RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472259.5

SFXN5-210, Transcript of sideroflexin 5, humanhuman

TSL 3

Gene SFXN5, Length 1,690 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5-210ENST00000472259 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.57■■■■■ 6.65
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SFXN5-210ENST00000472259 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.59■■■■■ 5.05
SFXN5-210ENST00000472259 NACADO15069 1562 aa46.58■■■■■ 5.05
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SFXN5-210ENST00000472259 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.39■■■■■ 4.86
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SFXN5-210ENST00000472259 SMARCA4P51532 1647 aa43.69■■■■■ 4.58
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SFXN5-210ENST00000472259 WIZO95785 1651 aa43.25■■■■■ 4.51
SFXN5-210ENST00000472259 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.19■■■■■ 4.5
SFXN5-210ENST00000472259 SMARCA2P51531 1590 aa43.18■■■■■ 4.5
SFXN5-210ENST00000472259 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.16■■■■■ 4.5
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SFXN5-210ENST00000472259 HMGXB3Q12766 1538 aa42.86■■■■■ 4.45
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SFXN5-210ENST00000472259 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.69■■■■■ 4.26
SFXN5-210ENST00000472259 NESP48681 1621 aa41.66■■■■■ 4.26
SFXN5-210ENST00000472259 PRDM2Q13029 1718 aa41.57■■■■■ 4.24
SFXN5-210ENST00000472259 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.39■■■■■ 4.22
SFXN5-210ENST00000472259 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.34■■■■■ 4.21
SFXN5-210ENST00000472259 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.22■■■■■ 4.19
SFXN5-210ENST00000472259 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.2■■■■■ 4.19
SFXN5-210ENST00000472259 ABCC8Q09428 1581 aa41.16■■■■■ 4.18
SFXN5-210ENST00000472259 ERCC6Q03468 1493 aa41.15■■■■■ 4.18
SFXN5-210ENST00000472259 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.16
SFXN5-210ENST00000472259 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.01■■■■■ 4.15
SFXN5-210ENST00000472259 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.89■■■■■ 4.14
SFXN5-210ENST00000472259 TRIM41Q8WV44 630 aa40.88■■■■■ 4.13
SFXN5-210ENST00000472259 CUX1P39880 1505 aa40.87■■■■■ 4.13
SFXN5-210ENST00000472259 SYNJ1O43426 1573 aa40.86■■■■■ 4.13
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SFXN5-210ENST00000472259 TOP2BQ02880 1626 aa40.8■■■■■ 4.12
SFXN5-210ENST00000472259 TOPBP1Q92547 1522 aa40.79■■■■■ 4.12
SFXN5-210ENST00000472259 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.79■■■■■ 4.12
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SFXN5-210ENST00000472259 IFT140Q96RY7 1462 aa40.26■■■■■ 4.03
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SFXN5-210ENST00000472259 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.21■■■■■ 4.03
SFXN5-210ENST00000472259 WDR97A6NE52 1622 aa40.17■■■■■ 4.02
SFXN5-210ENST00000472259 KIF27Q86VH2 1401 aa40.09■■■■■ 4.01
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SFXN5-210ENST00000472259 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.96■■■■□ 3.99
SFXN5-210ENST00000472259 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
SFXN5-210ENST00000472259 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.98
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SFXN5-210ENST00000472259 PBRM1Q86U86 1689 aa39.8■■■■□ 3.96
SFXN5-210ENST00000472259 GRIN2BQ13224 1484 aa39.77■■■■□ 3.96
SFXN5-210ENST00000472259 IGF1RP08069 1367 aa39.77■■■■□ 3.96
SFXN5-210ENST00000472259 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.76■■■■□ 3.95
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SFXN5-210ENST00000472259 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.38■■■■□ 3.9
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SFXN5-210ENST00000472259 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
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SFXN5-210ENST00000472259 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.08■■■■□ 3.85
SFXN5-210ENST00000472259 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.07■■■■□ 3.85
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