RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476070.1

CERKL-211, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 4

Gene CERKL, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-211ENST00000476070 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.01■■■□□ 2.72
CERKL-211ENST00000476070 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CERKL-211ENST00000476070 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.31■■■□□ 2.28
CERKL-211ENST00000476070 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.58■■■□□ 2.17
CERKL-211ENST00000476070 ABCC9O60706 1549 aa28.31■■■□□ 2.12
CERKL-211ENST00000476070 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.01■■□□□ 1.91
CERKL-211ENST00000476070 NACADO15069 1562 aa26.9■■□□□ 1.9
CERKL-211ENST00000476070 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.79■■□□□ 1.88
CERKL-211ENST00000476070 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CERKL-211ENST00000476070 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.63■■□□□ 1.85
CERKL-211ENST00000476070 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
CERKL-211ENST00000476070 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.56■■□□□ 1.84
CERKL-211ENST00000476070 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.42■■□□□ 1.82
CERKL-211ENST00000476070 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
CERKL-211ENST00000476070 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.36■■□□□ 1.81
CERKL-211ENST00000476070 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.35■■□□□ 1.81
CERKL-211ENST00000476070 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CERKL-211ENST00000476070 SCRIBQ14160 1630 aa26.11■■□□□ 1.77
CERKL-211ENST00000476070 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.85■■□□□ 1.73
CERKL-211ENST00000476070 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CERKL-211ENST00000476070 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.6■■□□□ 1.69
CERKL-211ENST00000476070 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.43■■□□□ 1.66
CERKL-211ENST00000476070 SMARCA4P51532 1647 aa24.93■■□□□ 1.58
CERKL-211ENST00000476070 NCAPD3P42695 1498 aa24.85■■□□□ 1.57
CERKL-211ENST00000476070 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.85■■□□□ 1.57
CERKL-211ENST00000476070 FOXD1Q16676 465 aa24.82■■□□□ 1.56
CERKL-211ENST00000476070 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CERKL-211ENST00000476070 SMARCA2P51531 1590 aa24.74■■□□□ 1.55
CERKL-211ENST00000476070 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.72■■□□□ 1.55
CERKL-211ENST00000476070 HMGXB3Q12766 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
CERKL-211ENST00000476070 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.67■■□□□ 1.54
CERKL-211ENST00000476070 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CERKL-211ENST00000476070 NESP48681 1621 aa24.46■■□□□ 1.51
CERKL-211ENST00000476070 WIZO95785 1651 aa24.45■■□□□ 1.5
CERKL-211ENST00000476070 ERCC6Q03468 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
CERKL-211ENST00000476070 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CERKL-211ENST00000476070 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.23■■□□□ 1.47
CERKL-211ENST00000476070 CUX2O14529 1486 aa24.19■■□□□ 1.46
CERKL-211ENST00000476070 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.16■■□□□ 1.46
CERKL-211ENST00000476070 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CERKL-211ENST00000476070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CERKL-211ENST00000476070 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.09■■□□□ 1.45
CERKL-211ENST00000476070 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-211ENST00000476070 CFTRP13569 1480 aa23.92■■□□□ 1.42
CERKL-211ENST00000476070 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.87■■□□□ 1.41
CERKL-211ENST00000476070 WDR62O43379 1518 aa23.84■■□□□ 1.41
CERKL-211ENST00000476070 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.84■■□□□ 1.41
CERKL-211ENST00000476070 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.84■■□□□ 1.41
CERKL-211ENST00000476070 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.83■■□□□ 1.41
CERKL-211ENST00000476070 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.81■■□□□ 1.4
CERKL-211ENST00000476070 PRDM2Q13029 1718 aa23.73■■□□□ 1.39
CERKL-211ENST00000476070 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CERKL-211ENST00000476070 MSH5O43196 834 aa23.54■■□□□ 1.36
CERKL-211ENST00000476070 TOPBP1Q92547 1522 aa23.45■■□□□ 1.34
CERKL-211ENST00000476070 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.39■■□□□ 1.33
CERKL-211ENST00000476070 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.38■■□□□ 1.33
CERKL-211ENST00000476070 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CERKL-211ENST00000476070 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CERKL-211ENST00000476070 POTEDQ86YR6 584 aa23.33■■□□□ 1.33
CERKL-211ENST00000476070 IFT140Q96RY7 1462 aa23.32■■□□□ 1.32
CERKL-211ENST00000476070 ABCC8Q09428 1581 aa23.3■■□□□ 1.32
CERKL-211ENST00000476070 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CERKL-211ENST00000476070 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CERKL-211ENST00000476070 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CERKL-211ENST00000476070 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CERKL-211ENST00000476070 CUX1P39880 1505 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-211ENST00000476070 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.17■■□□□ 1.3
CERKL-211ENST00000476070 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
CERKL-211ENST00000476070 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.14■■□□□ 1.29
CERKL-211ENST00000476070 OSCARQ8IYS5 282 aa23.08■■□□□ 1.29
CERKL-211ENST00000476070 SOGA1O94964 1423 aa23.08■■□□□ 1.28
CERKL-211ENST00000476070 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CERKL-211ENST00000476070 WDR97A6NE52 1622 aa23.02■■□□□ 1.28
CERKL-211ENST00000476070 CHD1O14646 1710 aa23.01■■□□□ 1.27
CERKL-211ENST00000476070 SYNJ1O43426 1573 aa22.93■■□□□ 1.26
CERKL-211ENST00000476070 TRIM41Q8WV44 630 aa22.92■■□□□ 1.26
CERKL-211ENST00000476070 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.91■■□□□ 1.26
CERKL-211ENST00000476070 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.9■■□□□ 1.26
CERKL-211ENST00000476070 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 TOP2BQ02880 1626 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 ADRA2BP18089 450 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 PBRM1Q86U86 1689 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 GRIN2BQ13224 1484 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 ARHGEF11O15085 1522 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 FBLN2P98095 1184 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-211ENST00000476070 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.82■■□□□ 1.24
CERKL-211ENST00000476070 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CERKL-211ENST00000476070 SYNJ2O15056 1496 aa22.75■■□□□ 1.23
CERKL-211ENST00000476070 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.74■■□□□ 1.23
CERKL-211ENST00000476070 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CERKL-211ENST00000476070 ADAMTS12P58397 1594 aa22.66■■□□□ 1.22
CERKL-211ENST00000476070 ARAP1Q96P48 1450 aa22.65■■□□□ 1.22
CERKL-211ENST00000476070 GRIN2AQ12879 1464 aa22.59■■□□□ 1.21
CERKL-211ENST00000476070 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.57■■□□□ 1.2
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