16
LAMA5-212ENST00000495695 SCRIBQ14160 1630 aa41.01■■■■■ 4.16
LAMA5-212ENST00000495695 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
LAMA5-212ENST00000495695 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.81■■■■□ 3.96
LAMA5-212ENST00000495695 NCAPD3P42695 1498 aa39.58■■■■□ 3.93
LAMA5-212ENST00000495695 CUX2O14529 1486 aa39.41■■■■□ 3.9
LAMA5-212ENST00000495695 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.34■■■■□ 3.89
LAMA5-212ENST00000495695 ERCC6Q03468 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
LAMA5-212ENST00000495695 SMARCA2P51531 1590 aa39.25■■■■□ 3.87
LAMA5-212ENST00000495695 HMGXB3Q12766 1538 aa39.19■■■■□ 3.86
LAMA5-212ENST00000495695 SMARCA4P51532 1647 aa39.16■■■■□ 3.86
LAMA5-212ENST00000495695 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
LAMA5-212ENST00000495695 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
LAMA5-212ENST00000495695 NESP48681 1621 aa38.89■■■■□ 3.82
LAMA5-212ENST00000495695 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.86■■■■□ 3.81
LAMA5-212ENST00000495695 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.7■■■■□ 3.79
LAMA5-212ENST00000495695 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.59■■■■□ 3.77
LAMA5-212ENST00000495695 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
LAMA5-212ENST00000495695 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.55■■■■□ 3.76
LAMA5-212ENST00000495695 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.35■■■■□ 3.73
LAMA5-212ENST00000495695 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.34■■■■□ 3.73
LAMA5-212ENST00000495695 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.15■■■■□ 3.7
LAMA5-212ENST00000495695 WIZO95785 1651 aa38.07■■■■□ 3.68
LAMA5-212ENST00000495695 WDR62O43379 1518 aa38.04■■■■□ 3.68
LAMA5-212ENST00000495695 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.93■■■■□ 3.66
LAMA5-212ENST00000495695 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.84■■■■□ 3.65
LAMA5-212ENST00000495695 CFTRP13569 1480 aa37.82■■■■□ 3.64
LAMA5-212ENST00000495695 TRIM41Q8WV44 630 aa37.79■■■■□ 3.64
LAMA5-212ENST00000495695 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
LAMA5-212ENST00000495695 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
LAMA5-212ENST00000495695 OSCARQ8IYS5 282 aa37.62■■■■□ 3.61
LAMA5-212ENST00000495695 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
LAMA5-212ENST00000495695 PRDM2Q13029 1718 aa37.28■■■■□ 3.56
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.24■■■■□ 3.55
LAMA5-212ENST00000495695 IFT140Q96RY7 1462 aa37.22■■■■□ 3.55
LAMA5-212ENST00000495695 ABCC8Q09428 1581 aa37.13■■■■□ 3.53
LAMA5-212ENST00000495695 TOPBP1Q92547 1522 aa37.08■■■■□ 3.53
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
LAMA5-212ENST00000495695 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.97■■■■□ 3.51
LAMA5-212ENST00000495695 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.97■■■■□ 3.51
LAMA5-212ENST00000495695 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.97■■■■□ 3.51
LAMA5-212ENST00000495695 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.91■■■■□ 3.5
LAMA5-212ENST00000495695 ARHGEF11O15085 1522 aa36.86■■■■□ 3.49
LAMA5-212ENST00000495695 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
LAMA5-212ENST00000495695 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
LAMA5-212ENST00000495695 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.75■■■■□ 3.471e-9■■■■□ 19.3
LAMA5-212ENST00000495695 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.68■■■■□ 3.46
LAMA5-212ENST00000495695 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
LAMA5-212ENST00000495695 FBLN2P98095 1184 aa36.62■■■■□ 3.45
LAMA5-212ENST00000495695 CHD1O14646 1710 aa36.59■■■■□ 3.45
LAMA5-212ENST00000495695 SOGA1O94964 1423 aa36.58■■■■□ 3.45
LAMA5-212ENST00000495695 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.5■■■■□ 3.43
LAMA5-212ENST00000495695 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
LAMA5-212ENST00000495695 WDR97A6NE52 1622 aa36.48■■■■□ 3.43
LAMA5-212ENST00000495695 ARAP1Q96P48 1450 aa36.45■■■■□ 3.43
LAMA5-212ENST00000495695 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
LAMA5-212ENST00000495695 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.38■■■■□ 3.41
LAMA5-212ENST00000495695 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
LAMA5-212ENST00000495695 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.34■■■■□ 3.41
LAMA5-212ENST00000495695 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
LAMA5-212ENST00000495695 GRIN2BQ13224 1484 aa36.29■■■■□ 3.4
LAMA5-212ENST00000495695 CUX1P39880 1505 aa36.28■■■■□ 3.4
LAMA5-212ENST00000495695 SYNJ1O43426 1573 aa36.26■■■■□ 3.39
LAMA5-212ENST00000495695 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.25■■■■□ 3.39
LAMA5-212ENST00000495695 SYNJ2O15056 1496 aa36.19■■■■□ 3.38
LAMA5-212ENST00000495695 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.1■■■■□ 3.37
LAMA5-212ENST00000495695 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.01■■■■□ 3.36
LAMA5-212ENST00000495695 PBRM1Q86U86 1689 aa35.97■■■■□ 3.35
LAMA5-212ENST00000495695 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.91■■■■□ 3.34
LAMA5-212ENST00000495695 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
LAMA5-212ENST00000495695 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
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LAMA5-212ENST00000495695 NUP160Q12769 1436 aa35.69■■■■□ 3.3
LAMA5-212ENST00000495695 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.66■■■■□ 3.3
LAMA5-212ENST00000495695 ADAMTS12P58397 1594 aa35.65■■■■□ 3.3
LAMA5-212ENST00000495695 TOP2BQ02880 1626 aa35.65■■■■□ 3.3
LAMA5-212ENST00000495695 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.62■■■■□ 3.29
LAMA5-212ENST00000495695 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
LAMA5-212ENST00000495695 CEP170Q5SW79 1584 aa35.59■■■■□ 3.29
LAMA5-212ENST00000495695 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.57■■■■□ 3.28
LAMA5-212ENST00000495695 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.57■■■■□ 3.28
LAMA5-212ENST00000495695 SHROOM2Q13796 1616 aa35.53■■■■□ 3.28
LAMA5-212ENST00000495695 JPH4Q96JJ6 628 aa35.4■■■■□ 3.26
LAMA5-212ENST00000495695 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
LAMA5-212ENST00000495695 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
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