RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477938.5

LYPLAL1-208, Transcript of lysophospholipase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene LYPLAL1, Length 1,715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPLAL1-208ENST00000477938 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.27■■■■■ 4.2
LYPLAL1-208ENST00000477938 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.34■■■■□ 3.41
LYPLAL1-208ENST00000477938 ABCC9O60706 1549 aa34.82■■■■□ 3.16
LYPLAL1-208ENST00000477938 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
LYPLAL1-208ENST00000477938 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.27■■■■□ 3.08
LYPLAL1-208ENST00000477938 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.17■■■■□ 3.06
LYPLAL1-208ENST00000477938 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.01■■■■□ 3.04
LYPLAL1-208ENST00000477938 NACADO15069 1562 aa33.98■■■■□ 3.03
LYPLAL1-208ENST00000477938 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.84■■■■□ 3.01
LYPLAL1-208ENST00000477938 SCRIBQ14160 1630 aa33.25■■■□□ 2.91
LYPLAL1-208ENST00000477938 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.15■■■□□ 2.9
LYPLAL1-208ENST00000477938 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.06■■■□□ 2.88
LYPLAL1-208ENST00000477938 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.74■■■□□ 2.83
LYPLAL1-208ENST00000477938 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.68■■■□□ 2.82
LYPLAL1-208ENST00000477938 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.05■■■□□ 2.72
LYPLAL1-208ENST00000477938 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
LYPLAL1-208ENST00000477938 SMARCA4P51532 1647 aa31.86■■■□□ 2.69
LYPLAL1-208ENST00000477938 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
LYPLAL1-208ENST00000477938 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
LYPLAL1-208ENST00000477938 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
LYPLAL1-208ENST00000477938 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
LYPLAL1-208ENST00000477938 WIZO95785 1651 aa31.53■■■□□ 2.64
LYPLAL1-208ENST00000477938 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.52■■■□□ 2.64
LYPLAL1-208ENST00000477938 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.51■■■□□ 2.64
LYPLAL1-208ENST00000477938 SMARCA2P51531 1590 aa31.5■■■□□ 2.63
LYPLAL1-208ENST00000477938 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.47■■■□□ 2.63
LYPLAL1-208ENST00000477938 NCAPD3P42695 1498 aa31.33■■■□□ 2.61
LYPLAL1-208ENST00000477938 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
LYPLAL1-208ENST00000477938 HMGXB3Q12766 1538 aa31.26■■■□□ 2.6
LYPLAL1-208ENST00000477938 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
LYPLAL1-208ENST00000477938 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.18■■■□□ 2.58
LYPLAL1-208ENST00000477938 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.87■■■□□ 2.53
LYPLAL1-208ENST00000477938 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.49■■■□□ 2.47
LYPLAL1-208ENST00000477938 CFTRP13569 1480 aa30.46■■■□□ 2.47
LYPLAL1-208ENST00000477938 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.4■■■□□ 2.46
LYPLAL1-208ENST00000477938 NESP48681 1621 aa30.35■■■□□ 2.45
LYPLAL1-208ENST00000477938 PRDM2Q13029 1718 aa30.31■■■□□ 2.44
LYPLAL1-208ENST00000477938 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.2■■■□□ 2.42
LYPLAL1-208ENST00000477938 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.14■■■□□ 2.42
LYPLAL1-208ENST00000477938 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.04■■■□□ 2.4
LYPLAL1-208ENST00000477938 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.02■■■□□ 2.4
LYPLAL1-208ENST00000477938 ABCC8Q09428 1581 aa30■■■□□ 2.39
LYPLAL1-208ENST00000477938 ERCC6Q03468 1493 aa29.99■■■□□ 2.39
LYPLAL1-208ENST00000477938 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
LYPLAL1-208ENST00000477938 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.93■■■□□ 2.38
LYPLAL1-208ENST00000477938 TRIM41Q8WV44 630 aa29.84■■■□□ 2.37
