RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486955.2

CTBP2-209, Transcript of C-terminal binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP2, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2-209ENST00000486955 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.28■■■■□ 3.4
CTBP2-209ENST00000486955 ABCC9O60706 1549 aa33.53■■■□□ 2.96
CTBP2-209ENST00000486955 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.85■■■□□ 2.85
CTBP2-209ENST00000486955 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.07■■■□□ 2.72
CTBP2-209ENST00000486955 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.62■■■□□ 2.65
CTBP2-209ENST00000486955 NACADO15069 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
CTBP2-209ENST00000486955 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
CTBP2-209ENST00000486955 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.01■■■□□ 2.55
CTBP2-209ENST00000486955 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.94■■■□□ 2.54
CTBP2-209ENST00000486955 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.71■■■□□ 2.51
CTBP2-209ENST00000486955 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.54■■■□□ 2.48
CTBP2-209ENST00000486955 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.27■■■□□ 2.44
CTBP2-209ENST00000486955 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.25■■■□□ 2.43
CTBP2-209ENST00000486955 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.19■■■□□ 2.42
CTBP2-209ENST00000486955 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
CTBP2-209ENST00000486955 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTBP2-209ENST00000486955 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP2-209ENST00000486955 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.96■■■□□ 2.39
CTBP2-209ENST00000486955 SCRIBQ14160 1630 aa29.89■■■□□ 2.37
CTBP2-209ENST00000486955 CUX2O14529 1486 aa29.17■■■□□ 2.26
CTBP2-209ENST00000486955 ERCC6Q03468 1493 aa29.01■■■□□ 2.23
CTBP2-209ENST00000486955 NCAPD3P42695 1498 aa28.84■■■□□ 2.21
CTBP2-209ENST00000486955 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.64■■■□□ 2.17
CTBP2-209ENST00000486955 NESP48681 1621 aa28.6■■■□□ 2.17
CTBP2-209ENST00000486955 SMARCA2P51531 1590 aa28.54■■■□□ 2.16
CTBP2-209ENST00000486955 HMGXB3Q12766 1538 aa28.53■■■□□ 2.16
CTBP2-209ENST00000486955 SMARCA4P51532 1647 aa28.44■■■□□ 2.14
CTBP2-209ENST00000486955 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CTBP2-209ENST00000486955 TRIM41Q8WV44 630 aa28.4■■■□□ 2.14
CTBP2-209ENST00000486955 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CTBP2-209ENST00000486955 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.3■■■□□ 2.12
CTBP2-209ENST00000486955 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.24■■■□□ 2.11
CTBP2-209ENST00000486955 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
CTBP2-209ENST00000486955 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.18■■■□□ 2.1
CTBP2-209ENST00000486955 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.16■■■□□ 2.1
CTBP2-209ENST00000486955 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.95■■■□□ 2.06
CTBP2-209ENST00000486955 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.94■■■□□ 2.06
CTBP2-209ENST00000486955 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.93■■■□□ 2.06
CTBP2-209ENST00000486955 WDR62O43379 1518 aa27.88■■■□□ 2.05
CTBP2-209ENST00000486955 OSCARQ8IYS5 282 aa27.79■■■□□ 2.04
CTBP2-209ENST00000486955 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.7■■■□□ 2.03
CTBP2-209ENST00000486955 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.61■■■□□ 2.01
CTBP2-209ENST00000486955 WIZO95785 1651 aa27.6■■■□□ 2.01
CTBP2-209ENST00000486955 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.45■■□□□ 1.99
CTBP2-209ENST00000486955 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.45■■□□□ 1.99
CTBP2-209ENST00000486955 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.45■■□□□ 1.99
CTBP2-209ENST00000486955 CFTRP13569 1480 aa27.45■■□□□ 1.99
