RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, humanhuman

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIL-208ENST00000477216 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.72■■■■■ 7.31
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SKIL-208ENST00000477216 PRDM2Q13029 1718 aa45.33■■■■■ 4.85
SKIL-208ENST00000477216 IFT140Q96RY7 1462 aa45.22■■■■■ 4.83
SKIL-208ENST00000477216 ABCC8Q09428 1581 aa45.08■■■■■ 4.81
SKIL-208ENST00000477216 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.05■■■■■ 4.8
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SKIL-208ENST00000477216 CCDC88BA6NC98 1476 aa45■■■■■ 4.79
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SKIL-208ENST00000477216 ARHGEF11O15085 1522 aa44.9■■■■■ 4.78
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SKIL-208ENST00000477216 ARAP1Q96P48 1450 aa44.35■■■■■ 4.69
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SKIL-208ENST00000477216 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.2■■■■■ 4.67
SKIL-208ENST00000477216 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
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SKIL-208ENST00000477216 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
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SKIL-208ENST00000477216 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.08■■■■■ 4.65
SKIL-208ENST00000477216 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.05■■■■■ 4.64
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SKIL-208ENST00000477216 JPH4Q96JJ6 628 aa42.88■■■■■ 4.45
SKIL-208ENST00000477216 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.45
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