RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491597.5

MME-210, Transcript of membrane metalloendopeptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MME, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MME-210ENST00000491597 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.06■■■□□ 2.88
MME-210ENST00000491597 ABCC9O60706 1549 aa30.71■■■□□ 2.51
MME-210ENST00000491597 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.98■■■□□ 2.39
MME-210ENST00000491597 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.38■■■□□ 2.29
MME-210ENST00000491597 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.88■■■□□ 2.21
MME-210ENST00000491597 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
MME-210ENST00000491597 NACADO15069 1562 aa28.49■■■□□ 2.15
MME-210ENST00000491597 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
MME-210ENST00000491597 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.28■■■□□ 2.12
MME-210ENST00000491597 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.28■■■□□ 2.12
MME-210ENST00000491597 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.07■■■□□ 2.08
MME-210ENST00000491597 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.82■■■□□ 2.04
MME-210ENST00000491597 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.71■■■□□ 2.03
MME-210ENST00000491597 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.7■■■□□ 2.02
MME-210ENST00000491597 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.56■■■□□ 2
MME-210ENST00000491597 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.46■■□□□ 1.99
MME-210ENST00000491597 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
MME-210ENST00000491597 SCRIBQ14160 1630 aa27.34■■□□□ 1.97
MME-210ENST00000491597 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
MME-210ENST00000491597 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.21■■□□□ 1.95
MME-210ENST00000491597 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.21■■□□□ 1.95
MME-210ENST00000491597 CUX2O14529 1486 aa26.7■■□□□ 1.87
MME-210ENST00000491597 ERCC6Q03468 1493 aa26.56■■□□□ 1.84
MME-210ENST00000491597 NCAPD3P42695 1498 aa26.29■■□□□ 1.8
MME-210ENST00000491597 NESP48681 1621 aa26.17■■□□□ 1.78
MME-210ENST00000491597 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.15■■□□□ 1.78
MME-210ENST00000491597 TRIM41Q8WV44 630 aa26.07■■□□□ 1.76
MME-210ENST00000491597 HMGXB3Q12766 1538 aa26.06■■□□□ 1.76
MME-210ENST00000491597 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
MME-210ENST00000491597 SMARCA2P51531 1590 aa26.03■■□□□ 1.76
MME-210ENST00000491597 SMARCA4P51532 1647 aa25.97■■□□□ 1.75
MME-210ENST00000491597 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MME-210ENST00000491597 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
MME-210ENST00000491597 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.84■■□□□ 1.73
MME-210ENST00000491597 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
MME-210ENST00000491597 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.71■■□□□ 1.71
MME-210ENST00000491597 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.67■■□□□ 1.7
MME-210ENST00000491597 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.55■■□□□ 1.68
MME-210ENST00000491597 WDR62O43379 1518 aa25.5■■□□□ 1.67
MME-210ENST00000491597 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.48■■□□□ 1.67
MME-210ENST00000491597 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.48■■□□□ 1.67
MME-210ENST00000491597 OSCARQ8IYS5 282 aa25.36■■□□□ 1.65
MME-210ENST00000491597 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.32■■□□□ 1.64
MME-210ENST00000491597 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.22■■□□□ 1.63
MME-210ENST00000491597 WIZO95785 1651 aa25.18■■□□□ 1.62
MME-210ENST00000491597 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
MME-210ENST00000491597 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
MME-210ENST00000491597 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.16■■□□□ 1.62
MME-210ENST00000491597 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
MME-210ENST00000491597 CFTRP13569 1480 aa25.03■■□□□ 1.6
MME-210ENST00000491597 ARHGEF11O15085 1522 aa24.99■■□□□ 1.59
MME-210ENST00000491597 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
MME-210ENST00000491597 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.85■■□□□ 1.57
MME-210ENST00000491597 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
MME-210ENST00000491597 IFT140Q96RY7 1462 aa24.82■■□□□ 1.56
MME-210ENST00000491597 PRDM2Q13029 1718 aa24.8■■□□□ 1.56
MME-210ENST00000491597 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
MME-210ENST00000491597 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
MME-210ENST00000491597 ARAP1Q96P48 1450 aa24.7■■□□□ 1.54
MME-210ENST00000491597 CHD1O14646 1710 aa24.69■■□□□ 1.54
MME-210ENST00000491597 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
MME-210ENST00000491597 TOPBP1Q92547 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
MME-210ENST00000491597 FBLN2P98095 1184 aa24.58■■□□□ 1.53
MME-210ENST00000491597 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
MME-210ENST00000491597 ABCC8Q09428 1581 aa24.52■■□□□ 1.52
MME-210ENST00000491597 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.52■■□□□ 1.52
MME-210ENST00000491597 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.51■■□□□ 1.51
MME-210ENST00000491597 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
MME-210ENST00000491597 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
MME-210ENST00000491597 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
MME-210ENST00000491597 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.34■■□□□ 1.49
MME-210ENST00000491597 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.32■■□□□ 1.48
MME-210ENST00000491597 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.3■■□□□ 1.48
MME-210ENST00000491597 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
MME-210ENST00000491597 SYNJ1O43426 1573 aa24.28■■□□□ 1.48
MME-210ENST00000491597 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
MME-210ENST00000491597 SOGA1O94964 1423 aa24.24■■□□□ 1.47
MME-210ENST00000491597 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
MME-210ENST00000491597 WDR97A6NE52 1622 aa24.17■■□□□ 1.46
MME-210ENST00000491597 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.14■■□□□ 1.46
MME-210ENST00000491597 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.13■■□□□ 1.45
MME-210ENST00000491597 SYNJ2O15056 1496 aa24.11■■□□□ 1.45
MME-210ENST00000491597 GRIN2BQ13224 1484 aa24.1■■□□□ 1.45
MME-210ENST00000491597 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
MME-210ENST00000491597 PBRM1Q86U86 1689 aa24.02■■□□□ 1.44
MME-210ENST00000491597 CUX1P39880 1505 aa23.99■■□□□ 1.43
MME-210ENST00000491597 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.94■■□□□ 1.42
MME-210ENST00000491597 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.84■■□□□ 1.41
MME-210ENST00000491597 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.84■■□□□ 1.41
MME-210ENST00000491597 CEP170Q5SW79 1584 aa23.82■■□□□ 1.4
MME-210ENST00000491597 GRIN2AQ12879 1464 aa23.8■■□□□ 1.4
MME-210ENST00000491597 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.79■■□□□ 1.4
MME-210ENST00000491597 ADAMTS12P58397 1594 aa23.73■■□□□ 1.39
MME-210ENST00000491597 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
MME-210ENST00000491597 NUP160Q12769 1436 aa23.72■■□□□ 1.39
MME-210ENST00000491597 SHROOM2Q13796 1616 aa23.71■■□□□ 1.39
MME-210ENST00000491597 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.62■■□□□ 1.37
MME-210ENST00000491597 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
MME-210ENST00000491597 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.59■■□□□ 1.37
MME-210ENST00000491597 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms