RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492710.1

EPC1-209, Transcript of enhancer of polycomb homolog 1, humanhuman

TSL 2

Gene EPC1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPC1-209ENST00000492710 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.17■□□□□ 0.98
EPC1-209ENST00000492710 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
EPC1-209ENST00000492710 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.41■□□□□ 0.86
EPC1-209ENST00000492710 ABCC9O60706 1549 aa19.25■□□□□ 0.67
EPC1-209ENST00000492710 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.13■□□□□ 0.65
EPC1-209ENST00000492710 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.22■□□□□ 0.51
EPC1-209ENST00000492710 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.2■□□□□ 0.5
EPC1-209ENST00000492710 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.05■□□□□ 0.48
EPC1-209ENST00000492710 NACADO15069 1562 aa18.04■□□□□ 0.48
EPC1-209ENST00000492710 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
EPC1-209ENST00000492710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.91■□□□□ 0.46
EPC1-209ENST00000492710 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
EPC1-209ENST00000492710 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
EPC1-209ENST00000492710 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.78■□□□□ 0.44
EPC1-209ENST00000492710 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.67■□□□□ 0.42
EPC1-209ENST00000492710 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
EPC1-209ENST00000492710 SCRIBQ14160 1630 aa17.45■□□□□ 0.38
EPC1-209ENST00000492710 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.42■□□□□ 0.38
EPC1-209ENST00000492710 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.42■□□□□ 0.38
EPC1-209ENST00000492710 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.34■□□□□ 0.37
EPC1-209ENST00000492710 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.31■□□□□ 0.36
EPC1-209ENST00000492710 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
EPC1-209ENST00000492710 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.74■□□□□ 0.27
EPC1-209ENST00000492710 NCAPD3P42695 1498 aa16.62■□□□□ 0.25
EPC1-209ENST00000492710 SMARCA4P51532 1647 aa16.6■□□□□ 0.25
EPC1-209ENST00000492710 FOXD1Q16676 465 aa16.58■□□□□ 0.24
EPC1-209ENST00000492710 CUX2O14529 1486 aa16.58■□□□□ 0.24
EPC1-209ENST00000492710 ERCC6Q03468 1493 aa16.58■□□□□ 0.24
EPC1-209ENST00000492710 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.58■□□□□ 0.24
EPC1-209ENST00000492710 NESP48681 1621 aa16.53■□□□□ 0.24
EPC1-209ENST00000492710 SMARCA2P51531 1590 aa16.52■□□□□ 0.24
EPC1-209ENST00000492710 HMGXB3Q12766 1538 aa16.52■□□□□ 0.24
EPC1-209ENST00000492710 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.48■□□□□ 0.23
EPC1-209ENST00000492710 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
EPC1-209ENST00000492710 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
EPC1-209ENST00000492710 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.41■□□□□ 0.22
EPC1-209ENST00000492710 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
EPC1-209ENST00000492710 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.39■□□□□ 0.21
EPC1-209ENST00000492710 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.35■□□□□ 0.21
EPC1-209ENST00000492710 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.33■□□□□ 0.2
EPC1-209ENST00000492710 WIZO95785 1651 aa16.23■□□□□ 0.19
EPC1-209ENST00000492710 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.16■□□□□ 0.18
EPC1-209ENST00000492710 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.1■□□□□ 0.17
EPC1-209ENST00000492710 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.09■□□□□ 0.17
EPC1-209ENST00000492710 WDR62O43379 1518 aa16.09■□□□□ 0.17
EPC1-209ENST00000492710 TRIM41Q8WV44 630 aa16■□□□□ 0.15
EPC1-209ENST00000492710 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.99■□□□□ 0.15
EPC1-209ENST00000492710 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.97■□□□□ 0.15
EPC1-209ENST00000492710 PRDM2Q13029 1718 aa15.95■□□□□ 0.14
EPC1-209ENST00000492710 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
EPC1-209ENST00000492710 CFTRP13569 1480 aa15.91■□□□□ 0.14
EPC1-209ENST00000492710 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
EPC1-209ENST00000492710 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
EPC1-209ENST00000492710 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.85■□□□□ 0.13
EPC1-209ENST00000492710 ADRA2BP18089 450 aa15.8■□□□□ 0.12
EPC1-209ENST00000492710 OSCARQ8IYS5 282 aa15.76■□□□□ 0.11
EPC1-209ENST00000492710 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.74■□□□□ 0.11
EPC1-209ENST00000492710 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.74■□□□□ 0.11
EPC1-209ENST00000492710 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.74■□□□□ 0.11
EPC1-209ENST00000492710 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
EPC1-209ENST00000492710 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.72■□□□□ 0.11
EPC1-209ENST00000492710 TOPBP1Q92547 1522 aa15.67■□□□□ 0.1
EPC1-209ENST00000492710 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
EPC1-209ENST00000492710 CHD1O14646 1710 aa15.66■□□□□ 0.1
EPC1-209ENST00000492710 IFT140Q96RY7 1462 aa15.65■□□□□ 0.1
EPC1-209ENST00000492710 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.61■□□□□ 0.09
EPC1-209ENST00000492710 ARHGEF11O15085 1522 aa15.6■□□□□ 0.09
EPC1-209ENST00000492710 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
EPC1-209ENST00000492710 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
EPC1-209ENST00000492710 ABCC8Q09428 1581 aa15.53■□□□□ 0.08
EPC1-209ENST00000492710 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
EPC1-209ENST00000492710 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
EPC1-209ENST00000492710 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.47■□□□□ 0.07
EPC1-209ENST00000492710 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.45■□□□□ 0.06
EPC1-209ENST00000492710 ARAP1Q96P48 1450 aa15.44■□□□□ 0.06
EPC1-209ENST00000492710 FBLN2P98095 1184 aa15.42■□□□□ 0.06
EPC1-209ENST00000492710 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.39■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 WDR97A6NE52 1622 aa15.39■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 SOGA1O94964 1423 aa15.38■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.37■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 PBRM1Q86U86 1689 aa15.37■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 CUX1P39880 1505 aa15.37■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.36■□□□□ 0.05
EPC1-209ENST00000492710 MSH5O43196 834 aa15.33■□□□□ 0.04
EPC1-209ENST00000492710 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
EPC1-209ENST00000492710 SYNJ1O43426 1573 aa15.31■□□□□ 0.04
EPC1-209ENST00000492710 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
EPC1-209ENST00000492710 GRIN2BQ13224 1484 aa15.26■□□□□ 0.03
EPC1-209ENST00000492710 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
EPC1-209ENST00000492710 SYNJ2O15056 1496 aa15.24■□□□□ 0.03
EPC1-209ENST00000492710 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.24■□□□□ 0.03
EPC1-209ENST00000492710 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.2■□□□□ 0.02
EPC1-209ENST00000492710 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.18■□□□□ 0.02
EPC1-209ENST00000492710 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.16■□□□□ 0.02
EPC1-209ENST00000492710 ADAMTS12P58397 1594 aa15.12■□□□□ 0.01
EPC1-209ENST00000492710 CEP170Q5SW79 1584 aa15.12■□□□□ 0.01
EPC1-209ENST00000492710 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.12■□□□□ 0.01
EPC1-209ENST00000492710 GRIN2AQ12879 1464 aa15.1■□□□□ 0.01
EPC1-209ENST00000492710 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms