RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490146.5

LRRC71-204, Transcript of leucine rich repeat containing 71, humanhuman

TSL 2

Gene LRRC71, Length 1,903 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71-204ENST00000490146 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.8■■■□□ 2.52
LRRC71-204ENST00000490146 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.71■■□□□ 1.87
LRRC71-204ENST00000490146 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
LRRC71-204ENST00000490146 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.67■■□□□ 1.7
LRRC71-204ENST00000490146 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
LRRC71-204ENST00000490146 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.35■■□□□ 1.65
LRRC71-204ENST00000490146 ABCC9O60706 1549 aa25.34■■□□□ 1.65
LRRC71-204ENST00000490146 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
LRRC71-204ENST00000490146 NACADO15069 1562 aa24.86■■□□□ 1.57
LRRC71-204ENST00000490146 SCRIBQ14160 1630 aa24.76■■□□□ 1.55
LRRC71-204ENST00000490146 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.65■■□□□ 1.54
LRRC71-204ENST00000490146 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
LRRC71-204ENST00000490146 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.25■■□□□ 1.47
LRRC71-204ENST00000490146 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.01■■□□□ 1.43
LRRC71-204ENST00000490146 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
LRRC71-204ENST00000490146 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
LRRC71-204ENST00000490146 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.95■■□□□ 1.42
LRRC71-204ENST00000490146 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.87■■□□□ 1.41
LRRC71-204ENST00000490146 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
LRRC71-204ENST00000490146 WIZO95785 1651 aa23.71■■□□□ 1.39
LRRC71-204ENST00000490146 SMARCA4P51532 1647 aa23.66■■□□□ 1.38
LRRC71-204ENST00000490146 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.49■■□□□ 1.35
LRRC71-204ENST00000490146 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
LRRC71-204ENST00000490146 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.28■■□□□ 1.32
LRRC71-204ENST00000490146 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.23■■□□□ 1.31
LRRC71-204ENST00000490146 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LRRC71-204ENST00000490146 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.19■■□□□ 1.3
LRRC71-204ENST00000490146 SMARCA2P51531 1590 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC71-204ENST00000490146 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
LRRC71-204ENST00000490146 TRIM41Q8WV44 630 aa23.01■■□□□ 1.27
LRRC71-204ENST00000490146 NCAPD3P42695 1498 aa22.96■■□□□ 1.27
LRRC71-204ENST00000490146 HMGXB3Q12766 1538 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRC71-204ENST00000490146 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.87■■□□□ 1.25
LRRC71-204ENST00000490146 ABCC8Q09428 1581 aa22.83■■□□□ 1.24
LRRC71-204ENST00000490146 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC71-204ENST00000490146 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
LRRC71-204ENST00000490146 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
LRRC71-204ENST00000490146 CFTRP13569 1480 aa22.52■■□□□ 1.2
LRRC71-204ENST00000490146 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRC71-204ENST00000490146 SYNJ1O43426 1573 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRC71-204ENST00000490146 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.44■■□□□ 1.18
LRRC71-204ENST00000490146 SOGA1O94964 1423 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRC71-204ENST00000490146 PRDM2Q13029 1718 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC71-204ENST00000490146 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.39■■□□□ 1.18
LRRC71-204ENST00000490146 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRC71-204ENST00000490146 TOP2BQ02880 1626 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRC71-204ENST00000490146 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRC71-204ENST00000490146 NESP48681 1621 aa22.29■■□□□ 1.16
LRRC71-204ENST00000490146 CUX1P39880 1505 aa22.29■■□□□ 1.16
LRRC71-204ENST00000490146 EEA1Q15075 1411 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRC71-204ENST00000490146 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRC71-204ENST00000490146 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRC71-204ENST00000490146 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRC71-204ENST00000490146 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LRRC71-204ENST00000490146 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.04■■□□□ 1.12
LRRC71-204ENST00000490146 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.03■■□□□ 1.12
LRRC71-204ENST00000490146 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.02■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 GOLGA3Q08378 1498 aa22.01■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.99■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 TOPBP1Q92547 1522 aa21.98■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 KIF21BO75037 1637 aa21.98■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 KIF27Q86VH2 1401 aa21.97■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.96■■□□□ 1.11
LRRC71-204ENST00000490146 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LRRC71-204ENST00000490146 CUX2O14529 1486 aa21.93■■□□□ 1.1
LRRC71-204ENST00000490146 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.92■■□□□ 1.1
LRRC71-204ENST00000490146 CEP162Q5TB80 1403 aa21.91■■□□□ 1.1
LRRC71-204ENST00000490146 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
LRRC71-204ENST00000490146 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.89■■□□□ 1.09
LRRC71-204ENST00000490146 PRXQ9BXM0 1461 aa21.84■■□□□ 1.09
LRRC71-204ENST00000490146 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.82■■□□□ 1.08
LRRC71-204ENST00000490146 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC71-204ENST00000490146 IGF1RP08069 1367 aa21.78■■□□□ 1.08
LRRC71-204ENST00000490146 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LRRC71-204ENST00000490146 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.77■■□□□ 1.08
LRRC71-204ENST00000490146 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.73■■□□□ 1.07
LRRC71-204ENST00000490146 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LRRC71-204ENST00000490146 CLIP1P30622 1438 aa21.7■■□□□ 1.06
LRRC71-204ENST00000490146 WDR97A6NE52 1622 aa21.7■■□□□ 1.06
LRRC71-204ENST00000490146 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.69■■□□□ 1.06
LRRC71-204ENST00000490146 ERCC6Q03468 1493 aa21.68■■□□□ 1.06
LRRC71-204ENST00000490146 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
LRRC71-204ENST00000490146 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
LRRC71-204ENST00000490146 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LRRC71-204ENST00000490146 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.6■■□□□ 1.05
LRRC71-204ENST00000490146 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC71-204ENST00000490146 WDR62O43379 1518 aa21.59■■□□□ 1.05
LRRC71-204ENST00000490146 CUL7Q14999 1698 aa21.54■■□□□ 1.04
LRRC71-204ENST00000490146 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LRRC71-204ENST00000490146 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
LRRC71-204ENST00000490146 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
LRRC71-204ENST00000490146 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.49■■□□□ 1.03
LRRC71-204ENST00000490146 IFT140Q96RY7 1462 aa21.47■■□□□ 1.03
LRRC71-204ENST00000490146 PBRM1Q86U86 1689 aa21.46■■□□□ 1.03
LRRC71-204ENST00000490146 ARAP1Q96P48 1450 aa21.45■■□□□ 1.02
LRRC71-204ENST00000490146 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
LRRC71-204ENST00000490146 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.43■■□□□ 1.02
LRRC71-204ENST00000490146 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.38■■□□□ 1.01
LRRC71-204ENST00000490146 APLP2Q06481 763 aa21.37■■□□□ 1.01
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