RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476479.1

LANCL2-204, Transcript of LanC like 2, humanhuman

TSL 4

Gene LANCL2, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL2-204ENST00000476479 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.91■■■□□ 2.22
LANCL2-204ENST00000476479 ABCC9O60706 1549 aa26.38■■□□□ 1.81
LANCL2-204ENST00000476479 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.93■■□□□ 1.74
LANCL2-204ENST00000476479 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25■■□□□ 1.59
LANCL2-204ENST00000476479 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
LANCL2-204ENST00000476479 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.77■■□□□ 1.56
LANCL2-204ENST00000476479 NACADO15069 1562 aa24.63■■□□□ 1.53
LANCL2-204ENST00000476479 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
LANCL2-204ENST00000476479 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.27■■□□□ 1.48
LANCL2-204ENST00000476479 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.16■■□□□ 1.46
LANCL2-204ENST00000476479 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.15■■□□□ 1.46
LANCL2-204ENST00000476479 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
LANCL2-204ENST00000476479 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.77■■□□□ 1.4
LANCL2-204ENST00000476479 SCRIBQ14160 1630 aa23.77■■□□□ 1.4
LANCL2-204ENST00000476479 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.75■■□□□ 1.39
LANCL2-204ENST00000476479 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.73■■□□□ 1.39
LANCL2-204ENST00000476479 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.71■■□□□ 1.39
LANCL2-204ENST00000476479 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
LANCL2-204ENST00000476479 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.08■■□□□ 1.29
LANCL2-204ENST00000476479 ERCC6Q03468 1493 aa22.79■■□□□ 1.24
LANCL2-204ENST00000476479 NCAPD3P42695 1498 aa22.78■■□□□ 1.24
LANCL2-204ENST00000476479 CUX2O14529 1486 aa22.72■■□□□ 1.23
LANCL2-204ENST00000476479 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.7■■□□□ 1.22
LANCL2-204ENST00000476479 SMARCA2P51531 1590 aa22.59■■□□□ 1.21
LANCL2-204ENST00000476479 NESP48681 1621 aa22.58■■□□□ 1.21
LANCL2-204ENST00000476479 SMARCA4P51532 1647 aa22.58■■□□□ 1.21
LANCL2-204ENST00000476479 HMGXB3Q12766 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
LANCL2-204ENST00000476479 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LANCL2-204ENST00000476479 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
LANCL2-204ENST00000476479 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.31■■□□□ 1.16
LANCL2-204ENST00000476479 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.29■■□□□ 1.16
LANCL2-204ENST00000476479 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LANCL2-204ENST00000476479 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.26■■□□□ 1.15
LANCL2-204ENST00000476479 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
LANCL2-204ENST00000476479 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.19■■□□□ 1.14
LANCL2-204ENST00000476479 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
LANCL2-204ENST00000476479 TRIM41Q8WV44 630 aa22.09■■□□□ 1.13
LANCL2-204ENST00000476479 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.03■■□□□ 1.12
LANCL2-204ENST00000476479 WIZO95785 1651 aa22.02■■□□□ 1.12
LANCL2-204ENST00000476479 WDR62O43379 1518 aa21.93■■□□□ 1.1
LANCL2-204ENST00000476479 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.9■■□□□ 1.1
LANCL2-204ENST00000476479 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.87■■□□□ 1.09
LANCL2-204ENST00000476479 CFTRP13569 1480 aa21.78■■□□□ 1.08
LANCL2-204ENST00000476479 OSCARQ8IYS5 282 aa21.77■■□□□ 1.08
LANCL2-204ENST00000476479 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LANCL2-204ENST00000476479 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LANCL2-204ENST00000476479 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
LANCL2-204ENST00000476479 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.52■■□□□ 1.03
LANCL2-204ENST00000476479 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
LANCL2-204ENST00000476479 IFT140Q96RY7 1462 aa21.46■■□□□ 1.03
LANCL2-204ENST00000476479 PRDM2Q13029 1718 aa21.43■■□□□ 1.02
LANCL2-204ENST00000476479 TOPBP1Q92547 1522 aa21.42■■□□□ 1.02
LANCL2-204ENST00000476479 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.41■■□□□ 1.02
LANCL2-204ENST00000476479 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.41■■□□□ 1.02
LANCL2-204ENST00000476479 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.41■■□□□ 1.02
LANCL2-204ENST00000476479 ARHGEF11O15085 1522 aa21.34■■□□□ 1.01
LANCL2-204ENST00000476479 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.33■■□□□ 1.01
LANCL2-204ENST00000476479 FBLN2P98095 1184 aa21.32■■□□□ 1
LANCL2-204ENST00000476479 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
LANCL2-204ENST00000476479 ABCC8Q09428 1581 aa21.31■■□□□ 1
LANCL2-204ENST00000476479 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
LANCL2-204ENST00000476479 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.28■■□□□ 1
LANCL2-204ENST00000476479 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
LANCL2-204ENST00000476479 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
LANCL2-204ENST00000476479 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
LANCL2-204ENST00000476479 CHD1O14646 1710 aa21.18■□□□□ 0.98
LANCL2-204ENST00000476479 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.18■□□□□ 0.98
LANCL2-204ENST00000476479 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
LANCL2-204ENST00000476479 SOGA1O94964 1423 aa21.13■□□□□ 0.97
LANCL2-204ENST00000476479 ARAP1Q96P48 1450 aa21.13■□□□□ 0.97
LANCL2-204ENST00000476479 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
LANCL2-204ENST00000476479 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.04■□□□□ 0.96
LANCL2-204ENST00000476479 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.03■□□□□ 0.96
LANCL2-204ENST00000476479 CUX1P39880 1505 aa20.97■□□□□ 0.95
LANCL2-204ENST00000476479 GRIN2BQ13224 1484 aa20.93■□□□□ 0.94
LANCL2-204ENST00000476479 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
LANCL2-204ENST00000476479 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.92■□□□□ 0.94
LANCL2-204ENST00000476479 SYNJ1O43426 1573 aa20.9■□□□□ 0.94
LANCL2-204ENST00000476479 WDR97A6NE52 1622 aa20.88■□□□□ 0.93
LANCL2-204ENST00000476479 SYNJ2O15056 1496 aa20.88■□□□□ 0.93
LANCL2-204ENST00000476479 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.84■□□□□ 0.93
LANCL2-204ENST00000476479 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
LANCL2-204ENST00000476479 PBRM1Q86U86 1689 aa20.77■□□□□ 0.91
LANCL2-204ENST00000476479 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
LANCL2-204ENST00000476479 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.74■□□□□ 0.91
LANCL2-204ENST00000476479 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.69■□□□□ 0.9
LANCL2-204ENST00000476479 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
LANCL2-204ENST00000476479 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.66■□□□□ 0.9
LANCL2-204ENST00000476479 GRIN2AQ12879 1464 aa20.65■□□□□ 0.9
LANCL2-204ENST00000476479 NUP160Q12769 1436 aa20.58■□□□□ 0.88
LANCL2-204ENST00000476479 ADAMTS12P58397 1594 aa20.58■□□□□ 0.88
LANCL2-204ENST00000476479 CEP170Q5SW79 1584 aa20.58■□□□□ 0.88
LANCL2-204ENST00000476479 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.55■□□□□ 0.88
LANCL2-204ENST00000476479 TOP2BQ02880 1626 aa20.52■□□□□ 0.88
LANCL2-204ENST00000476479 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.49■□□□□ 0.87
LANCL2-204ENST00000476479 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LANCL2-204ENST00000476479 JPH4Q96JJ6 628 aa20.47■□□□□ 0.87
LANCL2-204ENST00000476479 SHROOM2Q13796 1616 aa20.45■□□□□ 0.87
LANCL2-204ENST00000476479 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.45■□□□□ 0.86
LANCL2-204ENST00000476479 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms