RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484177.5

NFU1-210, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, humanhuman

TSL 3

Gene NFU1, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1-210ENST00000484177 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.79■■■■□ 3.16
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NFU1-210ENST00000484177 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.49■■■□□ 2.63
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NFU1-210ENST00000484177 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.46
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NFU1-210ENST00000484177 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.64■■■□□ 2.34
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NFU1-210ENST00000484177 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.4■■■□□ 2.3
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NFU1-210ENST00000484177 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.04■■■□□ 2.24
NFU1-210ENST00000484177 SCRIBQ14160 1630 aa28.83■■■□□ 2.21
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NFU1-210ENST00000484177 NESP48681 1621 aa27.82■■■□□ 2.04
NFU1-210ENST00000484177 NCAPD3P42695 1498 aa27.82■■■□□ 2.04
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NFU1-210ENST00000484177 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.79■■□□□ 1.88
NFU1-210ENST00000484177 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.79■■□□□ 1.88
NFU1-210ENST00000484177 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.77■■□□□ 1.88
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NFU1-210ENST00000484177 CEP170Q5SW79 1584 aa25.21■■□□□ 1.63
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NFU1-210ENST00000484177 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
NFU1-210ENST00000484177 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.05■■□□□ 1.6
NFU1-210ENST00000484177 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.04■■□□□ 1.6
NFU1-210ENST00000484177 SHROOM2Q13796 1616 aa25.01■■□□□ 1.59
NFU1-210ENST00000484177 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NFU1-210ENST00000484177 KDM6BO15054 1643 aa24.99■■□□□ 1.59
NFU1-210ENST00000484177 ADAMTS12P58397 1594 aa24.97■■□□□ 1.59
NFU1-210ENST00000484177 JPH4Q96JJ6 628 aa24.95■■□□□ 1.58
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