RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477375.5

IMP4-215, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene IMP4, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-215ENST00000477375 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.41■■■■■ 4.38
IMP4-215ENST00000477375 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.72■■■■□ 3.63
IMP4-215ENST00000477375 ABCC9O60706 1549 aa36.92■■■■□ 3.5
IMP4-215ENST00000477375 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.46■■■■□ 3.27
IMP4-215ENST00000477375 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.43■■■■□ 3.26
IMP4-215ENST00000477375 NACADO15069 1562 aa35.41■■■■□ 3.26
IMP4-215ENST00000477375 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
IMP4-215ENST00000477375 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.15■■■■□ 3.22
IMP4-215ENST00000477375 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.03■■■■□ 3.2
IMP4-215ENST00000477375 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.9■■■■□ 3.18
IMP4-215ENST00000477375 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.5■■■■□ 3.11
IMP4-215ENST00000477375 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
IMP4-215ENST00000477375 SCRIBQ14160 1630 aa34.47■■■■□ 3.11
IMP4-215ENST00000477375 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.95■■■■□ 3.03
IMP4-215ENST00000477375 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.91■■■■□ 3.02
IMP4-215ENST00000477375 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
IMP4-215ENST00000477375 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.42■■■□□ 2.94
IMP4-215ENST00000477375 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.12■■■□□ 2.89
IMP4-215ENST00000477375 SMARCA4P51532 1647 aa32.95■■■□□ 2.87
IMP4-215ENST00000477375 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
IMP4-215ENST00000477375 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.75■■■□□ 2.83
IMP4-215ENST00000477375 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.72■■■□□ 2.83
IMP4-215ENST00000477375 NCAPD3P42695 1498 aa32.67■■■□□ 2.82
IMP4-215ENST00000477375 SMARCA2P51531 1590 aa32.64■■■□□ 2.82
IMP4-215ENST00000477375 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.58■■■□□ 2.81
IMP4-215ENST00000477375 HMGXB3Q12766 1538 aa32.51■■■□□ 2.79
IMP4-215ENST00000477375 WIZO95785 1651 aa32.46■■■□□ 2.79
IMP4-215ENST00000477375 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
IMP4-215ENST00000477375 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
IMP4-215ENST00000477375 NESP48681 1621 aa32■■■□□ 2.71
IMP4-215ENST00000477375 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
IMP4-215ENST00000477375 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.82■■■□□ 2.68
IMP4-215ENST00000477375 ERCC6Q03468 1493 aa31.73■■■□□ 2.67
IMP4-215ENST00000477375 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.7■■■□□ 2.67
IMP4-215ENST00000477375 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.68■■■□□ 2.66
IMP4-215ENST00000477375 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.64■■■□□ 2.66
IMP4-215ENST00000477375 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.54■■■□□ 2.64
IMP4-215ENST00000477375 CFTRP13569 1480 aa31.53■■■□□ 2.64
IMP4-215ENST00000477375 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
IMP4-215ENST00000477375 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
IMP4-215ENST00000477375 PRDM2Q13029 1718 aa31.46■■■□□ 2.63
IMP4-215ENST00000477375 CUX2O14529 1486 aa31.38■■■□□ 2.61
IMP4-215ENST00000477375 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.37■■■□□ 2.61
IMP4-215ENST00000477375 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.31■■■□□ 2.6
IMP4-215ENST00000477375 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.27■■■□□ 2.6
IMP4-215ENST00000477375 WDR62O43379 1518 aa31.19■■■□□ 2.58
IMP4-215ENST00000477375 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
IMP4-215ENST00000477375 TOPBP1Q92547 1522 aa30.9■■■□□ 2.54
