RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.24■□□□□ 0.99
SORCS1-208ENST00000486192 ABCC9O60706 1549 aa19.06■□□□□ 0.64
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.79■□□□□ 0.6
SORCS1-208ENST00000486192 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.3■□□□□ 0.52
SORCS1-208ENST00000486192 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SORCS1-208ENST00000486192 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.83■□□□□ 0.45
SORCS1-208ENST00000486192 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SORCS1-208ENST00000486192 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
SORCS1-208ENST00000486192 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.69■□□□□ 0.42
SORCS1-208ENST00000486192 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.68■□□□□ 0.42
SORCS1-208ENST00000486192 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.67■□□□□ 0.42
SORCS1-208ENST00000486192 NACADO15069 1562 aa17.64■□□□□ 0.41
SORCS1-208ENST00000486192 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.57■□□□□ 0.4
SORCS1-208ENST00000486192 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.39■□□□□ 0.37
SORCS1-208ENST00000486192 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.16■□□□□ 0.34
SORCS1-208ENST00000486192 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.15■□□□□ 0.34
SORCS1-208ENST00000486192 SCRIBQ14160 1630 aa17.09■□□□□ 0.33
SORCS1-208ENST00000486192 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.99■□□□□ 0.31
SORCS1-208ENST00000486192 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.99■□□□□ 0.31
SORCS1-208ENST00000486192 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SORCS1-208ENST00000486192 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.84■□□□□ 0.29
SORCS1-208ENST00000486192 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SORCS1-208ENST00000486192 CUX2O14529 1486 aa16.43■□□□□ 0.22
SORCS1-208ENST00000486192 ERCC6Q03468 1493 aa16.43■□□□□ 0.22
SORCS1-208ENST00000486192 SMARCA4P51532 1647 aa16.41■□□□□ 0.22
SORCS1-208ENST00000486192 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.33■□□□□ 0.2
SORCS1-208ENST00000486192 SMARCA2P51531 1590 aa16.31■□□□□ 0.2
SORCS1-208ENST00000486192 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.3■□□□□ 0.2
SORCS1-208ENST00000486192 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.29■□□□□ 0.2
SORCS1-208ENST00000486192 NCAPD3P42695 1498 aa16.28■□□□□ 0.2
SORCS1-208ENST00000486192 NESP48681 1621 aa16.27■□□□□ 0.2
SORCS1-208ENST00000486192 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
SORCS1-208ENST00000486192 TRIM41Q8WV44 630 aa16.22■□□□□ 0.19
SORCS1-208ENST00000486192 HMGXB3Q12766 1538 aa16.22■□□□□ 0.19
SORCS1-208ENST00000486192 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SORCS1-208ENST00000486192 WIZO95785 1651 aa16.12■□□□□ 0.17
SORCS1-208ENST00000486192 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SORCS1-208ENST00000486192 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SORCS1-208ENST00000486192 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.04■□□□□ 0.16
SORCS1-208ENST00000486192 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SORCS1-208ENST00000486192 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.95■□□□□ 0.14
SORCS1-208ENST00000486192 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.87■□□□□ 0.13
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.84■□□□□ 0.13
SORCS1-208ENST00000486192 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.81■□□□□ 0.12
SORCS1-208ENST00000486192 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.78■□□□□ 0.12
SORCS1-208ENST00000486192 CFTRP13569 1480 aa15.77■□□□□ 0.11
SORCS1-208ENST00000486192 WDR62O43379 1518 aa15.74■□□□□ 0.11
SORCS1-208ENST00000486192 OSCARQ8IYS5 282 aa15.71■□□□□ 0.11
SORCS1-208ENST00000486192 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.65■□□□□ 0.1
SORCS1-208ENST00000486192 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.62■□□□□ 0.09
SORCS1-208ENST00000486192 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.58■□□□□ 0.09
SORCS1-208ENST00000486192 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.58■□□□□ 0.09
SORCS1-208ENST00000486192 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.58■□□□□ 0.09
SORCS1-208ENST00000486192 PRDM2Q13029 1718 aa15.57■□□□□ 0.08
SORCS1-208ENST00000486192 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SORCS1-208ENST00000486192 ABCC8Q09428 1581 aa15.46■□□□□ 0.07
SORCS1-208ENST00000486192 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.46■□□□□ 0.07
SORCS1-208ENST00000486192 ARHGEF11O15085 1522 aa15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SORCS1-208ENST00000486192 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SORCS1-208ENST00000486192 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.38■□□□□ 0.05
SORCS1-208ENST00000486192 TOPBP1Q92547 1522 aa15.37■□□□□ 0.05
SORCS1-208ENST00000486192 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
SORCS1-208ENST00000486192 CHD1O14646 1710 aa15.33■□□□□ 0.04
SORCS1-208ENST00000486192 IFT140Q96RY7 1462 aa15.32■□□□□ 0.04
SORCS1-208ENST00000486192 FBLN2P98095 1184 aa15.31■□□□□ 0.04
SORCS1-208ENST00000486192 CUX1P39880 1505 aa15.31■□□□□ 0.04
SORCS1-208ENST00000486192 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SORCS1-208ENST00000486192 ARAP1Q96P48 1450 aa15.28■□□□□ 0.04
SORCS1-208ENST00000486192 TOP2BQ02880 1626 aa15.28■□□□□ 0.04
SORCS1-208ENST00000486192 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.03
SORCS1-208ENST00000486192 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
SORCS1-208ENST00000486192 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.25■□□□□ 0.03
SORCS1-208ENST00000486192 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.24■□□□□ 0.03
SORCS1-208ENST00000486192 SYNJ1O43426 1573 aa15.23■□□□□ 0.03
SORCS1-208ENST00000486192 SOGA1O94964 1423 aa15.2■□□□□ 0.02
SORCS1-208ENST00000486192 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SORCS1-208ENST00000486192 WDR97A6NE52 1622 aa15.16■□□□□ 0.02
SORCS1-208ENST00000486192 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.15■□□□□ 0.02
SORCS1-208ENST00000486192 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.13■□□□□ 0.01
SORCS1-208ENST00000486192 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
SORCS1-208ENST00000486192 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.05■□□□□ -0
SORCS1-208ENST00000486192 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SORCS1-208ENST00000486192 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.03■□□□□ -0
SORCS1-208ENST00000486192 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.03■□□□□ -0
SORCS1-208ENST00000486192 KIF27Q86VH2 1401 aa15.03■□□□□ -0
SORCS1-208ENST00000486192 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.03■□□□□ -0
SORCS1-208ENST00000486192 GRIN2BQ13224 1484 aa15.02■□□□□ -0
SORCS1-208ENST00000486192 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.98□□□□□ -0.01
SORCS1-208ENST00000486192 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SORCS1-208ENST00000486192 EEA1Q15075 1411 aa14.96□□□□□ -0.01
SORCS1-208ENST00000486192 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SORCS1-208ENST00000486192 PBRM1Q86U86 1689 aa14.91□□□□□ -0.02
SORCS1-208ENST00000486192 IGF1RP08069 1367 aa14.91□□□□□ -0.02
SORCS1-208ENST00000486192 SYNJ2O15056 1496 aa14.9□□□□□ -0.02
SORCS1-208ENST00000486192 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SORCS1-208ENST00000486192 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.9□□□□□ -0.02
SORCS1-208ENST00000486192 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.9□□□□□ -0.02
SORCS1-208ENST00000486192 CUL7Q14999 1698 aa14.87□□□□□ -0.03
SORCS1-208ENST00000486192 ADAMTS12P58397 1594 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms