RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495679.5

DPPA4-208, Transcript of developmental pluripotency associated 4, humanhuman

TSL 4

Gene DPPA4, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA4-208ENST00000495679 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.31■■□□□ 1.96
DPPA4-208ENST00000495679 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.52■■□□□ 1.52
DPPA4-208ENST00000495679 ABCC9O60706 1549 aa23.99■■□□□ 1.43
DPPA4-208ENST00000495679 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.08■■□□□ 1.29
DPPA4-208ENST00000495679 NACADO15069 1562 aa22.97■■□□□ 1.27
DPPA4-208ENST00000495679 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.87■■□□□ 1.25
DPPA4-208ENST00000495679 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
DPPA4-208ENST00000495679 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.72■■□□□ 1.23
DPPA4-208ENST00000495679 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.7■■□□□ 1.22
DPPA4-208ENST00000495679 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.58■■□□□ 1.21
DPPA4-208ENST00000495679 SCRIBQ14160 1630 aa22.35■■□□□ 1.17
DPPA4-208ENST00000495679 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.32■■□□□ 1.16
DPPA4-208ENST00000495679 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
DPPA4-208ENST00000495679 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.07■■□□□ 1.12
DPPA4-208ENST00000495679 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.92■■□□□ 1.1
DPPA4-208ENST00000495679 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
DPPA4-208ENST00000495679 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.74■■□□□ 1.07
DPPA4-208ENST00000495679 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.54■■□□□ 1.04
DPPA4-208ENST00000495679 SMARCA4P51532 1647 aa21.33■■□□□ 1
DPPA4-208ENST00000495679 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
DPPA4-208ENST00000495679 SMARCA2P51531 1590 aa21.18■□□□□ 0.98
DPPA4-208ENST00000495679 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.11■□□□□ 0.97
DPPA4-208ENST00000495679 HMGXB3Q12766 1538 aa21.09■□□□□ 0.97
DPPA4-208ENST00000495679 NCAPD3P42695 1498 aa21.07■□□□□ 0.96
DPPA4-208ENST00000495679 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.06■□□□□ 0.96
DPPA4-208ENST00000495679 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.04■□□□□ 0.96
DPPA4-208ENST00000495679 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
DPPA4-208ENST00000495679 WIZO95785 1651 aa20.93■□□□□ 0.94
DPPA4-208ENST00000495679 ERCC6Q03468 1493 aa20.75■□□□□ 0.91
DPPA4-208ENST00000495679 NESP48681 1621 aa20.71■□□□□ 0.91
DPPA4-208ENST00000495679 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.7■□□□□ 0.9
DPPA4-208ENST00000495679 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
DPPA4-208ENST00000495679 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
DPPA4-208ENST00000495679 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.64■□□□□ 0.9
DPPA4-208ENST00000495679 PRDM2Q13029 1718 aa20.52■□□□□ 0.88
DPPA4-208ENST00000495679 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
DPPA4-208ENST00000495679 CUX2O14529 1486 aa20.51■□□□□ 0.87
DPPA4-208ENST00000495679 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.47■□□□□ 0.87
DPPA4-208ENST00000495679 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.46■□□□□ 0.87
DPPA4-208ENST00000495679 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.35■□□□□ 0.85
DPPA4-208ENST00000495679 CFTRP13569 1480 aa20.34■□□□□ 0.85
DPPA4-208ENST00000495679 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.32■□□□□ 0.84
DPPA4-208ENST00000495679 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.31■□□□□ 0.84
DPPA4-208ENST00000495679 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.31■□□□□ 0.84
DPPA4-208ENST00000495679 WDR62O43379 1518 aa20.27■□□□□ 0.83
DPPA4-208ENST00000495679 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
DPPA4-208ENST00000495679 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
DPPA4-208ENST00000495679 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20■□□□□ 0.79
DPPA4-208ENST00000495679 TOPBP1Q92547 1522 aa19.97■□□□□ 0.79
DPPA4-208ENST00000495679 ABCC8Q09428 1581 aa19.96■□□□□ 0.79
DPPA4-208ENST00000495679 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.88■□□□□ 0.77
DPPA4-208ENST00000495679 IFT140Q96RY7 1462 aa19.87■□□□□ 0.77
DPPA4-208ENST00000495679 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
DPPA4-208ENST00000495679 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
DPPA4-208ENST00000495679 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
DPPA4-208ENST00000495679 CUX1P39880 1505 aa19.78■□□□□ 0.76
DPPA4-208ENST00000495679 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
DPPA4-208ENST00000495679 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.75■□□□□ 0.75
DPPA4-208ENST00000495679 WDR97A6NE52 1622 aa19.73■□□□□ 0.75
DPPA4-208ENST00000495679 CHD1O14646 1710 aa19.7■□□□□ 0.74
DPPA4-208ENST00000495679 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.69■□□□□ 0.74
DPPA4-208ENST00000495679 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.69■□□□□ 0.74
DPPA4-208ENST00000495679 PBRM1Q86U86 1689 aa19.67■□□□□ 0.74
DPPA4-208ENST00000495679 SOGA1O94964 1423 aa19.67■□□□□ 0.74
DPPA4-208ENST00000495679 TOP2BQ02880 1626 aa19.64■□□□□ 0.73
DPPA4-208ENST00000495679 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.73
DPPA4-208ENST00000495679 SYNJ1O43426 1573 aa19.62■□□□□ 0.73
DPPA4-208ENST00000495679 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
DPPA4-208ENST00000495679 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
DPPA4-208ENST00000495679 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.54■□□□□ 0.72
DPPA4-208ENST00000495679 OSCARQ8IYS5 282 aa19.54■□□□□ 0.72
DPPA4-208ENST00000495679 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.52■□□□□ 0.72
DPPA4-208ENST00000495679 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.51■□□□□ 0.71
DPPA4-208ENST00000495679 GRIN2BQ13224 1484 aa19.49■□□□□ 0.71
DPPA4-208ENST00000495679 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.48■□□□□ 0.71
DPPA4-208ENST00000495679 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
DPPA4-208ENST00000495679 FBLN2P98095 1184 aa19.46■□□□□ 0.71
DPPA4-208ENST00000495679 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.43■□□□□ 0.7
DPPA4-208ENST00000495679 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.43■□□□□ 0.7
DPPA4-208ENST00000495679 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.43■□□□□ 0.7
DPPA4-208ENST00000495679 SYNJ2O15056 1496 aa19.39■□□□□ 0.69
DPPA4-208ENST00000495679 ADAMTS12P58397 1594 aa19.37■□□□□ 0.69
DPPA4-208ENST00000495679 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
DPPA4-208ENST00000495679 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
DPPA4-208ENST00000495679 ARHGEF11O15085 1522 aa19.34■□□□□ 0.69
DPPA4-208ENST00000495679 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.32■□□□□ 0.68
DPPA4-208ENST00000495679 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.31■□□□□ 0.68
DPPA4-208ENST00000495679 TRIM41Q8WV44 630 aa19.31■□□□□ 0.68
DPPA4-208ENST00000495679 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.29■□□□□ 0.68
DPPA4-208ENST00000495679 GRIN2AQ12879 1464 aa19.26■□□□□ 0.67
DPPA4-208ENST00000495679 CUL7Q14999 1698 aa19.24■□□□□ 0.67
DPPA4-208ENST00000495679 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.23■□□□□ 0.67
DPPA4-208ENST00000495679 CEP170Q5SW79 1584 aa19.22■□□□□ 0.67
DPPA4-208ENST00000495679 KIF27Q86VH2 1401 aa19.18■□□□□ 0.66
DPPA4-208ENST00000495679 ARAP1Q96P48 1450 aa19.15■□□□□ 0.66
DPPA4-208ENST00000495679 NUP160Q12769 1436 aa19.12■□□□□ 0.65
DPPA4-208ENST00000495679 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.11■□□□□ 0.65
DPPA4-208ENST00000495679 SHROOM2Q13796 1616 aa19.1■□□□□ 0.65
DPPA4-208ENST00000495679 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.07■□□□□ 0.64
DPPA4-208ENST00000495679 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms