RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481348.5

ABCD4-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,177 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-210ENST00000481348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.25■■■□□ 2.91
ABCD4-210ENST00000481348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.72■■■□□ 2.35
ABCD4-210ENST00000481348 ABCC9O60706 1549 aa29.5■■■□□ 2.31
ABCD4-210ENST00000481348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.2■■■□□ 2.1
ABCD4-210ENST00000481348 NACADO15069 1562 aa28.07■■■□□ 2.08
ABCD4-210ENST00000481348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.03■■■□□ 2.08
ABCD4-210ENST00000481348 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.75■■■□□ 2.03
ABCD4-210ENST00000481348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ABCD4-210ENST00000481348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.54■■■□□ 2
ABCD4-210ENST00000481348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 22e-6■■□□□ 13
ABCD4-210ENST00000481348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.47■■□□□ 1.99
ABCD4-210ENST00000481348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.45■■□□□ 1.98
ABCD4-210ENST00000481348 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.33■■□□□ 1.97
ABCD4-210ENST00000481348 SCRIBQ14160 1630 aa27.09■■□□□ 1.93
ABCD4-210ENST00000481348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27■■□□□ 1.91
ABCD4-210ENST00000481348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ABCD4-210ENST00000481348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.65■■□□□ 1.86
ABCD4-210ENST00000481348 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.55■■□□□ 1.84
ABCD4-210ENST00000481348 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ABCD4-210ENST00000481348 NCAPD3P42695 1498 aa25.91■■□□□ 1.74
ABCD4-210ENST00000481348 SMARCA4P51532 1647 aa25.88■■□□□ 1.73
ABCD4-210ENST00000481348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.85■■□□□ 1.73
ABCD4-210ENST00000481348 SMARCA2P51531 1590 aa25.81■■□□□ 1.72
ABCD4-210ENST00000481348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
ABCD4-210ENST00000481348 HMGXB3Q12766 1538 aa25.71■■□□□ 1.71
ABCD4-210ENST00000481348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
ABCD4-210ENST00000481348 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.61■■□□□ 1.69
ABCD4-210ENST00000481348 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.61■■□□□ 1.69
ABCD4-210ENST00000481348 ERCC6Q03468 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
ABCD4-210ENST00000481348 NESP48681 1621 aa25.4■■□□□ 1.66
ABCD4-210ENST00000481348 CUX2O14529 1486 aa25.34■■□□□ 1.65
ABCD4-210ENST00000481348 WIZO95785 1651 aa25.32■■□□□ 1.64
ABCD4-210ENST00000481348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.28■■□□□ 1.64
ABCD4-210ENST00000481348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ABCD4-210ENST00000481348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.14■■□□□ 1.62
ABCD4-210ENST00000481348 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.14■■□□□ 1.61
ABCD4-210ENST00000481348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.07■■□□□ 1.6
ABCD4-210ENST00000481348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ABCD4-210ENST00000481348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.06■■□□□ 1.6
ABCD4-210ENST00000481348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ABCD4-210ENST00000481348 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.93■■□□□ 1.58
ABCD4-210ENST00000481348 CFTRP13569 1480 aa24.89■■□□□ 1.57
ABCD4-210ENST00000481348 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.89■■□□□ 1.57
ABCD4-210ENST00000481348 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.85■■□□□ 1.57
ABCD4-210ENST00000481348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.84■■□□□ 1.57
ABCD4-210ENST00000481348 WDR62O43379 1518 aa24.81■■□□□ 1.56
ABCD4-210ENST00000481348 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.74■■□□□ 1.55
ABCD4-210ENST00000481348 PRDM2Q13029 1718 aa24.65■■□□□ 1.54
ABCD4-210ENST00000481348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
ABCD4-210ENST00000481348 ABCC8Q09428 1581 aa24.39■■□□□ 1.5
ABCD4-210ENST00000481348 TOPBP1Q92547 1522 aa24.39■■□□□ 1.49
ABCD4-210ENST00000481348 IFT140Q96RY7 1462 aa24.34■■□□□ 1.49
ABCD4-210ENST00000481348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.32■■□□□ 1.48
ABCD4-210ENST00000481348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ABCD4-210ENST00000481348 OSCARQ8IYS5 282 aa24.27■■□□□ 1.48
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ABCD4-210ENST00000481348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
ABCD4-210ENST00000481348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
ABCD4-210ENST00000481348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ABCD4-210ENST00000481348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.453e-9■■■■□ 23.6
ABCD4-210ENST00000481348 SOGA1O94964 1423 aa24.08■■□□□ 1.44
ABCD4-210ENST00000481348 TRIM41Q8WV44 630 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-210ENST00000481348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-210ENST00000481348 CUX1P39880 1505 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-210ENST00000481348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-210ENST00000481348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
ABCD4-210ENST00000481348 WDR97A6NE52 1622 aa23.93■■□□□ 1.42
ABCD4-210ENST00000481348 FBLN2P98095 1184 aa23.92■■□□□ 1.42
ABCD4-210ENST00000481348 CHD1O14646 1710 aa23.92■■□□□ 1.42
ABCD4-210ENST00000481348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.86■■□□□ 1.41
ABCD4-210ENST00000481348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.86■■□□□ 1.41
ABCD4-210ENST00000481348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.86■■□□□ 1.41
ABCD4-210ENST00000481348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.85■■□□□ 1.41
ABCD4-210ENST00000481348 GRIN2BQ13224 1484 aa23.83■■□□□ 1.41
ABCD4-210ENST00000481348 ARHGEF11O15085 1522 aa23.81■■□□□ 1.4
ABCD4-210ENST00000481348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ABCD4-210ENST00000481348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ABCD4-210ENST00000481348 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.79■■□□□ 1.4
ABCD4-210ENST00000481348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.79■■□□□ 1.4
ABCD4-210ENST00000481348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
ABCD4-210ENST00000481348 TOP2BQ02880 1626 aa23.73■■□□□ 1.39
ABCD4-210ENST00000481348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.73■■□□□ 1.39
ABCD4-210ENST00000481348 PBRM1Q86U86 1689 aa23.73■■□□□ 1.39
ABCD4-210ENST00000481348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.71■■□□□ 1.39
ABCD4-210ENST00000481348 SYNJ2O15056 1496 aa23.71■■□□□ 1.39
ABCD4-210ENST00000481348 SYNJ1O43426 1573 aa23.69■■□□□ 1.38
ABCD4-210ENST00000481348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.68■■□□□ 1.38
ABCD4-210ENST00000481348 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.64■■□□□ 1.37
ABCD4-210ENST00000481348 ARAP1Q96P48 1450 aa23.59■■□□□ 1.37
ABCD4-210ENST00000481348 GRIN2AQ12879 1464 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-210ENST00000481348 ADAMTS12P58397 1594 aa23.51■■□□□ 1.35
ABCD4-210ENST00000481348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.5■■□□□ 1.35
ABCD4-210ENST00000481348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.49■■□□□ 1.35
ABCD4-210ENST00000481348 NUP160Q12769 1436 aa23.42■■□□□ 1.34
ABCD4-210ENST00000481348 CEP170Q5SW79 1584 aa23.4■■□□□ 1.34
ABCD4-210ENST00000481348 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ABCD4-210ENST00000481348 KIF27Q86VH2 1401 aa23.32■■□□□ 1.32
ABCD4-210ENST00000481348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.28■■□□□ 1.32
ABCD4-210ENST00000481348 SHROOM2Q13796 1616 aa23.27■■□□□ 1.32
ABCD4-210ENST00000481348 IGF1RP08069 1367 aa23.27■■□□□ 1.31
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