RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474751.6

NLRX1-210, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

TSL 4

Gene NLRX1, Length 721 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-210ENST00000474751 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.25■■■■■ 5.63
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NLRX1-210ENST00000474751 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.08■■■■■ 4.49
NLRX1-210ENST00000474751 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.04■■■■■ 4.48
NLRX1-210ENST00000474751 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.81■■■■■ 4.44
NLRX1-210ENST00000474751 NACADO15069 1562 aa42.73■■■■■ 4.43
NLRX1-210ENST00000474751 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.39
NLRX1-210ENST00000474751 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
NLRX1-210ENST00000474751 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.95■■■■■ 4.31
NLRX1-210ENST00000474751 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.84■■■■■ 4.29
NLRX1-210ENST00000474751 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
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NLRX1-210ENST00000474751 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.19■■■■■ 4.18
NLRX1-210ENST00000474751 SCRIBQ14160 1630 aa41.12■■■■■ 4.17
NLRX1-210ENST00000474751 CECR2Q9BXF3 1484 aa41■■■■■ 4.15
NLRX1-210ENST00000474751 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.99■■■■■ 4.15
NLRX1-210ENST00000474751 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
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NLRX1-210ENST00000474751 ERCC6Q03468 1493 aa39.29■■■■□ 3.88
NLRX1-210ENST00000474751 CUX2O14529 1486 aa39.24■■■■□ 3.87
NLRX1-210ENST00000474751 SMARCA2P51531 1590 aa39.18■■■■□ 3.86
NLRX1-210ENST00000474751 SMARCA4P51532 1647 aa39.17■■■■□ 3.86
NLRX1-210ENST00000474751 HMGXB3Q12766 1538 aa39.09■■■■□ 3.85
NLRX1-210ENST00000474751 NESP48681 1621 aa39.01■■■■□ 3.84
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NLRX1-210ENST00000474751 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.58■■■■□ 3.77
NLRX1-210ENST00000474751 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
NLRX1-210ENST00000474751 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.49■■■■□ 3.75
NLRX1-210ENST00000474751 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.37■■■■□ 3.73
NLRX1-210ENST00000474751 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.33■■■■□ 3.73
NLRX1-210ENST00000474751 WIZO95785 1651 aa38.2■■■■□ 3.71
NLRX1-210ENST00000474751 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.11■■■■□ 3.69
NLRX1-210ENST00000474751 WDR62O43379 1518 aa37.97■■■■□ 3.67
NLRX1-210ENST00000474751 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.91■■■■□ 3.66
NLRX1-210ENST00000474751 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
NLRX1-210ENST00000474751 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.89■■■■□ 3.66
NLRX1-210ENST00000474751 TRIM41Q8WV44 630 aa37.88■■■■□ 3.65
NLRX1-210ENST00000474751 CFTRP13569 1480 aa37.83■■■■□ 3.65
NLRX1-210ENST00000474751 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
NLRX1-210ENST00000474751 OSCARQ8IYS5 282 aa37.6■■■■□ 3.61
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NLRX1-210ENST00000474751 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.38■■■■□ 3.57
NLRX1-210ENST00000474751 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
NLRX1-210ENST00000474751 IFT140Q96RY7 1462 aa37.19■■■■□ 3.54
NLRX1-210ENST00000474751 PRDM2Q13029 1718 aa37.13■■■■□ 3.54
NLRX1-210ENST00000474751 TOPBP1Q92547 1522 aa37.11■■■■□ 3.53
NLRX1-210ENST00000474751 ABCC8Q09428 1581 aa37.02■■■■□ 3.52
NLRX1-210ENST00000474751 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
NLRX1-210ENST00000474751 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
NLRX1-210ENST00000474751 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
NLRX1-210ENST00000474751 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.9■■■■□ 3.5
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NLRX1-210ENST00000474751 ARHGEF11O15085 1522 aa36.82■■■■□ 3.48
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NLRX1-210ENST00000474751 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.66■■■■□ 3.46
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NLRX1-210ENST00000474751 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
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NLRX1-210ENST00000474751 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
NLRX1-210ENST00000474751 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
NLRX1-210ENST00000474751 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.4■■■■□ 3.42
NLRX1-210ENST00000474751 CUX1P39880 1505 aa36.39■■■■□ 3.42
NLRX1-210ENST00000474751 GRIN2BQ13224 1484 aa36.29■■■■□ 3.4
NLRX1-210ENST00000474751 WDR97A6NE52 1622 aa36.27■■■■□ 3.4
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NLRX1-210ENST00000474751 SYNJ1O43426 1573 aa36.17■■■■□ 3.38
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NLRX1-210ENST00000474751 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.02■■■■□ 3.36
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NLRX1-210ENST00000474751 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.9■■■■□ 3.34
NLRX1-210ENST00000474751 GRIN2AQ12879 1464 aa35.79■■■■□ 3.32
NLRX1-210ENST00000474751 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.69■■■■□ 3.3
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NLRX1-210ENST00000474751 ADAMTS12P58397 1594 aa35.65■■■■□ 3.3
NLRX1-210ENST00000474751 CEP170Q5SW79 1584 aa35.64■■■■□ 3.3
NLRX1-210ENST00000474751 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.62■■■■□ 3.29
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NLRX1-210ENST00000474751 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.53■■■■□ 3.28
NLRX1-210ENST00000474751 JPH4Q96JJ6 628 aa35.49■■■■□ 3.27
NLRX1-210ENST00000474751 SHROOM2Q13796 1616 aa35.46■■■■□ 3.27
NLRX1-210ENST00000474751 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
NLRX1-210ENST00000474751 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
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