RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477938.5

LYPLAL1-208, Transcript of lysophospholipase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene LYPLAL1, Length 1,715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPLAL1-208ENST00000477938 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.27■■■■■ 4.2
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LYPLAL1-208ENST00000477938 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.01■■■■□ 3.04
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LYPLAL1-208ENST00000477938 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.84■■■■□ 3.01
LYPLAL1-208ENST00000477938 SCRIBQ14160 1630 aa33.25■■■□□ 2.91
LYPLAL1-208ENST00000477938 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.15■■■□□ 2.9
LYPLAL1-208ENST00000477938 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.06■■■□□ 2.88
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LYPLAL1-208ENST00000477938 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.05■■■□□ 2.72
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LYPLAL1-208ENST00000477938 SMARCA4P51532 1647 aa31.86■■■□□ 2.69
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LYPLAL1-208ENST00000477938 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
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LYPLAL1-208ENST00000477938 WIZO95785 1651 aa31.53■■■□□ 2.64
LYPLAL1-208ENST00000477938 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.52■■■□□ 2.64
LYPLAL1-208ENST00000477938 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.51■■■□□ 2.64
LYPLAL1-208ENST00000477938 SMARCA2P51531 1590 aa31.5■■■□□ 2.63
LYPLAL1-208ENST00000477938 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.47■■■□□ 2.63
LYPLAL1-208ENST00000477938 NCAPD3P42695 1498 aa31.33■■■□□ 2.61
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LYPLAL1-208ENST00000477938 CFTRP13569 1480 aa30.46■■■□□ 2.47
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LYPLAL1-208ENST00000477938 NESP48681 1621 aa30.35■■■□□ 2.45
LYPLAL1-208ENST00000477938 PRDM2Q13029 1718 aa30.31■■■□□ 2.44
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LYPLAL1-208ENST00000477938 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.14■■■□□ 2.42
LYPLAL1-208ENST00000477938 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.04■■■□□ 2.4
LYPLAL1-208ENST00000477938 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.02■■■□□ 2.4
LYPLAL1-208ENST00000477938 ABCC8Q09428 1581 aa30■■■□□ 2.39
LYPLAL1-208ENST00000477938 ERCC6Q03468 1493 aa29.99■■■□□ 2.39
LYPLAL1-208ENST00000477938 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
LYPLAL1-208ENST00000477938 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.93■■■□□ 2.38
LYPLAL1-208ENST00000477938 TRIM41Q8WV44 630 aa29.84■■■□□ 2.37
LYPLAL1-208ENST00000477938 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.81■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 SYNJ1O43426 1573 aa29.8■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 CUX1P39880 1505 aa29.8■■■□□ 2.36
LYPLAL1-208ENST00000477938 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.78■■■□□ 2.36
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LYPLAL1-208ENST00000477938 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.75■■■□□ 2.35
LYPLAL1-208ENST00000477938 TOPBP1Q92547 1522 aa29.74■■■□□ 2.35
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LYPLAL1-208ENST00000477938 IFT140Q96RY7 1462 aa29.36■■■□□ 2.29
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LYPLAL1-208ENST00000477938 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.33■■■□□ 2.29
LYPLAL1-208ENST00000477938 WDR97A6NE52 1622 aa29.28■■■□□ 2.28
LYPLAL1-208ENST00000477938 KIF27Q86VH2 1401 aa29.27■■■□□ 2.28
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LYPLAL1-208ENST00000477938 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
LYPLAL1-208ENST00000477938 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
LYPLAL1-208ENST00000477938 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.14■■■□□ 2.26
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LYPLAL1-208ENST00000477938 PBRM1Q86U86 1689 aa29.01■■■□□ 2.23
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LYPLAL1-208ENST00000477938 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.85■■■□□ 2.21
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LYPLAL1-208ENST00000477938 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.73■■■□□ 2.19
LYPLAL1-208ENST00000477938 SYNJ2O15056 1496 aa28.73■■■□□ 2.19
LYPLAL1-208ENST00000477938 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
LYPLAL1-208ENST00000477938 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
LYPLAL1-208ENST00000477938 FBLN2P98095 1184 aa28.67■■■□□ 2.18
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LYPLAL1-208ENST00000477938 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.49■■■□□ 2.15
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