IMP4-215ENST00000477375 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.86■■■□□ 2.53
IMP4-215ENST00000477375 ABCC8Q09428 1581 aa30.79■■■□□ 2.52
IMP4-215ENST00000477375 CUX1P39880 1505 aa30.71■■■□□ 2.51
IMP4-215ENST00000477375 IFT140Q96RY7 1462 aa30.63■■■□□ 2.49
IMP4-215ENST00000477375 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
IMP4-215ENST00000477375 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
IMP4-215ENST00000477375 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
IMP4-215ENST00000477375 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.57■■■□□ 2.48
IMP4-215ENST00000477375 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.55■■■□□ 2.48
IMP4-215ENST00000477375 SOGA1O94964 1423 aa30.48■■■□□ 2.47
IMP4-215ENST00000477375 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
IMP4-215ENST00000477375 SYNJ1O43426 1573 aa30.47■■■□□ 2.47
IMP4-215ENST00000477375 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.46■■■□□ 2.47
IMP4-215ENST00000477375 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.45■■■□□ 2.47
IMP4-215ENST00000477375 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
IMP4-215ENST00000477375 TOP2BQ02880 1626 aa30.42■■■□□ 2.46
IMP4-215ENST00000477375 WDR97A6NE52 1622 aa30.4■■■□□ 2.46
IMP4-215ENST00000477375 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.465e-7■■■■■ 37.2
IMP4-215ENST00000477375 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
IMP4-215ENST00000477375 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.23■■■□□ 2.43
IMP4-215ENST00000477375 PBRM1Q86U86 1689 aa30.2■■■□□ 2.42
IMP4-215ENST00000477375 CHD1O14646 1710 aa30.19■■■□□ 2.42
IMP4-215ENST00000477375 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.18■■■□□ 2.42
IMP4-215ENST00000477375 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.13■■■□□ 2.41
IMP4-215ENST00000477375 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.11■■■□□ 2.41
IMP4-215ENST00000477375 GRIN2BQ13224 1484 aa30.1■■■□□ 2.41
IMP4-215ENST00000477375 OSCARQ8IYS5 282 aa30.09■■■□□ 2.41
IMP4-215ENST00000477375 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
IMP4-215ENST00000477375 FBLN2P98095 1184 aa29.99■■■□□ 2.39
IMP4-215ENST00000477375 SYNJ2O15056 1496 aa29.91■■■□□ 2.38
IMP4-215ENST00000477375 ADAMTS12P58397 1594 aa29.88■■■□□ 2.37
IMP4-215ENST00000477375 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
IMP4-215ENST00000477375 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.86■■■□□ 2.37
IMP4-215ENST00000477375 KIF27Q86VH2 1401 aa29.77■■■□□ 2.36
IMP4-215ENST00000477375 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.76■■■□□ 2.35
IMP4-215ENST00000477375 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.75■■■□□ 2.35
IMP4-215ENST00000477375 GRIN2AQ12879 1464 aa29.74■■■□□ 2.35
IMP4-215ENST00000477375 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.74■■■□□ 2.35
IMP4-215ENST00000477375 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.74■■■□□ 2.35
IMP4-215ENST00000477375 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.74■■■□□ 2.35
IMP4-215ENST00000477375 TRIM41Q8WV44 630 aa29.7■■■□□ 2.35
IMP4-215ENST00000477375 IGF1RP08069 1367 aa29.69■■■□□ 2.34
IMP4-215ENST00000477375 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.67■■■□□ 2.34
IMP4-215ENST00000477375 CEP170Q5SW79 1584 aa29.67■■■□□ 2.34
IMP4-215ENST00000477375 ARHGEF11O15085 1522 aa29.66■■■□□ 2.34
IMP4-215ENST00000477375 CUL7Q14999 1698 aa29.63■■■□□ 2.33
IMP4-215ENST00000477375 NUP160Q12769 1436 aa29.61■■■□□ 2.33
IMP4-215ENST00000477375 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.51■■■□□ 2.31
IMP4-215ENST00000477375 ARAP1Q96P48 1450 aa29.45■■■□□ 2.31
IMP4-215ENST00000477375 SHROOM2Q13796 1616 aa29.45■■■□□ 2.3
IMP4-215ENST00000477375 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.43■■■□□ 2.3
IMP4-215ENST00000477375 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.43■■■□□ 2.3
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