RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483625.5

PTGES2-207, Transcript of prostaglandin E synthase 2, humanhuman

TSL 5

Gene PTGES2, Length 898 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES2-207ENST00000483625 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.6■■■■■ 6.33
PTGES2-207ENST00000483625 ABCC9O60706 1549 aa50.31■■■■■ 5.64
PTGES2-207ENST00000483625 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.36■■■■■ 5.49
PTGES2-207ENST00000483625 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.12■■■■■ 5.29
PTGES2-207ENST00000483625 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.39■■■■■ 5.18
PTGES2-207ENST00000483625 NACADO15069 1562 aa46.85■■■■■ 5.09
PTGES2-207ENST00000483625 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.69■■■■■ 5.06
PTGES2-207ENST00000483625 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.52■■■■■ 5.04
PTGES2-207ENST00000483625 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.39■■■■■ 5.02
PTGES2-207ENST00000483625 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.22■■■■■ 4.99
PTGES2-207ENST00000483625 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.88■■■■■ 4.94
PTGES2-207ENST00000483625 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.41■■■■■ 4.86
PTGES2-207ENST00000483625 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.36■■■■■ 4.85
PTGES2-207ENST00000483625 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.26■■■■■ 4.84
PTGES2-207ENST00000483625 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
PTGES2-207ENST00000483625 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
PTGES2-207ENST00000483625 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.99■■■■■ 4.79
PTGES2-207ENST00000483625 SCRIBQ14160 1630 aa44.98■■■■■ 4.79
PTGES2-207ENST00000483625 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.69■■■■■ 4.74
PTGES2-207ENST00000483625 CUX2O14529 1486 aa43.63■■■■■ 4.57
PTGES2-207ENST00000483625 ERCC6Q03468 1493 aa43.38■■■■■ 4.53
PTGES2-207ENST00000483625 NCAPD3P42695 1498 aa43.29■■■■■ 4.52
PTGES2-207ENST00000483625 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.06■■■■■ 4.48
PTGES2-207ENST00000483625 NESP48681 1621 aa43.02■■■■■ 4.48
PTGES2-207ENST00000483625 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
PTGES2-207ENST00000483625 SMARCA4P51532 1647 aa42.81■■■■■ 4.44
PTGES2-207ENST00000483625 SMARCA2P51531 1590 aa42.81■■■■■ 4.44
PTGES2-207ENST00000483625 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
PTGES2-207ENST00000483625 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
PTGES2-207ENST00000483625 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.44■■■■■ 4.38
PTGES2-207ENST00000483625 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.43■■■■■ 4.38
PTGES2-207ENST00000483625 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.38■■■■■ 4.37
PTGES2-207ENST00000483625 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
PTGES2-207ENST00000483625 TRIM41Q8WV44 630 aa42.34■■■■■ 4.37
PTGES2-207ENST00000483625 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.16■■■■■ 4.34
PTGES2-207ENST00000483625 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.13■■■■■ 4.33
PTGES2-207ENST00000483625 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.92■■■■■ 4.3
PTGES2-207ENST00000483625 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.9■■■■■ 4.3
PTGES2-207ENST00000483625 WDR62O43379 1518 aa41.89■■■■■ 4.3
PTGES2-207ENST00000483625 WIZO95785 1651 aa41.59■■■■■ 4.25
PTGES2-207ENST00000483625 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.55■■■■■ 4.24
PTGES2-207ENST00000483625 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.47■■■■■ 4.23
PTGES2-207ENST00000483625 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
PTGES2-207ENST00000483625 OSCARQ8IYS5 282 aa41.45■■■■■ 4.23
PTGES2-207ENST00000483625 CFTRP13569 1480 aa41.28■■■■■ 4.2
PTGES2-207ENST00000483625 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
PTGES2-207ENST00000483625 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.16■■■■■ 4.18
PTGES2-207ENST00000483625 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.16■■■■■ 4.18
PTGES2-207ENST00000483625 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.16■■■■■ 4.18
PTGES2-207ENST00000483625 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
PTGES2-207ENST00000483625 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
PTGES2-207ENST00000483625 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
PTGES2-207ENST00000483625 ARHGEF11O15085 1522 aa40.9■■■■■ 4.14
PTGES2-207ENST00000483625 PRDM2Q13029 1718 aa40.82■■■■■ 4.13
PTGES2-207ENST00000483625 IFT140Q96RY7 1462 aa40.75■■■■■ 4.11
PTGES2-207ENST00000483625 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.61■■■■■ 4.09
PTGES2-207ENST00000483625 TOPBP1Q92547 1522 aa40.61■■■■■ 4.09
PTGES2-207ENST00000483625 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
PTGES2-207ENST00000483625 CHD1O14646 1710 aa40.5■■■■■ 4.07
PTGES2-207ENST00000483625 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.5■■■■■ 4.07
PTGES2-207ENST00000483625 ARAP1Q96P48 1450 aa40.47■■■■■ 4.07
PTGES2-207ENST00000483625 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.063e-6■■■■■ 31.9
PTGES2-207ENST00000483625 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
PTGES2-207ENST00000483625 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
PTGES2-207ENST00000483625 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.35■■■■■ 4.05
PTGES2-207ENST00000483625 ABCC8Q09428 1581 aa40.31■■■■■ 4.04
PTGES2-207ENST00000483625 FBLN2P98095 1184 aa40.19■■■■■ 4.02
PTGES2-207ENST00000483625 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
PTGES2-207ENST00000483625 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.05■■■■■ 4
PTGES2-207ENST00000483625 CLASP1Q7Z460 1538 aa40■■■■□ 3.99
PTGES2-207ENST00000483625 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
PTGES2-207ENST00000483625 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.92■■■■□ 3.98
PTGES2-207ENST00000483625 SOGA1O94964 1423 aa39.88■■■■□ 3.97
PTGES2-207ENST00000483625 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
PTGES2-207ENST00000483625 SYNJ1O43426 1573 aa39.78■■■■□ 3.96
PTGES2-207ENST00000483625 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
PTGES2-207ENST00000483625 WDR97A6NE52 1622 aa39.74■■■■□ 3.95
PTGES2-207ENST00000483625 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
PTGES2-207ENST00000483625 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
PTGES2-207ENST00000483625 GRIN2BQ13224 1484 aa39.62■■■■□ 3.93
PTGES2-207ENST00000483625 CUX1P39880 1505 aa39.62■■■■□ 3.93
PTGES2-207ENST00000483625 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
PTGES2-207ENST00000483625 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.56■■■■□ 3.92
PTGES2-207ENST00000483625 PBRM1Q86U86 1689 aa39.5■■■■□ 3.91
PTGES2-207ENST00000483625 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.39■■■■□ 3.9
PTGES2-207ENST00000483625 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.3■■■■□ 3.88
PTGES2-207ENST00000483625 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.22■■■■□ 3.87
PTGES2-207ENST00000483625 GRIN2AQ12879 1464 aa39.15■■■■□ 3.86
PTGES2-207ENST00000483625 CEP170Q5SW79 1584 aa39.15■■■■□ 3.86
PTGES2-207ENST00000483625 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.08■■■■□ 3.85
PTGES2-207ENST00000483625 NUP160Q12769 1436 aa39.07■■■■□ 3.85
PTGES2-207ENST00000483625 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
PTGES2-207ENST00000483625 ADAMTS12P58397 1594 aa39.05■■■■□ 3.84
PTGES2-207ENST00000483625 SHROOM2Q13796 1616 aa39.04■■■■□ 3.84
PTGES2-207ENST00000483625 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.91■■■■□ 3.82
PTGES2-207ENST00000483625 TOP2BQ02880 1626 aa38.9■■■■□ 3.82
PTGES2-207ENST00000483625 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.82■■■■□ 3.81
PTGES2-207ENST00000483625 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
PTGES2-207ENST00000483625 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.74■■■■□ 3.79
PTGES2-207ENST00000483625 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.68■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.3 ms