RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481760.2

SLC12A8-212, Transcript of solute carrier family 12 member 8, humanhuman

TSL 3

Gene SLC12A8, Length 439 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8-212ENST00000481760 NISCHQ9Y2I1 1504 aa73.65■■■■■ 9.38
SLC12A8-212ENST00000481760 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa65.49■■■■■ 8.07
SLC12A8-212ENST00000481760 ABCC9O60706 1549 aa64.13■■■■■ 7.86
SLC12A8-212ENST00000481760 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61.67■■■■■ 7.46
SLC12A8-212ENST00000481760 NACADO15069 1562 aa61.59■■■■■ 7.45
SLC12A8-212ENST00000481760 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61.58■■■■■ 7.45
SLC12A8-212ENST00000481760 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP61.36■■■■■ 7.41
SLC12A8-212ENST00000481760 MYO15BQ96JP2 1530 aa61.2■■■■■ 7.39
SLC12A8-212ENST00000481760 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60.93■■■■■ 7.34
SLC12A8-212ENST00000481760 UNC13AQ9UPW8 1703 aa60.25■■■■■ 7.24
SLC12A8-212ENST00000481760 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.92■■■■■ 7.18
SLC12A8-212ENST00000481760 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.78■■■■■ 7.16
SLC12A8-212ENST00000481760 SCRIBQ14160 1630 aa59.78■■■■■ 7.16
SLC12A8-212ENST00000481760 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa59.17■■■■■ 7.06
SLC12A8-212ENST00000481760 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.85■■■■■ 7.01
SLC12A8-212ENST00000481760 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP58.23■■■■■ 6.91
SLC12A8-212ENST00000481760 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa58■■■■■ 6.88
SLC12A8-212ENST00000481760 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.62■■■■■ 6.81
SLC12A8-212ENST00000481760 SMARCA4P51532 1647 aa57.17■■■■■ 6.74
SLC12A8-212ENST00000481760 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP57.1■■■■■ 6.73
SLC12A8-212ENST00000481760 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.86■■■■■ 6.69
SLC12A8-212ENST00000481760 NCAPD3P42695 1498 aa56.82■■■■■ 6.69
SLC12A8-212ENST00000481760 SMARCA2P51531 1590 aa56.8■■■■■ 6.68
SLC12A8-212ENST00000481760 MROH2BQ7Z745 1585 aa56.76■■■■■ 6.68
SLC12A8-212ENST00000481760 PEG3Q9GZU2 1588 aa56.59■■■■■ 6.65
SLC12A8-212ENST00000481760 HMGXB3Q12766 1538 aa56.55■■■■■ 6.64
SLC12A8-212ENST00000481760 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP56.41■■■■■ 6.62
SLC12A8-212ENST00000481760 WIZO95785 1651 aa56.15■■■■■ 6.58
SLC12A8-212ENST00000481760 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP56.11■■■■■ 6.57
SLC12A8-212ENST00000481760 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP55.57■■■■■ 6.49
SLC12A8-212ENST00000481760 NESP48681 1621 aa55.47■■■■■ 6.47
SLC12A8-212ENST00000481760 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa55.34■■■■■ 6.45
SLC12A8-212ENST00000481760 ERCC6Q03468 1493 aa55.29■■■■■ 6.44
SLC12A8-212ENST00000481760 CADPSQ9ULU8 1353 aa55.17■■■■■ 6.42
SLC12A8-212ENST00000481760 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.97■■■■■ 6.39
SLC12A8-212ENST00000481760 CCDC88BA6NC98 1476 aa54.91■■■■■ 6.38
SLC12A8-212ENST00000481760 CFTRP13569 1480 aa54.84■■■■■ 6.37
SLC12A8-212ENST00000481760 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.82■■■■■ 6.37
SLC12A8-212ENST00000481760 CUX2O14529 1486 aa54.7■■■■■ 6.35
SLC12A8-212ENST00000481760 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.69■■■■■ 6.35
SLC12A8-212ENST00000481760 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.64■■■■■ 6.34
SLC12A8-212ENST00000481760 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.55■■■■■ 6.32
SLC12A8-212ENST00000481760 CEP164Q9UPV0 1460 aa54.49■■■■■ 6.31
SLC12A8-212ENST00000481760 MRC2Q9UBG0 1479 aa54.42■■■■■ 6.3
SLC12A8-212ENST00000481760 PRDM2Q13029 1718 aa54.42■■■■■ 6.3
SLC12A8-212ENST00000481760 WDR62O43379 1518 aa54.23■■■■■ 6.27
SLC12A8-212ENST00000481760 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP54■■■■■ 6.24
SLC12A8-212ENST00000481760 TOPBP1Q92547 1522 aa53.68■■■■■ 6.18
SLC12A8-212ENST00000481760 ABCC8Q09428 1581 aa53.67■■■■■ 6.18
SLC12A8-212ENST00000481760 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53.61■■■■■ 6.17
SLC12A8-212ENST00000481760 IFT140Q96RY7 1462 aa53.35■■■■■ 6.13
SLC12A8-212ENST00000481760 CUX1P39880 1505 aa53.26■■■■■ 6.12
SLC12A8-212ENST00000481760 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP53.21■■■■■ 6.11
SLC12A8-212ENST00000481760 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP53.1■■■■■ 6.09
SLC12A8-212ENST00000481760 FGD5Q6ZNL6 1462 aa53.09■■■■■ 6.09
SLC12A8-212ENST00000481760 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP53.07■■■■■ 6.09
SLC12A8-212ENST00000481760 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.03■■■■■ 6.08
SLC12A8-212ENST00000481760 SOGA1O94964 1423 aa53■■■■■ 6.08
SLC12A8-212ENST00000481760 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa53■■■■■ 6.07
SLC12A8-212ENST00000481760 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52.92■■■■■ 6.06
SLC12A8-212ENST00000481760 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.9■■■■■ 6.06
SLC12A8-212ENST00000481760 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.81■■■■■ 6.04
SLC12A8-212ENST00000481760 TOP2BQ02880 1626 aa52.8■■■■■ 6.04
SLC12A8-212ENST00000481760 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa52.79■■■■■ 6.04
SLC12A8-212ENST00000481760 SYNJ1O43426 1573 aa52.78■■■■■ 6.04
SLC12A8-212ENST00000481760 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.71■■■■■ 6.03
SLC12A8-212ENST00000481760 WDR97A6NE52 1622 aa52.67■■■■■ 6.02
SLC12A8-212ENST00000481760 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa52.57■■■■■ 6.01
SLC12A8-212ENST00000481760 OSCARQ8IYS5 282 aa52.43■■■■■ 5.98
SLC12A8-212ENST00000481760 GRIN2BQ13224 1484 aa52.39■■■■■ 5.98
SLC12A8-212ENST00000481760 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.39■■■■■ 5.98
SLC12A8-212ENST00000481760 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa52.37■■■■■ 5.97
SLC12A8-212ENST00000481760 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa52.33■■■■■ 5.97
SLC12A8-212ENST00000481760 PBRM1Q86U86 1689 aa52.29■■■■■ 5.96
SLC12A8-212ENST00000481760 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP52.25■■■■■ 5.96
SLC12A8-212ENST00000481760 CHD1O14646 1710 aa52.23■■■■■ 5.95
SLC12A8-212ENST00000481760 FBLN2P98095 1184 aa52.2■■■■■ 5.95
SLC12A8-212ENST00000481760 SYNJ2O15056 1496 aa52.05■■■■■ 5.92
SLC12A8-212ENST00000481760 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP52.05■■■■■ 5.92
SLC12A8-212ENST00000481760 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.94■■■■■ 5.91
SLC12A8-212ENST00000481760 ADAMTS12P58397 1594 aa51.87■■■■■ 5.89
SLC12A8-212ENST00000481760 KIF27Q86VH2 1401 aa51.81■■■■■ 5.89
SLC12A8-212ENST00000481760 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.8■■■■■ 5.88
SLC12A8-212ENST00000481760 GRIN2AQ12879 1464 aa51.71■■■■■ 5.87
SLC12A8-212ENST00000481760 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.67■■■■■ 5.86
SLC12A8-212ENST00000481760 TRIM41Q8WV44 630 aa51.66■■■■■ 5.86
SLC12A8-212ENST00000481760 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.6■■■■■ 5.85
SLC12A8-212ENST00000481760 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.6■■■■■ 5.85
SLC12A8-212ENST00000481760 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.6■■■■■ 5.85
SLC12A8-212ENST00000481760 IGF1RP08069 1367 aa51.59■■■■■ 5.85
SLC12A8-212ENST00000481760 ARHGEF11O15085 1522 aa51.58■■■■■ 5.85
SLC12A8-212ENST00000481760 NUP160Q12769 1436 aa51.48■■■■■ 5.83
SLC12A8-212ENST00000481760 CUL7Q14999 1698 aa51.47■■■■■ 5.83
SLC12A8-212ENST00000481760 CEP170Q5SW79 1584 aa51.45■■■■■ 5.83
SLC12A8-212ENST00000481760 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa51.33■■■■■ 5.81
SLC12A8-212ENST00000481760 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa51.31■■■■■ 5.8
SLC12A8-212ENST00000481760 ARAP1Q96P48 1450 aa51.16■■■■■ 5.78
SLC12A8-212ENST00000481760 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.11■■■■■ 5.77
SLC12A8-212ENST00000481760 SHROOM2Q13796 1616 aa51.09■■■■■ 5.77
SLC12A8-212ENST00000481760 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.01■■■■■ 5.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms