RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474945.1

SPCS1-204, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPCS1, Length 981 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-204ENST00000474945 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.54■■■□□ 2.96
SPCS1-204ENST00000474945 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.98■■■□□ 2.39
SPCS1-204ENST00000474945 ABCC9O60706 1549 aa29.6■■■□□ 2.33
SPCS1-204ENST00000474945 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.34■■■□□ 2.13
SPCS1-204ENST00000474945 NACADO15069 1562 aa28.22■■■□□ 2.11
SPCS1-204ENST00000474945 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.12■■■□□ 2.09
SPCS1-204ENST00000474945 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.92■■■□□ 2.06
SPCS1-204ENST00000474945 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SPCS1-204ENST00000474945 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.72■■■□□ 2.03
SPCS1-204ENST00000474945 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.67■■■□□ 2.02
SPCS1-204ENST00000474945 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
SPCS1-204ENST00000474945 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.45■■□□□ 1.99
SPCS1-204ENST00000474945 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SPCS1-204ENST00000474945 SCRIBQ14160 1630 aa27.38■■□□□ 1.97
SPCS1-204ENST00000474945 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.28■■□□□ 1.96
SPCS1-204ENST00000474945 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.18■■□□□ 1.94
SPCS1-204ENST00000474945 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SPCS1-204ENST00000474945 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.74■■□□□ 1.87
SPCS1-204ENST00000474945 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.62■■□□□ 1.85
SPCS1-204ENST00000474945 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.53■■□□□ 1.84
SPCS1-204ENST00000474945 SMARCA4P51532 1647 aa26.12■■□□□ 1.77
SPCS1-204ENST00000474945 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SPCS1-204ENST00000474945 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.01■■□□□ 1.75
SPCS1-204ENST00000474945 NCAPD3P42695 1498 aa26■■□□□ 1.75
SPCS1-204ENST00000474945 SMARCA2P51531 1590 aa25.99■■□□□ 1.75
SPCS1-204ENST00000474945 HMGXB3Q12766 1538 aa25.92■■□□□ 1.74
SPCS1-204ENST00000474945 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.86■■□□□ 1.73
SPCS1-204ENST00000474945 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.83■■□□□ 1.73
SPCS1-204ENST00000474945 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
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SPCS1-204ENST00000474945 ERCC6Q03468 1493 aa25.57■■□□□ 1.68
SPCS1-204ENST00000474945 NESP48681 1621 aa25.52■■□□□ 1.68
SPCS1-204ENST00000474945 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SPCS1-204ENST00000474945 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.41■■□□□ 1.66
SPCS1-204ENST00000474945 CUX2O14529 1486 aa25.34■■□□□ 1.65
SPCS1-204ENST00000474945 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SPCS1-204ENST00000474945 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.24■■□□□ 1.63
SPCS1-204ENST00000474945 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.23■■□□□ 1.63
SPCS1-204ENST00000474945 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
SPCS1-204ENST00000474945 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SPCS1-204ENST00000474945 CFTRP13569 1480 aa25.05■■□□□ 1.6
SPCS1-204ENST00000474945 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.03■■□□□ 1.6
SPCS1-204ENST00000474945 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.02■■□□□ 1.6
SPCS1-204ENST00000474945 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.01■■□□□ 1.59
SPCS1-204ENST00000474945 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.96■■□□□ 1.59
SPCS1-204ENST00000474945 WDR62O43379 1518 aa24.96■■□□□ 1.59
SPCS1-204ENST00000474945 PRDM2Q13029 1718 aa24.89■■□□□ 1.57
SPCS1-204ENST00000474945 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.77■■□□□ 1.56
SPCS1-204ENST00000474945 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SPCS1-204ENST00000474945 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPCS1-204ENST00000474945 TOPBP1Q92547 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
SPCS1-204ENST00000474945 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
SPCS1-204ENST00000474945 ABCC8Q09428 1581 aa24.51■■□□□ 1.51
SPCS1-204ENST00000474945 IFT140Q96RY7 1462 aa24.49■■□□□ 1.51
SPCS1-204ENST00000474945 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
SPCS1-204ENST00000474945 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SPCS1-204ENST00000474945 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SPCS1-204ENST00000474945 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SPCS1-204ENST00000474945 CUX1P39880 1505 aa24.29■■□□□ 1.48
SPCS1-204ENST00000474945 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
SPCS1-204ENST00000474945 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.24■■□□□ 1.47
SPCS1-204ENST00000474945 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
SPCS1-204ENST00000474945 SOGA1O94964 1423 aa24.2■■□□□ 1.46
SPCS1-204ENST00000474945 OSCARQ8IYS5 282 aa24.16■■□□□ 1.46
SPCS1-204ENST00000474945 WDR97A6NE52 1622 aa24.12■■□□□ 1.45
SPCS1-204ENST00000474945 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
SPCS1-204ENST00000474945 CHD1O14646 1710 aa24.06■■□□□ 1.44
SPCS1-204ENST00000474945 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
SPCS1-204ENST00000474945 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.03■■□□□ 1.44
SPCS1-204ENST00000474945 SYNJ1O43426 1573 aa24.01■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 TOP2BQ02880 1626 aa24.01■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.01■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 GRIN2BQ13224 1484 aa23.99■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.99■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 FBLN2P98095 1184 aa23.98■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 PBRM1Q86U86 1689 aa23.95■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.95■■□□□ 1.43
SPCS1-204ENST00000474945 TRIM41Q8WV44 630 aa23.95■■□□□ 1.42
SPCS1-204ENST00000474945 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.94■■□□□ 1.42
SPCS1-204ENST00000474945 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.9■■□□□ 1.42
SPCS1-204ENST00000474945 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.9■■□□□ 1.42
SPCS1-204ENST00000474945 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.9■■□□□ 1.42
SPCS1-204ENST00000474945 ARHGEF11O15085 1522 aa23.87■■□□□ 1.41
SPCS1-204ENST00000474945 SYNJ2O15056 1496 aa23.87■■□□□ 1.41
SPCS1-204ENST00000474945 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SPCS1-204ENST00000474945 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.78■■□□□ 1.4
SPCS1-204ENST00000474945 ADAMTS12P58397 1594 aa23.78■■□□□ 1.4
SPCS1-204ENST00000474945 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.7■■□□□ 1.38
SPCS1-204ENST00000474945 GRIN2AQ12879 1464 aa23.69■■□□□ 1.38
SPCS1-204ENST00000474945 ARAP1Q96P48 1450 aa23.66■■□□□ 1.38
SPCS1-204ENST00000474945 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.66■■□□□ 1.38
SPCS1-204ENST00000474945 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.6■■□□□ 1.37
SPCS1-204ENST00000474945 CEP170Q5SW79 1584 aa23.6■■□□□ 1.37
SPCS1-204ENST00000474945 NUP160Q12769 1436 aa23.57■■□□□ 1.36
SPCS1-204ENST00000474945 KIF27Q86VH2 1401 aa23.55■■□□□ 1.36
SPCS1-204ENST00000474945 CUL7Q14999 1698 aa23.47■■□□□ 1.35
SPCS1-204ENST00000474945 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
SPCS1-204ENST00000474945 SHROOM2Q13796 1616 aa23.43■■□□□ 1.34
SPCS1-204ENST00000474945 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.43■■□□□ 1.34
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