RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491426.3

PDE4DIP-216, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4DIP, Length 670 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-216ENST00000491426 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.68■■■□□ 2.5
PDE4DIP-216ENST00000491426 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.01■■□□□ 1.92
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCC9O60706 1549 aa25.79■■□□□ 1.72
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PDE4DIP-216ENST00000491426 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.45■■□□□ 1.66
PDE4DIP-216ENST00000491426 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.44■■□□□ 1.66
PDE4DIP-216ENST00000491426 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIP-216ENST00000491426 NACADO15069 1562 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIP-216ENST00000491426 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.14■■□□□ 1.62
PDE4DIP-216ENST00000491426 SCRIBQ14160 1630 aa24.66■■□□□ 1.54
PDE4DIP-216ENST00000491426 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.61■■□□□ 1.53
PDE4DIP-216ENST00000491426 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.5■■□□□ 1.51
PDE4DIP-216ENST00000491426 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.28■■□□□ 1.48
PDE4DIP-216ENST00000491426 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
PDE4DIP-216ENST00000491426 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.79■■□□□ 1.4
PDE4DIP-216ENST00000491426 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PDE4DIP-216ENST00000491426 SMARCA4P51532 1647 aa23.66■■□□□ 1.38
PDE4DIP-216ENST00000491426 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.63■■□□□ 1.37
PDE4DIP-216ENST00000491426 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PDE4DIP-216ENST00000491426 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PDE4DIP-216ENST00000491426 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIP-216ENST00000491426 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4DIP-216ENST00000491426 SMARCA2P51531 1590 aa23.43■■□□□ 1.34
PDE4DIP-216ENST00000491426 WIZO95785 1651 aa23.41■■□□□ 1.34
PDE4DIP-216ENST00000491426 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4DIP-216ENST00000491426 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4DIP-216ENST00000491426 NCAPD3P42695 1498 aa23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIP-216ENST00000491426 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIP-216ENST00000491426 HMGXB3Q12766 1538 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIP-216ENST00000491426 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIP-216ENST00000491426 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.06■■□□□ 1.28
PDE4DIP-216ENST00000491426 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.95■■□□□ 1.26
PDE4DIP-216ENST00000491426 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
PDE4DIP-216ENST00000491426 CFTRP13569 1480 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE4DIP-216ENST00000491426 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIP-216ENST00000491426 PRDM2Q13029 1718 aa22.52■■□□□ 1.2
PDE4DIP-216ENST00000491426 NESP48681 1621 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE4DIP-216ENST00000491426 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.45■■□□□ 1.18
PDE4DIP-216ENST00000491426 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.39■■□□□ 1.17
PDE4DIP-216ENST00000491426 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.32■■□□□ 1.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCC8Q09428 1581 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 ERCC6Q03468 1493 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 TRIM41Q8WV44 630 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4DIP-216ENST00000491426 TOP2BQ02880 1626 aa22.14■■□□□ 1.14
PDE4DIP-216ENST00000491426 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIP-216ENST00000491426 CUX1P39880 1505 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIP-216ENST00000491426 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4DIP-216ENST00000491426 SYNJ1O43426 1573 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIP-216ENST00000491426 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.12■■□□□ 1.13
PDE4DIP-216ENST00000491426 TOPBP1Q92547 1522 aa22.09■■□□□ 1.13
PDE4DIP-216ENST00000491426 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDE4DIP-216ENST00000491426 WDR62O43379 1518 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4DIP-216ENST00000491426 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PDE4DIP-216ENST00000491426 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIP-216ENST00000491426 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PDE4DIP-216ENST00000491426 SOGA1O94964 1423 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4DIP-216ENST00000491426 IFT140Q96RY7 1462 aa21.83■■□□□ 1.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 EEA1Q15075 1411 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 CUX2O14529 1486 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIF27Q86VH2 1401 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PDE4DIP-216ENST00000491426 WDR97A6NE52 1622 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PDE4DIP-216ENST00000491426 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4DIP-216ENST00000491426 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4DIP-216ENST00000491426 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PDE4DIP-216ENST00000491426 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.64■■□□□ 1.06
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PDE4DIP-216ENST00000491426 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
PDE4DIP-216ENST00000491426 IGF1RP08069 1367 aa21.59■■□□□ 1.05
PDE4DIP-216ENST00000491426 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE4DIP-216ENST00000491426 GRIN2BQ13224 1484 aa21.57■■□□□ 1.04
PDE4DIP-216ENST00000491426 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PDE4DIP-216ENST00000491426 PBRM1Q86U86 1689 aa21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIP-216ENST00000491426 CUL7Q14999 1698 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIP-216ENST00000491426 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4DIP-216ENST00000491426 PRXQ9BXM0 1461 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIF21BO75037 1637 aa21.48■■□□□ 1.03
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PDE4DIP-216ENST00000491426 GOLGA3Q08378 1498 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4DIP-216ENST00000491426 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4DIP-216ENST00000491426 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4DIP-216ENST00000491426 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.41■■□□□ 1.02
PDE4DIP-216ENST00000491426 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIP-216ENST00000491426 ADAMTS12P58397 1594 aa21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIP-216ENST00000491426 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIP-216ENST00000491426 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.35■■□□□ 1.01
PDE4DIP-216ENST00000491426 SYNJ2O15056 1496 aa21.34■■□□□ 1.01
PDE4DIP-216ENST00000491426 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PDE4DIP-216ENST00000491426 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.29■■□□□ 1
PDE4DIP-216ENST00000491426 GRIN2AQ12879 1464 aa21.27■■□□□ 1
PDE4DIP-216ENST00000491426 FBLN2P98095 1184 aa21.27■■□□□ 1
PDE4DIP-216ENST00000491426 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4DIP-216ENST00000491426 CHD1O14646 1710 aa21.17■□□□□ 0.98
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