RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492066.5

STX5-208, Transcript of syntaxin 5, human

TSL 5

Gene STX5, Length 1,627 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX5-208	ENST00000492066	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		46.26	■■■■■ 5
STX5-208	ENST00000492066	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.72	■■■■■ 4.11
STX5-208	ENST00000492066	ABCC9	O60706	1549 aa		38.95	■■■■□ 3.83
STX5-208	ENST00000492066	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.75	■■■■□ 3.79
STX5-208	ENST00000492066	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		38.26	■■■■□ 3.72
STX5-208	ENST00000492066	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.24	■■■■□ 3.71
STX5-208	ENST00000492066	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.04	■■■■□ 3.68
STX5-208	ENST00000492066	NACAD	O15069	1562 aa		38	■■■■□ 3.67
STX5-208	ENST00000492066	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.83	■■■■□ 3.65
STX5-208	ENST00000492066	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.3	■■■■□ 3.56
STX5-208	ENST00000492066	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.21	■■■■□ 3.55
STX5-208	ENST00000492066	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.17	■■■■□ 3.54
STX5-208	ENST00000492066	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.74	■■■■□ 3.47
STX5-208	ENST00000492066	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.55	■■■■□ 3.44
STX5-208	ENST00000492066	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.98	■■■■□ 3.35
STX5-208	ENST00000492066	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.77	■■■■□ 3.32
STX5-208	ENST00000492066	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.73	■■■■□ 3.31
STX5-208	ENST00000492066	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.72	■■■■□ 3.31
STX5-208	ENST00000492066	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.65	■■■■□ 3.3
STX5-208	ENST00000492066	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.61	■■■■□ 3.29
STX5-208	ENST00000492066	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.44	■■■■□ 3.26
STX5-208	ENST00000492066	WIZ	O95785	1651 aa		35.43	■■■■□ 3.26
STX5-208	ENST00000492066	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.32	■■■■□ 3.24
STX5-208	ENST00000492066	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.29	■■■■□ 3.24
STX5-208	ENST00000492066	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.24	■■■■□ 3.23
STX5-208	ENST00000492066	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.23	■■■■□ 3.23
STX5-208	ENST00000492066	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.04	■■■■□ 3.2
STX5-208	ENST00000492066	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	35.03	■■■■□ 3.2
STX5-208	ENST00000492066	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35	■■■■□ 3.19
STX5-208	ENST00000492066	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.99	■■■■□ 3.19
STX5-208	ENST00000492066	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		34.89	■■■■□ 3.18
STX5-208	ENST00000492066	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.62	■■■■□ 3.13
STX5-208	ENST00000492066	CFTR	P13569	1480 aa		34.09	■■■■□ 3.05
STX5-208	ENST00000492066	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.07	■■■■□ 3.04
STX5-208	ENST00000492066	PRDM2	Q13029	1718 aa		34.05	■■■■□ 3.04
STX5-208	ENST00000492066	NES	P48681	1621 aa		34.03	■■■■□ 3.04
STX5-208	ENST00000492066	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.99	■■■■□ 3.03
STX5-208	ENST00000492066	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.72	■■■□□ 2.99
STX5-208	ENST00000492066	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.71	■■■□□ 2.99
STX5-208	ENST00000492066	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.7	■■■□□ 2.98
STX5-208	ENST00000492066	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.68	■■■□□ 2.98
STX5-208	ENST00000492066	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.64	■■■□□ 2.98
STX5-208	ENST00000492066	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.58	■■■□□ 2.97
STX5-208	ENST00000492066	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.52	■■■□□ 2.96
STX5-208	ENST00000492066	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.49	■■■□□ 2.95
STX5-208	ENST00000492066	CUX1	P39880	1505 aa		33.45	■■■□□ 2.95
STX5-208	ENST00000492066	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.44	■■■□□ 2.94
STX5-208	ENST00000492066	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.41	■■■□□ 2.94
STX5-208	ENST00000492066	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.4	■■■□□ 2.94
STX5-208	ENST00000492066	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
STX5-208	ENST00000492066	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.36	■■■□□ 2.93
STX5-208	ENST00000492066	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.35	■■■□□ 2.93
STX5-208	ENST00000492066	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.33	■■■□□ 2.93
STX5-208	ENST00000492066	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.31	■■■□□ 2.92
STX5-208	ENST00000492066	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
STX5-208	ENST00000492066	WDR62	O43379	1518 aa		33.21	■■■□□ 2.91
STX5-208	ENST00000492066	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		33.16	■■■□□ 2.9
STX5-208	ENST00000492066	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
STX5-208	ENST00000492066	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.97	■■■□□ 2.87
STX5-208	ENST00000492066	CUX2	O14529	1486 aa		32.94	■■■□□ 2.86
STX5-208	ENST00000492066	SOGA1	O94964	1423 aa		32.93	■■■□□ 2.86
STX5-208	ENST00000492066	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.91	■■■□□ 2.86
STX5-208	ENST00000492066	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
STX5-208	ENST00000492066	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.85	■■■□□ 2.85
STX5-208	ENST00000492066	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.85	■■■□□ 2.85
STX5-208	ENST00000492066	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.81	■■■□□ 2.84
STX5-208	ENST00000492066	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
STX5-208	ENST00000492066	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.71	■■■□□ 2.83
STX5-208	ENST00000492066	EEA1	Q15075	1411 aa		32.7	■■■□□ 2.83
STX5-208	ENST00000492066	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.7	■■■□□ 2.82
STX5-208	ENST00000492066	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
STX5-208	ENST00000492066	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
STX5-208	ENST00000492066	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
STX5-208	ENST00000492066	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81	7e-7	■■■□□ 17.8
STX5-208	ENST00000492066	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.58	■■■□□ 2.81
STX5-208	ENST00000492066	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.56	■■■□□ 2.8
STX5-208	ENST00000492066	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.54	■■■□□ 2.8
STX5-208	ENST00000492066	IGF1R	P08069	1367 aa		32.49	■■■□□ 2.79
STX5-208	ENST00000492066	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.46	■■■□□ 2.79
STX5-208	ENST00000492066	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.43	■■■□□ 2.78
STX5-208	ENST00000492066	CUL7	Q14999	1698 aa		32.39	■■■□□ 2.78
STX5-208	ENST00000492066	KIF21B	O75037	1637 aa		32.39	■■■□□ 2.78
STX5-208	ENST00000492066	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STX5-208	ENST00000492066	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.32	■■■□□ 2.76
STX5-208	ENST00000492066	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.3	■■■□□ 2.76
STX5-208	ENST00000492066	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.3	■■■□□ 2.76
STX5-208	ENST00000492066	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.3	■■■□□ 2.76
STX5-208	ENST00000492066	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.29	■■■□□ 2.76
STX5-208	ENST00000492066	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.28	■■■□□ 2.76
STX5-208	ENST00000492066	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.24	■■■□□ 2.75
STX5-208	ENST00000492066	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
STX5-208	ENST00000492066	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STX5-208	ENST00000492066	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.11	■■■□□ 2.73
STX5-208	ENST00000492066	CHD1	O14646	1710 aa		32.06	■■■□□ 2.72
STX5-208	ENST00000492066	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
STX5-208	ENST00000492066	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.04	■■■□□ 2.72
STX5-208	ENST00000492066	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.99	■■■□□ 2.71
STX5-208	ENST00000492066	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		31.99	■■■□□ 2.71
STX5-208	ENST00000492066	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
STX5-208	ENST00000492066	FBLN2	P98095	1184 aa		31.96	■■■□□ 2.71

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