RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479400.1

ILKAP-208, Transcript of ILK associated serine/threonine phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene ILKAP, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAP-208ENST00000479400 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.76■■■■□ 3
ILKAP-208ENST00000479400 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.12■■■□□ 2.41
ILKAP-208ENST00000479400 ABCC9O60706 1549 aa30.07■■■□□ 2.4
ILKAP-208ENST00000479400 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.6■■■□□ 2.17
ILKAP-208ENST00000479400 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.59■■■□□ 2.17
ILKAP-208ENST00000479400 NACADO15069 1562 aa28.43■■■□□ 2.14
ILKAP-208ENST00000479400 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
ILKAP-208ENST00000479400 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.03■■■□□ 2.08
ILKAP-208ENST00000479400 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.02■■■□□ 2.08
ILKAP-208ENST00000479400 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
ILKAP-208ENST00000479400 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.02■■■□□ 2.08
ILKAP-208ENST00000479400 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.81■■■□□ 2.04
ILKAP-208ENST00000479400 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.79■■■□□ 2.04
ILKAP-208ENST00000479400 SCRIBQ14160 1630 aa27.63■■■□□ 2.01
ILKAP-208ENST00000479400 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.27■■□□□ 1.96
ILKAP-208ENST00000479400 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.12■■□□□ 1.93
ILKAP-208ENST00000479400 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
ILKAP-208ENST00000479400 CECR2Q9BXF3 1484 aa27■■□□□ 1.91
ILKAP-208ENST00000479400 SMARCA4P51532 1647 aa26.3■■□□□ 1.8
ILKAP-208ENST00000479400 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.26■■□□□ 1.79
ILKAP-208ENST00000479400 NCAPD3P42695 1498 aa26.25■■□□□ 1.79
ILKAP-208ENST00000479400 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ILKAP-208ENST00000479400 SMARCA2P51531 1590 aa26.16■■□□□ 1.78
ILKAP-208ENST00000479400 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.07■■□□□ 1.76
ILKAP-208ENST00000479400 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ILKAP-208ENST00000479400 HMGXB3Q12766 1538 aa26.07■■□□□ 1.76
ILKAP-208ENST00000479400 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ILKAP-208ENST00000479400 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.95■■□□□ 1.75
ILKAP-208ENST00000479400 ERCC6Q03468 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
ILKAP-208ENST00000479400 NESP48681 1621 aa25.91■■□□□ 1.74
ILKAP-208ENST00000479400 WIZO95785 1651 aa25.8■■□□□ 1.72
ILKAP-208ENST00000479400 CUX2O14529 1486 aa25.68■■□□□ 1.7
ILKAP-208ENST00000479400 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.63■■□□□ 1.69
ILKAP-208ENST00000479400 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
ILKAP-208ENST00000479400 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.55■■□□□ 1.68
ILKAP-208ENST00000479400 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
ILKAP-208ENST00000479400 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.5■■□□□ 1.67
ILKAP-208ENST00000479400 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.49■■□□□ 1.67
ILKAP-208ENST00000479400 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.45■■□□□ 1.66
ILKAP-208ENST00000479400 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ILKAP-208ENST00000479400 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.28■■□□□ 1.64
ILKAP-208ENST00000479400 CFTRP13569 1480 aa25.25■■□□□ 1.63
ILKAP-208ENST00000479400 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.25■■□□□ 1.63
ILKAP-208ENST00000479400 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.24■■□□□ 1.63
ILKAP-208ENST00000479400 WDR62O43379 1518 aa25.19■■□□□ 1.62
ILKAP-208ENST00000479400 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.17■■□□□ 1.62
ILKAP-208ENST00000479400 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.07■■□□□ 1.6