LYPLAL1-208ENST00000477938 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.81■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 SYNJ1O43426 1573 aa29.8■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 CUX1P39880 1505 aa29.8■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.78■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 TOP2BQ02880 1626 aa29.77■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.75■■■□□ 2.35
LYPLAL1-208ENST00000477938 TOPBP1Q92547 1522 aa29.74■■■□□ 2.35
LYPLAL1-208ENST00000477938 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
LYPLAL1-208ENST00000477938 WDR62O43379 1518 aa29.67■■■□□ 2.34
LYPLAL1-208ENST00000477938 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.59■■■□□ 2.33
LYPLAL1-208ENST00000477938 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
LYPLAL1-208ENST00000477938 SOGA1O94964 1423 aa29.46■■■□□ 2.31
LYPLAL1-208ENST00000477938 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.4■■■□□ 2.3
LYPLAL1-208ENST00000477938 CUX2O14529 1486 aa29.4■■■□□ 2.3
LYPLAL1-208ENST00000477938 IFT140Q96RY7 1462 aa29.36■■■□□ 2.29
LYPLAL1-208ENST00000477938 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
LYPLAL1-208ENST00000477938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.33■■■□□ 2.29
LYPLAL1-208ENST00000477938 WDR97A6NE52 1622 aa29.28■■■□□ 2.28
LYPLAL1-208ENST00000477938 KIF27Q86VH2 1401 aa29.27■■■□□ 2.28
LYPLAL1-208ENST00000477938 EEA1Q15075 1411 aa29.24■■■□□ 2.27
LYPLAL1-208ENST00000477938 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.2■■■□□ 2.27
LYPLAL1-208ENST00000477938 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
LYPLAL1-208ENST00000477938 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
LYPLAL1-208ENST00000477938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
LYPLAL1-208ENST00000477938 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.14■■■□□ 2.26
LYPLAL1-208ENST00000477938 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.13■■■□□ 2.25
LYPLAL1-208ENST00000477938 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
LYPLAL1-208ENST00000477938 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
LYPLAL1-208ENST00000477938 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.08■■■□□ 2.25
LYPLAL1-208ENST00000477938 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.01■■■□□ 2.24
LYPLAL1-208ENST00000477938 IGF1RP08069 1367 aa29.01■■■□□ 2.23
LYPLAL1-208ENST00000477938 PBRM1Q86U86 1689 aa29.01■■■□□ 2.23
LYPLAL1-208ENST00000477938 GRIN2BQ13224 1484 aa29.01■■■□□ 2.23
LYPLAL1-208ENST00000477938 CUL7Q14999 1698 aa28.92■■■□□ 2.22
LYPLAL1-208ENST00000477938 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.88■■■□□ 2.21
LYPLAL1-208ENST00000477938 PRXQ9BXM0 1461 aa28.87■■■□□ 2.21
LYPLAL1-208ENST00000477938 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.85■■■□□ 2.21
LYPLAL1-208ENST00000477938 KIF21BO75037 1637 aa28.85■■■□□ 2.21
LYPLAL1-208ENST00000477938 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
LYPLAL1-208ENST00000477938 ADAMTS12P58397 1594 aa28.82■■■□□ 2.2
LYPLAL1-208ENST00000477938 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.81■■■□□ 2.2
LYPLAL1-208ENST00000477938 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.8■■■□□ 2.2
LYPLAL1-208ENST00000477938 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.78■■■□□ 2.2
LYPLAL1-208ENST00000477938 GOLGA3Q08378 1498 aa28.78■■■□□ 2.2
LYPLAL1-208ENST00000477938 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.73■■■□□ 2.19
LYPLAL1-208ENST00000477938 SYNJ2O15056 1496 aa28.73■■■□□ 2.19
LYPLAL1-208ENST00000477938 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
LYPLAL1-208ENST00000477938 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
LYPLAL1-208ENST00000477938 FBLN2P98095 1184 aa28.67■■■□□ 2.18
LYPLAL1-208ENST00000477938 GRIN2AQ12879 1464 aa28.64■■■□□ 2.17
LYPLAL1-208ENST00000477938 CHD1O14646 1710 aa28.57■■■□□ 2.16
LYPLAL1-208ENST00000477938 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.54■■■□□ 2.16
LYPLAL1-208ENST00000477938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms