RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481440.5

TBXAS1-217, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene TBXAS1, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-217ENST00000481440 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.25■■■■■ 4.99
TBXAS1-217ENST00000481440 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.11■■■■■ 4.17
TBXAS1-217ENST00000481440 ABCC9O60706 1549 aa40.21■■■■■ 4.03
TBXAS1-217ENST00000481440 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.7■■■■□ 3.79
TBXAS1-217ENST00000481440 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.7■■■■□ 3.79
TBXAS1-217ENST00000481440 NACADO15069 1562 aa38.66■■■■□ 3.78
TBXAS1-217ENST00000481440 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
TBXAS1-217ENST00000481440 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.44■■■■□ 3.74
TBXAS1-217ENST00000481440 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.28■■■■□ 3.72
TBXAS1-217ENST00000481440 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.89■■■■□ 3.66
TBXAS1-217ENST00000481440 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.62■■■■□ 3.61
TBXAS1-217ENST00000481440 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.54■■■■□ 3.6
TBXAS1-217ENST00000481440 SCRIBQ14160 1630 aa37.47■■■■□ 3.59
TBXAS1-217ENST00000481440 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.09■■■■□ 3.53
TBXAS1-217ENST00000481440 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.01■■■■□ 3.52
TBXAS1-217ENST00000481440 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
TBXAS1-217ENST00000481440 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.4■■■■□ 3.42
TBXAS1-217ENST00000481440 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.13■■■■□ 3.37
TBXAS1-217ENST00000481440 SMARCA4P51532 1647 aa35.87■■■■□ 3.33
TBXAS1-217ENST00000481440 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
TBXAS1-217ENST00000481440 NCAPD3P42695 1498 aa35.7■■■■□ 3.31
TBXAS1-217ENST00000481440 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.69■■■■□ 3.3
TBXAS1-217ENST00000481440 SMARCA2P51531 1590 aa35.64■■■■□ 3.3
TBXAS1-217ENST00000481440 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.64■■■■□ 3.3
TBXAS1-217ENST00000481440 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.54■■■■□ 3.28
TBXAS1-217ENST00000481440 HMGXB3Q12766 1538 aa35.47■■■■□ 3.27
TBXAS1-217ENST00000481440 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
TBXAS1-217ENST00000481440 WIZO95785 1651 aa35.27■■■■□ 3.24
TBXAS1-217ENST00000481440 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
TBXAS1-217ENST00000481440 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
TBXAS1-217ENST00000481440 NESP48681 1621 aa34.81■■■■□ 3.16
TBXAS1-217ENST00000481440 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.73■■■■□ 3.15
TBXAS1-217ENST00000481440 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.65■■■■□ 3.14
TBXAS1-217ENST00000481440 ERCC6Q03468 1493 aa34.63■■■■□ 3.13
TBXAS1-217ENST00000481440 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.5■■■■□ 3.11
TBXAS1-217ENST00000481440 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.5■■■■□ 3.11
TBXAS1-217ENST00000481440 CFTRP13569 1480 aa34.43■■■■□ 3.1
TBXAS1-217ENST00000481440 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.41■■■■□ 3.1
TBXAS1-217ENST00000481440 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
TBXAS1-217ENST00000481440 CUX2O14529 1486 aa34.29■■■■□ 3.08
TBXAS1-217ENST00000481440 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
TBXAS1-217ENST00000481440 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.21■■■■□ 3.07
TBXAS1-217ENST00000481440 PRDM2Q13029 1718 aa34.2■■■■□ 3.07
TBXAS1-217ENST00000481440 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.15■■■■□ 3.06
TBXAS1-217ENST00000481440 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.11■■■■□ 3.05
TBXAS1-217ENST00000481440 WDR62O43379 1518 aa34■■■■□ 3.03
TBXAS1-217ENST00000481440 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
TBXAS1-217ENST00000481440 ABCC8Q09428 1581 aa33.72■■■□□ 2.99
TBXAS1-217ENST00000481440 TOPBP1Q92547 1522 aa33.68■■■□□ 2.98
TBXAS1-217ENST00000481440 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.62■■■□□ 2.97
TBXAS1-217ENST00000481440 IFT140Q96RY7 1462 aa33.46■■■□□ 2.95
TBXAS1-217ENST00000481440 CUX1P39880 1505 aa33.42■■■□□ 2.94
TBXAS1-217ENST00000481440 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
TBXAS1-217ENST00000481440 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.34■■■□□ 2.93
TBXAS1-217ENST00000481440 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
TBXAS1-217ENST00000481440 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
TBXAS1-217ENST00000481440 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.3■■■□□ 2.92
TBXAS1-217ENST00000481440 SOGA1O94964 1423 aa33.29■■■□□ 2.92
TBXAS1-217ENST00000481440 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.26■■■□□ 2.92
TBXAS1-217ENST00000481440 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.2■■■□□ 2.91
TBXAS1-217ENST00000481440 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
TBXAS1-217ENST00000481440 TOP2BQ02880 1626 aa33.14■■■□□ 2.9
TBXAS1-217ENST00000481440 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.14■■■□□ 2.9
TBXAS1-217ENST00000481440 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
TBXAS1-217ENST00000481440 SYNJ1O43426 1573 aa33.11■■■□□ 2.89
TBXAS1-217ENST00000481440 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
TBXAS1-217ENST00000481440 WDR97A6NE52 1622 aa33.04■■■□□ 2.88
TBXAS1-217ENST00000481440 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33■■■□□ 2.87
TBXAS1-217ENST00000481440 OSCARQ8IYS5 282 aa32.97■■■□□ 2.87
TBXAS1-217ENST00000481440 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.88■■■□□ 2.85
TBXAS1-217ENST00000481440 GRIN2BQ13224 1484 aa32.86■■■□□ 2.85
TBXAS1-217ENST00000481440 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.84■■■□□ 2.85
TBXAS1-217ENST00000481440 PBRM1Q86U86 1689 aa32.81■■■□□ 2.84
TBXAS1-217ENST00000481440 CHD1O14646 1710 aa32.79■■■□□ 2.84
TBXAS1-217ENST00000481440 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.79■■■□□ 2.84
TBXAS1-217ENST00000481440 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
TBXAS1-217ENST00000481440 FBLN2P98095 1184 aa32.76■■■□□ 2.83
TBXAS1-217ENST00000481440 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
TBXAS1-217ENST00000481440 SYNJ2O15056 1496 aa32.65■■■□□ 2.82
TBXAS1-217ENST00000481440 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.6■■■□□ 2.81
TBXAS1-217ENST00000481440 KIF27Q86VH2 1401 aa32.52■■■□□ 2.8
TBXAS1-217ENST00000481440 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.5■■■□□ 2.79
TBXAS1-217ENST00000481440 ADAMTS12P58397 1594 aa32.49■■■□□ 2.79
TBXAS1-217ENST00000481440 TRIM41Q8WV44 630 aa32.48■■■□□ 2.79
TBXAS1-217ENST00000481440 IGF1RP08069 1367 aa32.45■■■□□ 2.78
TBXAS1-217ENST00000481440 GRIN2AQ12879 1464 aa32.43■■■□□ 2.78
TBXAS1-217ENST00000481440 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.4■■■□□ 2.78
TBXAS1-217ENST00000481440 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.36■■■□□ 2.77
TBXAS1-217ENST00000481440 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.36■■■□□ 2.77
TBXAS1-217ENST00000481440 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.36■■■□□ 2.77
TBXAS1-217ENST00000481440 ARHGEF11O15085 1522 aa32.33■■■□□ 2.77
TBXAS1-217ENST00000481440 NUP160Q12769 1436 aa32.3■■■□□ 2.76
TBXAS1-217ENST00000481440 CUL7Q14999 1698 aa32.29■■■□□ 2.76
TBXAS1-217ENST00000481440 CEP170Q5SW79 1584 aa32.28■■■□□ 2.76
TBXAS1-217ENST00000481440 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.26■■■□□ 2.75
TBXAS1-217ENST00000481440 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.23■■■□□ 2.75
TBXAS1-217ENST00000481440 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.11■■■□□ 2.73
TBXAS1-217ENST00000481440 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.11■■■□□ 2.73
TBXAS1-217ENST00000481440 SHROOM2Q13796 1616 aa32.07■■■□□ 2.72
TBXAS1-217ENST00000481440 ARAP1Q96P48 1450 aa32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms