RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489517.1

PRRT4-204, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene PRRT4, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-204ENST00000489517 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.95■■■■■ 7.51
PRRT4-204ENST00000489517 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.87■■■■■ 6.21
PRRT4-204ENST00000489517 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.08■■■■■ 5.93
PRRT4-204ENST00000489517 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.27■■■■■ 5.8
PRRT4-204ENST00000489517 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.22■■■■■ 5.79
PRRT4-204ENST00000489517 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.8■■■■■ 5.72
PRRT4-204ENST00000489517 ABCC9O60706 1549 aa50.77■■■■■ 5.72
PRRT4-204ENST00000489517 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.52■■■■■ 5.68
PRRT4-204ENST00000489517 NACADO15069 1562 aa50.17■■■■■ 5.62
PRRT4-204ENST00000489517 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.69■■■■■ 5.55
PRRT4-204ENST00000489517 SCRIBQ14160 1630 aa49.61■■■■■ 5.53
PRRT4-204ENST00000489517 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
PRRT4-204ENST00000489517 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.53■■■■■ 5.36
PRRT4-204ENST00000489517 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.17■■■■■ 5.3
PRRT4-204ENST00000489517 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.09■■■■■ 5.29
PRRT4-204ENST00000489517 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.07■■■■■ 5.29
PRRT4-204ENST00000489517 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.97■■■■■ 5.27
PRRT4-204ENST00000489517 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
PRRT4-204ENST00000489517 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.85■■■■■ 5.25
PRRT4-204ENST00000489517 SMARCA4P51532 1647 aa47.55■■■■■ 5.2
PRRT4-204ENST00000489517 WIZO95785 1651 aa47.46■■■■■ 5.19
PRRT4-204ENST00000489517 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.05■■■■■ 5.12
PRRT4-204ENST00000489517 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
PRRT4-204ENST00000489517 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.94■■■■■ 5.1
PRRT4-204ENST00000489517 SMARCA2P51531 1590 aa46.75■■■■■ 5.07
PRRT4-204ENST00000489517 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.73■■■■■ 5.07
PRRT4-204ENST00000489517 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
PRRT4-204ENST00000489517 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.55■■■■■ 5.04
PRRT4-204ENST00000489517 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
PRRT4-204ENST00000489517 NCAPD3P42695 1498 aa46.29■■■■■ 5
PRRT4-204ENST00000489517 HMGXB3Q12766 1538 aa46.24■■■■■ 4.99
PRRT4-204ENST00000489517 TRIM41Q8WV44 630 aa46.15■■■■■ 4.98
PRRT4-204ENST00000489517 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.91■■■■■ 4.94
PRRT4-204ENST00000489517 ABCC8Q09428 1581 aa45.63■■■■■ 4.89
PRRT4-204ENST00000489517 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.39■■■■■ 4.86
PRRT4-204ENST00000489517 CFTRP13569 1480 aa45.34■■■■■ 4.85
PRRT4-204ENST00000489517 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
PRRT4-204ENST00000489517 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.26■■■■■ 4.84
PRRT4-204ENST00000489517 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.17■■■■■ 4.82
PRRT4-204ENST00000489517 SYNJ1O43426 1573 aa45.1■■■■■ 4.81
PRRT4-204ENST00000489517 PRDM2Q13029 1718 aa45.04■■■■■ 4.8
PRRT4-204ENST00000489517 TOP2BQ02880 1626 aa44.93■■■■■ 4.78
PRRT4-204ENST00000489517 EEA1Q15075 1411 aa44.93■■■■■ 4.78
PRRT4-204ENST00000489517 SOGA1O94964 1423 aa44.87■■■■■ 4.77
PRRT4-204ENST00000489517 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.85■■■■■ 4.77
PRRT4-204ENST00000489517 CUX1P39880 1505 aa44.73■■■■■ 4.75
PRRT4-204ENST00000489517 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.68■■■■■ 4.74
PRRT4-204ENST00000489517 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.66■■■■■ 4.74
PRRT4-204ENST00000489517 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.66■■■■■ 4.74
PRRT4-204ENST00000489517 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.64■■■■■ 4.74
PRRT4-204ENST00000489517 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.63■■■■■ 4.74
PRRT4-204ENST00000489517 NESP48681 1621 aa44.61■■■■■ 4.73
PRRT4-204ENST00000489517 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.6■■■■■ 4.73
PRRT4-204ENST00000489517 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.41■■■■■ 4.7
PRRT4-204ENST00000489517 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.37■■■■■ 4.69
PRRT4-204ENST00000489517 GOLGA3Q08378 1498 aa44.3■■■■■ 4.68
PRRT4-204ENST00000489517 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.29■■■■■ 4.68
PRRT4-204ENST00000489517 KIF27Q86VH2 1401 aa44.26■■■■■ 4.68
PRRT4-204ENST00000489517 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.24■■■■■ 4.67
PRRT4-204ENST00000489517 KIF21BO75037 1637 aa44.24■■■■■ 4.67
PRRT4-204ENST00000489517 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.2■■■■■ 4.67
PRRT4-204ENST00000489517 TOPBP1Q92547 1522 aa44.18■■■■■ 4.66
PRRT4-204ENST00000489517 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
PRRT4-204ENST00000489517 CUX2O14529 1486 aa44.05■■■■■ 4.64
PRRT4-204ENST00000489517 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.04■■■■■ 4.64
PRRT4-204ENST00000489517 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
PRRT4-204ENST00000489517 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
PRRT4-204ENST00000489517 CEP162Q5TB80 1403 aa43.96■■■■■ 4.63
PRRT4-204ENST00000489517 PRXQ9BXM0 1461 aa43.94■■■■■ 4.62
PRRT4-204ENST00000489517 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.94■■■■■ 4.62
PRRT4-204ENST00000489517 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.91■■■■■ 4.62
PRRT4-204ENST00000489517 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.86■■■■■ 4.61
PRRT4-204ENST00000489517 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.84■■■■■ 4.61
PRRT4-204ENST00000489517 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.78■■■■■ 4.6
PRRT4-204ENST00000489517 IGF1RP08069 1367 aa43.78■■■■■ 4.6
PRRT4-204ENST00000489517 CLIP1P30622 1438 aa43.61■■■■■ 4.57
PRRT4-204ENST00000489517 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.6■■■■■ 4.57
PRRT4-204ENST00000489517 ERCC6Q03468 1493 aa43.6■■■■■ 4.57
PRRT4-204ENST00000489517 WDR97A6NE52 1622 aa43.58■■■■■ 4.57
PRRT4-204ENST00000489517 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.53■■■■■ 4.56
PRRT4-204ENST00000489517 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
PRRT4-204ENST00000489517 WDR62O43379 1518 aa43.48■■■■■ 4.55
PRRT4-204ENST00000489517 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
PRRT4-204ENST00000489517 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
PRRT4-204ENST00000489517 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.42■■■■■ 4.54
PRRT4-204ENST00000489517 CUL7Q14999 1698 aa43.41■■■■■ 4.54
PRRT4-204ENST00000489517 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.41■■■■■ 4.54
PRRT4-204ENST00000489517 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
PRRT4-204ENST00000489517 IFT140Q96RY7 1462 aa43.3■■■■■ 4.52
PRRT4-204ENST00000489517 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
PRRT4-204ENST00000489517 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.23■■■■■ 4.51
PRRT4-204ENST00000489517 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
PRRT4-204ENST00000489517 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.49
PRRT4-204ENST00000489517 PBRM1Q86U86 1689 aa43.06■■■■■ 4.48
PRRT4-204ENST00000489517 ARAP1Q96P48 1450 aa43.06■■■■■ 4.48
PRRT4-204ENST00000489517 GRIN2BQ13224 1484 aa43.04■■■■■ 4.48
PRRT4-204ENST00000489517 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.02■■■■■ 4.48
PRRT4-204ENST00000489517 APLP2Q06481 763 aa43.01■■■■■ 4.48
PRRT4-204ENST00000489517 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
PRRT4-204ENST00000489517 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.96■■■■■ 4.47
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