RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488797.1

PSIP1-210, Transcript of PC4 and SFRS1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PSIP1, Length 736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSIP1-210ENST00000488797 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.12■■■■■ 6.09
PSIP1-210ENST00000488797 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.34■■■■■ 5.17
PSIP1-210ENST00000488797 ABCC9O60706 1549 aa46.79■■■■■ 5.08
PSIP1-210ENST00000488797 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.74■■■■■ 4.75
PSIP1-210ENST00000488797 NACADO15069 1562 aa44.59■■■■■ 4.73
PSIP1-210ENST00000488797 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.56■■■■■ 4.72
PSIP1-210ENST00000488797 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
PSIP1-210ENST00000488797 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.17■■■■■ 4.66
PSIP1-210ENST00000488797 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.87■■■■■ 4.61
PSIP1-210ENST00000488797 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.82■■■■■ 4.6
PSIP1-210ENST00000488797 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.69■■■■■ 4.58
PSIP1-210ENST00000488797 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.51■■■■■ 4.56
PSIP1-210ENST00000488797 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.37■■■■■ 4.53
PSIP1-210ENST00000488797 SCRIBQ14160 1630 aa43.26■■■■■ 4.52
PSIP1-210ENST00000488797 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.88■■■■■ 4.46
PSIP1-210ENST00000488797 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
PSIP1-210ENST00000488797 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.28■■■■■ 4.36
PSIP1-210ENST00000488797 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.04■■■■■ 4.32
PSIP1-210ENST00000488797 SMARCA4P51532 1647 aa41.31■■■■■ 4.2
PSIP1-210ENST00000488797 NCAPD3P42695 1498 aa41.18■■■■■ 4.18
PSIP1-210ENST00000488797 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.18■■■■■ 4.18
PSIP1-210ENST00000488797 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
PSIP1-210ENST00000488797 SMARCA2P51531 1590 aa41.05■■■■■ 4.16
PSIP1-210ENST00000488797 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.99■■■■■ 4.15
PSIP1-210ENST00000488797 HMGXB3Q12766 1538 aa40.93■■■■■ 4.14
PSIP1-210ENST00000488797 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.87■■■■■ 4.13
PSIP1-210ENST00000488797 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
PSIP1-210ENST00000488797 WIZO95785 1651 aa40.53■■■■■ 4.08
PSIP1-210ENST00000488797 NESP48681 1621 aa40.42■■■■■ 4.06
PSIP1-210ENST00000488797 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
PSIP1-210ENST00000488797 ERCC6Q03468 1493 aa40.29■■■■■ 4.04
PSIP1-210ENST00000488797 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.13■■■■■ 4.01
PSIP1-210ENST00000488797 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
PSIP1-210ENST00000488797 CUX2O14529 1486 aa39.97■■■■□ 3.99
PSIP1-210ENST00000488797 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.97■■■■□ 3.99
PSIP1-210ENST00000488797 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.89■■■■□ 3.98
PSIP1-210ENST00000488797 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.86■■■■□ 3.97
PSIP1-210ENST00000488797 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
PSIP1-210ENST00000488797 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
PSIP1-210ENST00000488797 CFTRP13569 1480 aa39.66■■■■□ 3.94
PSIP1-210ENST00000488797 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.59■■■■□ 3.93
PSIP1-210ENST00000488797 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.53■■■■□ 3.92
PSIP1-210ENST00000488797 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.53■■■■□ 3.92
PSIP1-210ENST00000488797 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.49■■■■□ 3.91
PSIP1-210ENST00000488797 WDR62O43379 1518 aa39.42■■■■□ 3.9
PSIP1-210ENST00000488797 PRDM2Q13029 1718 aa39.29■■■■□ 3.88
PSIP1-210ENST00000488797 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.23■■■■□ 3.87
PSIP1-210ENST00000488797 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
PSIP1-210ENST00000488797 TOPBP1Q92547 1522 aa38.87■■■■□ 3.81
PSIP1-210ENST00000488797 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.77■■■■□ 3.8
PSIP1-210ENST00000488797 ABCC8Q09428 1581 aa38.73■■■■□ 3.79
PSIP1-210ENST00000488797 IFT140Q96RY7 1462 aa38.66■■■■□ 3.78
PSIP1-210ENST00000488797 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
PSIP1-210ENST00000488797 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
PSIP1-210ENST00000488797 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
PSIP1-210ENST00000488797 CUX1P39880 1505 aa38.47■■■■□ 3.75
PSIP1-210ENST00000488797 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
PSIP1-210ENST00000488797 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.41■■■■□ 3.74
PSIP1-210ENST00000488797 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.38■■■■□ 3.73
PSIP1-210ENST00000488797 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.35■■■■□ 3.734e-6■■■■□ 21.2
PSIP1-210ENST00000488797 SOGA1O94964 1423 aa38.33■■■■□ 3.73
PSIP1-210ENST00000488797 OSCARQ8IYS5 282 aa38.25■■■■□ 3.71
PSIP1-210ENST00000488797 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
PSIP1-210ENST00000488797 WDR97A6NE52 1622 aa38.08■■■■□ 3.69
PSIP1-210ENST00000488797 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.04■■■■□ 3.68
PSIP1-210ENST00000488797 SYNJ1O43426 1573 aa38.02■■■■□ 3.68
PSIP1-210ENST00000488797 CHD1O14646 1710 aa38.01■■■■□ 3.68
PSIP1-210ENST00000488797 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.99■■■■□ 3.67
PSIP1-210ENST00000488797 TOP2BQ02880 1626 aa37.98■■■■□ 3.67
PSIP1-210ENST00000488797 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.96■■■■□ 3.67
PSIP1-210ENST00000488797 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.95■■■■□ 3.67
PSIP1-210ENST00000488797 FBLN2P98095 1184 aa37.92■■■■□ 3.66
PSIP1-210ENST00000488797 GRIN2BQ13224 1484 aa37.9■■■■□ 3.66
PSIP1-210ENST00000488797 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.88■■■■□ 3.65
PSIP1-210ENST00000488797 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.86■■■■□ 3.65
PSIP1-210ENST00000488797 PBRM1Q86U86 1689 aa37.84■■■■□ 3.65
PSIP1-210ENST00000488797 TRIM41Q8WV44 630 aa37.83■■■■□ 3.65
PSIP1-210ENST00000488797 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
PSIP1-210ENST00000488797 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.76■■■■□ 3.63
PSIP1-210ENST00000488797 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.76■■■■□ 3.63
PSIP1-210ENST00000488797 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.76■■■■□ 3.63
PSIP1-210ENST00000488797 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PSIP1-210ENST00000488797 SYNJ2O15056 1496 aa37.71■■■■□ 3.63
PSIP1-210ENST00000488797 ARHGEF11O15085 1522 aa37.7■■■■□ 3.63
PSIP1-210ENST00000488797 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.59■■■■□ 3.61
PSIP1-210ENST00000488797 ADAMTS12P58397 1594 aa37.53■■■■□ 3.6
PSIP1-210ENST00000488797 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.46■■■■□ 3.59
PSIP1-210ENST00000488797 GRIN2AQ12879 1464 aa37.45■■■■□ 3.59
PSIP1-210ENST00000488797 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.41■■■■□ 3.58
PSIP1-210ENST00000488797 ARAP1Q96P48 1450 aa37.39■■■■□ 3.58
PSIP1-210ENST00000488797 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.37■■■■□ 3.57
PSIP1-210ENST00000488797 CEP170Q5SW79 1584 aa37.32■■■■□ 3.56
PSIP1-210ENST00000488797 NUP160Q12769 1436 aa37.29■■■■□ 3.56
PSIP1-210ENST00000488797 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.28■■■■□ 3.56
PSIP1-210ENST00000488797 KIF27Q86VH2 1401 aa37.23■■■■□ 3.55
PSIP1-210ENST00000488797 IGF1RP08069 1367 aa37.18■■■■□ 3.54
PSIP1-210ENST00000488797 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.12■■■■□ 3.53
PSIP1-210ENST00000488797 SHROOM2Q13796 1616 aa37.07■■■■□ 3.52
PSIP1-210ENST00000488797 CUL7Q14999 1698 aa37.04■■■■□ 3.52
PSIP1-210ENST00000488797 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms