RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476243.5

CENPV-203, Transcript of centromere protein V, humanhuman

TSL 5

Gene CENPV, Length 1,770 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPV-203ENST00000476243 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.16■■■■■ 5.62
CENPV-203ENST00000476243 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.03■■■■■ 4.64
CENPV-203ENST00000476243 ABCC9O60706 1549 aa42.1■■■■■ 4.33
CENPV-203ENST00000476243 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CENPV-203ENST00000476243 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.49■■■■■ 4.23
CENPV-203ENST00000476243 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.4■■■■■ 4.22
CENPV-203ENST00000476243 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
CENPV-203ENST00000476243 NACADO15069 1562 aa41.11■■■■■ 4.17
CENPV-203ENST00000476243 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.87■■■■■ 4.13
CENPV-203ENST00000476243 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.4■■■■■ 4.06
CENPV-203ENST00000476243 SCRIBQ14160 1630 aa40.37■■■■■ 4.05
CENPV-203ENST00000476243 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.14■■■■■ 4.02
CENPV-203ENST00000476243 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.77■■■■□ 3.96
CENPV-203ENST00000476243 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.55■■■■□ 3.92
CENPV-203ENST00000476243 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.04■■■■□ 3.84
CENPV-203ENST00000476243 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.75■■■■□ 3.79
CENPV-203ENST00000476243 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
CENPV-203ENST00000476243 SMARCA4P51532 1647 aa38.7■■■■□ 3.79
CENPV-203ENST00000476243 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
CENPV-203ENST00000476243 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
CENPV-203ENST00000476243 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
CENPV-203ENST00000476243 WIZO95785 1651 aa38.39■■■■□ 3.74
CENPV-203ENST00000476243 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.29■■■■□ 3.72
CENPV-203ENST00000476243 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.2■■■■□ 3.71
CENPV-203ENST00000476243 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.13■■■■□ 3.69
CENPV-203ENST00000476243 SMARCA2P51531 1590 aa38.12■■■■□ 3.69
CENPV-203ENST00000476243 NCAPD3P42695 1498 aa37.97■■■■□ 3.67
CENPV-203ENST00000476243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
CENPV-203ENST00000476243 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
CENPV-203ENST00000476243 HMGXB3Q12766 1538 aa37.87■■■■□ 3.65
CENPV-203ENST00000476243 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.73■■■■□ 3.63
CENPV-203ENST00000476243 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.56■■■■□ 3.6
CENPV-203ENST00000476243 CFTRP13569 1480 aa36.96■■■■□ 3.51
CENPV-203ENST00000476243 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.91■■■■□ 3.5
CENPV-203ENST00000476243 NESP48681 1621 aa36.83■■■■□ 3.49
CENPV-203ENST00000476243 PRDM2Q13029 1718 aa36.75■■■■□ 3.47
CENPV-203ENST00000476243 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.74■■■■□ 3.47
CENPV-203ENST00000476243 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.64■■■■□ 3.46
CENPV-203ENST00000476243 ABCC8Q09428 1581 aa36.59■■■■□ 3.45
CENPV-203ENST00000476243 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.5■■■■□ 3.43
CENPV-203ENST00000476243 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.42■■■■□ 3.42
CENPV-203ENST00000476243 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.39■■■■□ 3.42
CENPV-203ENST00000476243 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.41
CENPV-203ENST00000476243 SYNJ1O43426 1573 aa36.33■■■■□ 3.41
CENPV-203ENST00000476243 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.32■■■■□ 3.4
CENPV-203ENST00000476243 CUX1P39880 1505 aa36.27■■■■□ 3.4
CENPV-203ENST00000476243 TRIM41Q8WV44 630 aa36.25■■■■□ 3.39
CENPV-203ENST00000476243 TOP2BQ02880 1626 aa36.2■■■■□ 3.39
CENPV-203ENST00000476243 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.19■■■■□ 3.38
CENPV-203ENST00000476243 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
CENPV-203ENST00000476243 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.09■■■■□ 3.37
CENPV-203ENST00000476243 ERCC6Q03468 1493 aa36.09■■■■□ 3.37
CENPV-203ENST00000476243 TOPBP1Q92547 1522 aa36.08■■■■□ 3.37
CENPV-203ENST00000476243 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.04■■■■□ 3.36
CENPV-203ENST00000476243 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
CENPV-203ENST00000476243 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.93■■■■□ 3.34
CENPV-203ENST00000476243 WDR62O43379 1518 aa35.93■■■■□ 3.34
CENPV-203ENST00000476243 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
CENPV-203ENST00000476243 SOGA1O94964 1423 aa35.77■■■■□ 3.32
CENPV-203ENST00000476243 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.73■■■■□ 3.31
CENPV-203ENST00000476243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.7■■■■□ 3.31
CENPV-203ENST00000476243 CUX2O14529 1486 aa35.7■■■■□ 3.3
CENPV-203ENST00000476243 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CENPV-203ENST00000476243 WDR97A6NE52 1622 aa35.61■■■■□ 3.29
CENPV-203ENST00000476243 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.61■■■■□ 3.29
CENPV-203ENST00000476243 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CENPV-203ENST00000476243 EEA1Q15075 1411 aa35.5■■■■□ 3.27
CENPV-203ENST00000476243 IFT140Q96RY7 1462 aa35.49■■■■□ 3.27
CENPV-203ENST00000476243 KIF27Q86VH2 1401 aa35.48■■■■□ 3.27
CENPV-203ENST00000476243 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.41■■■■□ 3.26
CENPV-203ENST00000476243 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
CENPV-203ENST00000476243 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
CENPV-203ENST00000476243 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.35■■■■□ 3.25
CENPV-203ENST00000476243 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.29■■■■□ 3.24
CENPV-203ENST00000476243 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.242e-7■■■■□ 22.7
CENPV-203ENST00000476243 IGF1RP08069 1367 aa35.28■■■■□ 3.24
CENPV-203ENST00000476243 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CENPV-203ENST00000476243 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.2■■■■□ 3.23
CENPV-203ENST00000476243 PRXQ9BXM0 1461 aa35.18■■■■□ 3.22
CENPV-203ENST00000476243 PBRM1Q86U86 1689 aa35.17■■■■□ 3.22
CENPV-203ENST00000476243 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.17■■■■□ 3.22
CENPV-203ENST00000476243 KIF21BO75037 1637 aa35.15■■■■□ 3.22
CENPV-203ENST00000476243 GRIN2BQ13224 1484 aa35.1■■■■□ 3.21
CENPV-203ENST00000476243 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.07■■■■□ 3.2
CENPV-203ENST00000476243 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.06■■■■□ 3.2
CENPV-203ENST00000476243 CUL7Q14999 1698 aa35.05■■■■□ 3.2
CENPV-203ENST00000476243 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.05■■■■□ 3.2
CENPV-203ENST00000476243 GOLGA3Q08378 1498 aa35■■■■□ 3.19
CENPV-203ENST00000476243 ADAMTS12P58397 1594 aa34.97■■■■□ 3.19
CENPV-203ENST00000476243 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.96■■■■□ 3.19
CENPV-203ENST00000476243 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.89■■■■□ 3.18
CENPV-203ENST00000476243 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
CENPV-203ENST00000476243 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.78■■■■□ 3.16
CENPV-203ENST00000476243 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
CENPV-203ENST00000476243 SYNJ2O15056 1496 aa34.75■■■■□ 3.15
CENPV-203ENST00000476243 GRIN2AQ12879 1464 aa34.7■■■■□ 3.15
CENPV-203ENST00000476243 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.59■■■■□ 3.13
CENPV-203ENST00000476243 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CENPV-203ENST00000476243 CHD1O14646 1710 aa34.59■■■■□ 3.13
CENPV-203ENST00000476243 CEP162Q5TB80 1403 aa34.57■■■■□ 3.12
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