RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482551.1

FREM2-202, Transcript of FRAS1 related extracellular matrix protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene FREM2, Length 711 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM2-202ENST00000482551 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.31■□□□□ 0.84
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FREM2-202ENST00000482551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
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FREM2-202ENST00000482551 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.76■□□□□ 0.27
FREM2-202ENST00000482551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.76■□□□□ 0.27
FREM2-202ENST00000482551 ABCC9O60706 1549 aa16.7■□□□□ 0.26
FREM2-202ENST00000482551 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.51■□□□□ 0.23
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FREM2-202ENST00000482551 SCRIBQ14160 1630 aa16.33■□□□□ 0.2
FREM2-202ENST00000482551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.32■□□□□ 0.2
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FREM2-202ENST00000482551 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
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FREM2-202ENST00000482551 WIZO95785 1651 aa15.57■□□□□ 0.08
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FREM2-202ENST00000482551 SMARCA2P51531 1590 aa15.36■□□□□ 0.05
FREM2-202ENST00000482551 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.35■□□□□ 0.05
FREM2-202ENST00000482551 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.33■□□□□ 0.04
FREM2-202ENST00000482551 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
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FREM2-202ENST00000482551 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.27■□□□□ 0.04
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FREM2-202ENST00000482551 HMGXB3Q12766 1538 aa15.17■□□□□ 0.02
FREM2-202ENST00000482551 NCAPD3P42695 1498 aa15.15■□□□□ 0.02
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FREM2-202ENST00000482551 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
FREM2-202ENST00000482551 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.89□□□□□ -0.03
FREM2-202ENST00000482551 CFTRP13569 1480 aa14.85□□□□□ -0.03
FREM2-202ENST00000482551 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.82□□□□□ -0.04
FREM2-202ENST00000482551 SYNJ1O43426 1573 aa14.81□□□□□ -0.04
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FREM2-202ENST00000482551 EEA1Q15075 1411 aa14.77□□□□□ -0.04
FREM2-202ENST00000482551 PRDM2Q13029 1718 aa14.76□□□□□ -0.05
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FREM2-202ENST00000482551 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.52□□□□□ -0.08
FREM2-202ENST00000482551 TOPBP1Q92547 1522 aa14.51□□□□□ -0.09
FREM2-202ENST00000482551 CUX2O14529 1486 aa14.5□□□□□ -0.09
FREM2-202ENST00000482551 CEP162Q5TB80 1403 aa14.48□□□□□ -0.09
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FREM2-202ENST00000482551 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.44□□□□□ -0.1
FREM2-202ENST00000482551 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.41□□□□□ -0.1
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FREM2-202ENST00000482551 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.4□□□□□ -0.1
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FREM2-202ENST00000482551 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.39□□□□□ -0.11
FREM2-202ENST00000482551 ERCC6Q03468 1493 aa14.38□□□□□ -0.11
FREM2-202ENST00000482551 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.37□□□□□ -0.11
FREM2-202ENST00000482551 CLIP1P30622 1438 aa14.37□□□□□ -0.11
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FREM2-202ENST00000482551 WDR97A6NE52 1622 aa14.27□□□□□ -0.12
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FREM2-202ENST00000482551 WDR62O43379 1518 aa14.25□□□□□ -0.13
FREM2-202ENST00000482551 APLP2Q06481 763 aa14.25□□□□□ -0.13
FREM2-202ENST00000482551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.24□□□□□ -0.13
FREM2-202ENST00000482551 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
FREM2-202ENST00000482551 IFT140Q96RY7 1462 aa14.24□□□□□ -0.13
FREM2-202ENST00000482551 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
FREM2-202ENST00000482551 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.22□□□□□ -0.13
FREM2-202ENST00000482551 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
FREM2-202ENST00000482551 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
FREM2-202ENST00000482551 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.16□□□□□ -0.14
FREM2-202ENST00000482551 GRIN2BQ13224 1484 aa14.15□□□□□ -0.14
FREM2-202ENST00000482551 ARAP1Q96P48 1450 aa14.15□□□□□ -0.14
FREM2-202ENST00000482551 PBRM1Q86U86 1689 aa14.14□□□□□ -0.15
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