CTBP2-209ENST00000486955 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CTBP2-209ENST00000486955 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CTBP2-209ENST00000486955 ARHGEF11O15085 1522 aa27.28■■□□□ 1.96
CTBP2-209ENST00000486955 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CTBP2-209ENST00000486955 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.19■■□□□ 1.94
CTBP2-209ENST00000486955 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CTBP2-209ENST00000486955 IFT140Q96RY7 1462 aa27.18■■□□□ 1.94
CTBP2-209ENST00000486955 PRDM2Q13029 1718 aa27.17■■□□□ 1.94
CTBP2-209ENST00000486955 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CTBP2-209ENST00000486955 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CTBP2-209ENST00000486955 TOPBP1Q92547 1522 aa27■■□□□ 1.91
CTBP2-209ENST00000486955 CHD1O14646 1710 aa26.98■■□□□ 1.91
CTBP2-209ENST00000486955 ARAP1Q96P48 1450 aa26.95■■□□□ 1.91
CTBP2-209ENST00000486955 ABCC8Q09428 1581 aa26.93■■□□□ 1.9
CTBP2-209ENST00000486955 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.91■■□□□ 1.9
CTBP2-209ENST00000486955 FBLN2P98095 1184 aa26.9■■□□□ 1.9
CTBP2-209ENST00000486955 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
CTBP2-209ENST00000486955 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CTBP2-209ENST00000486955 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.84■■□□□ 1.89
CTBP2-209ENST00000486955 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
CTBP2-209ENST00000486955 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CTBP2-209ENST00000486955 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.62■■□□□ 1.85
CTBP2-209ENST00000486955 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CTBP2-209ENST00000486955 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.6■■□□□ 1.85
CTBP2-209ENST00000486955 SOGA1O94964 1423 aa26.58■■□□□ 1.85
CTBP2-209ENST00000486955 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CTBP2-209ENST00000486955 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.55■■□□□ 1.84
CTBP2-209ENST00000486955 SYNJ1O43426 1573 aa26.55■■□□□ 1.84
CTBP2-209ENST00000486955 WDR97A6NE52 1622 aa26.5■■□□□ 1.83
CTBP2-209ENST00000486955 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CTBP2-209ENST00000486955 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.42■■□□□ 1.82
CTBP2-209ENST00000486955 SYNJ2O15056 1496 aa26.41■■□□□ 1.82
CTBP2-209ENST00000486955 GRIN2BQ13224 1484 aa26.41■■□□□ 1.82
CTBP2-209ENST00000486955 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CTBP2-209ENST00000486955 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.4■■□□□ 1.82
CTBP2-209ENST00000486955 CUX1P39880 1505 aa26.28■■□□□ 1.8
CTBP2-209ENST00000486955 PBRM1Q86U86 1689 aa26.28■■□□□ 1.8
CTBP2-209ENST00000486955 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.15■■□□□ 1.78
CTBP2-209ENST00000486955 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.09■■□□□ 1.77
CTBP2-209ENST00000486955 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.08■■□□□ 1.77
CTBP2-209ENST00000486955 GRIN2AQ12879 1464 aa26.06■■□□□ 1.76
CTBP2-209ENST00000486955 CEP170Q5SW79 1584 aa26.06■■□□□ 1.76
CTBP2-209ENST00000486955 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.05■■□□□ 1.76
CTBP2-209ENST00000486955 NUP160Q12769 1436 aa25.98■■□□□ 1.75
CTBP2-209ENST00000486955 SHROOM2Q13796 1616 aa25.96■■□□□ 1.75
CTBP2-209ENST00000486955 ADAMTS12P58397 1594 aa25.94■■□□□ 1.74
CTBP2-209ENST00000486955 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
CTBP2-209ENST00000486955 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
CTBP2-209ENST00000486955 TOP2BQ02880 1626 aa25.86■■□□□ 1.73
CTBP2-209ENST00000486955 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.85■■□□□ 1.73
CTBP2-209ENST00000486955 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.85■■□□□ 1.73
CTBP2-209ENST00000486955 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CTBP2-209ENST00000486955 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
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