ILKAP-208ENST00000479400 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ILKAP-208ENST00000479400 PRDM2Q13029 1718 aa25.01■■□□□ 1.59
ILKAP-208ENST00000479400 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ILKAP-208ENST00000479400 TOPBP1Q92547 1522 aa24.79■■□□□ 1.56
ILKAP-208ENST00000479400 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ILKAP-208ENST00000479400 IFT140Q96RY7 1462 aa24.7■■□□□ 1.55
ILKAP-208ENST00000479400 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.7■■□□□ 1.54
ILKAP-208ENST00000479400 ABCC8Q09428 1581 aa24.66■■□□□ 1.54
ILKAP-208ENST00000479400 OSCARQ8IYS5 282 aa24.61■■□□□ 1.53
ILKAP-208ENST00000479400 TRIM41Q8WV44 630 aa24.6■■□□□ 1.53
ILKAP-208ENST00000479400 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ILKAP-208ENST00000479400 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ILKAP-208ENST00000479400 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ILKAP-208ENST00000479400 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
ILKAP-208ENST00000479400 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.53■■□□□ 1.52
ILKAP-208ENST00000479400 CUX1P39880 1505 aa24.48■■□□□ 1.51
ILKAP-208ENST00000479400 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.46■■□□□ 1.51
ILKAP-208ENST00000479400 SOGA1O94964 1423 aa24.46■■□□□ 1.51
ILKAP-208ENST00000479400 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
ILKAP-208ENST00000479400 FBLN2P98095 1184 aa24.39■■□□□ 1.49
ILKAP-208ENST00000479400 CHD1O14646 1710 aa24.36■■□□□ 1.49
ILKAP-208ENST00000479400 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.3■■□□□ 1.48
ILKAP-208ENST00000479400 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.3■■□□□ 1.48
ILKAP-208ENST00000479400 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.3■■□□□ 1.48
ILKAP-208ENST00000479400 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.27■■□□□ 1.48
ILKAP-208ENST00000479400 WDR97A6NE52 1622 aa24.24■■□□□ 1.47
ILKAP-208ENST00000479400 ARHGEF11O15085 1522 aa24.22■■□□□ 1.47
ILKAP-208ENST00000479400 GRIN2BQ13224 1484 aa24.19■■□□□ 1.46
ILKAP-208ENST00000479400 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ILKAP-208ENST00000479400 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.16■■□□□ 1.46
ILKAP-208ENST00000479400 PBRM1Q86U86 1689 aa24.15■■□□□ 1.46
ILKAP-208ENST00000479400 SYNJ1O43426 1573 aa24.15■■□□□ 1.46
ILKAP-208ENST00000479400 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
ILKAP-208ENST00000479400 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ILKAP-208ENST00000479400 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.13■■□□□ 1.45
ILKAP-208ENST00000479400 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.11■■□□□ 1.45
ILKAP-208ENST00000479400 TOP2BQ02880 1626 aa24.1■■□□□ 1.45
ILKAP-208ENST00000479400 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.1■■□□□ 1.45
ILKAP-208ENST00000479400 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.1■■□□□ 1.45
ILKAP-208ENST00000479400 SYNJ2O15056 1496 aa24.07■■□□□ 1.44
ILKAP-208ENST00000479400 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.03■■□□□ 1.44
ILKAP-208ENST00000479400 ARAP1Q96P48 1450 aa24.01■■□□□ 1.43
ILKAP-208ENST00000479400 ADAMTS12P58397 1594 aa23.91■■□□□ 1.42
ILKAP-208ENST00000479400 GRIN2AQ12879 1464 aa23.89■■□□□ 1.42
ILKAP-208ENST00000479400 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.84■■□□□ 1.41
ILKAP-208ENST00000479400 CEP170Q5SW79 1584 aa23.82■■□□□ 1.4
ILKAP-208ENST00000479400 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.82■■□□□ 1.4
ILKAP-208ENST00000479400 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
ILKAP-208ENST00000479400 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.78■■□□□ 1.4
ILKAP-208ENST00000479400 NUP160Q12769 1436 aa23.77■■□□□ 1.4
ILKAP-208ENST00000479400 KIF27Q86VH2 1401 aa23.65■■□□□ 1.38
ILKAP-208ENST00000479400 IGF1RP08069 1367 aa23.63■■□□□ 1.37
ILKAP-208ENST00000479400 SHROOM2Q13796 1616 aa23.62■■□□□ 1.37
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