RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469556.1

GALE-211, Transcript of UDP-galactose-4-epimerase, humanhuman

TSL 2

Gene GALE, Length 882 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALE-211ENST00000469556 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.95■■■■□ 3.83
GALE-211ENST00000469556 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.7■■■■□ 3.14
GALE-211ENST00000469556 ABCC9O60706 1549 aa34.04■■■■□ 3.04
GALE-211ENST00000469556 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.77■■■□□ 2.84
GALE-211ENST00000469556 NACADO15069 1562 aa32.72■■■□□ 2.83
GALE-211ENST00000469556 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.6■■■□□ 2.81
GALE-211ENST00000469556 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.53■■■□□ 2.8
GALE-211ENST00000469556 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
GALE-211ENST00000469556 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.3■■■□□ 2.76
GALE-211ENST00000469556 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.81■■■□□ 2.68
GALE-211ENST00000469556 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
GALE-211ENST00000469556 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.67■■■□□ 2.66
GALE-211ENST00000469556 SCRIBQ14160 1630 aa31.56■■■□□ 2.64
GALE-211ENST00000469556 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.55■■■□□ 2.64
GALE-211ENST00000469556 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.35■■■□□ 2.61
GALE-211ENST00000469556 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
GALE-211ENST00000469556 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.79■■■□□ 2.52
GALE-211ENST00000469556 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.67■■■□□ 2.5
GALE-211ENST00000469556 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
GALE-211ENST00000469556 SMARCA4P51532 1647 aa30.22■■■□□ 2.43
GALE-211ENST00000469556 NCAPD3P42695 1498 aa30.2■■■□□ 2.43
GALE-211ENST00000469556 SMARCA2P51531 1590 aa30.15■■■□□ 2.42
GALE-211ENST00000469556 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.14■■■□□ 2.42
GALE-211ENST00000469556 HMGXB3Q12766 1538 aa30.01■■■□□ 2.4
GALE-211ENST00000469556 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.98■■■□□ 2.39
GALE-211ENST00000469556 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.95■■■□□ 2.39
GALE-211ENST00000469556 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
GALE-211ENST00000469556 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
GALE-211ENST00000469556 WIZO95785 1651 aa29.57■■■□□ 2.32
GALE-211ENST00000469556 ERCC6Q03468 1493 aa29.44■■■□□ 2.3
GALE-211ENST00000469556 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.41■■■□□ 2.3
GALE-211ENST00000469556 NESP48681 1621 aa29.38■■■□□ 2.29
GALE-211ENST00000469556 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
GALE-211ENST00000469556 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.31■■■□□ 2.28
GALE-211ENST00000469556 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.28■■■□□ 2.28
GALE-211ENST00000469556 CUX2O14529 1486 aa29.23■■■□□ 2.27
GALE-211ENST00000469556 CFTRP13569 1480 aa29.09■■■□□ 2.25
GALE-211ENST00000469556 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.99■■■□□ 2.23
GALE-211ENST00000469556 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GALE-211ENST00000469556 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.99■■■□□ 2.23
GALE-211ENST00000469556 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.93■■■□□ 2.22
GALE-211ENST00000469556 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.93■■■□□ 2.22
GALE-211ENST00000469556 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.91■■■□□ 2.22
GALE-211ENST00000469556 WDR62O43379 1518 aa28.8■■■□□ 2.2
GALE-211ENST00000469556 PRDM2Q13029 1718 aa28.72■■■□□ 2.19
GALE-211ENST00000469556 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GALE-211ENST00000469556 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
GALE-211ENST00000469556 ABCC8Q09428 1581 aa28.54■■■□□ 2.16
GALE-211ENST00000469556 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.5■■■□□ 2.15
GALE-211ENST00000469556 TOPBP1Q92547 1522 aa28.43■■■□□ 2.14
GALE-211ENST00000469556 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.39■■■□□ 2.14
GALE-211ENST00000469556 IFT140Q96RY7 1462 aa28.36■■■□□ 2.13
GALE-211ENST00000469556 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
GALE-211ENST00000469556 CUX1P39880 1505 aa28.12■■■□□ 2.09
GALE-211ENST00000469556 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
GALE-211ENST00000469556 SOGA1O94964 1423 aa28.1■■■□□ 2.09
GALE-211ENST00000469556 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
GALE-211ENST00000469556 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.08■■■□□ 2.09
GALE-211ENST00000469556 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GALE-211ENST00000469556 OSCARQ8IYS5 282 aa28.01■■■□□ 2.07
GALE-211ENST00000469556 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.01■■■□□ 2.07
GALE-211ENST00000469556 WDR97A6NE52 1622 aa28■■■□□ 2.07
GALE-211ENST00000469556 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.079e-7■■■■■ 29.3
GALE-211ENST00000469556 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
GALE-211ENST00000469556 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
GALE-211ENST00000469556 TOP2BQ02880 1626 aa27.87■■■□□ 2.05
GALE-211ENST00000469556 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.84■■■□□ 2.05
GALE-211ENST00000469556 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.84■■■□□ 2.05
GALE-211ENST00000469556 GRIN2BQ13224 1484 aa27.81■■■□□ 2.04
GALE-211ENST00000469556 SYNJ1O43426 1573 aa27.78■■■□□ 2.04
GALE-211ENST00000469556 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.77■■■□□ 2.04
GALE-211ENST00000469556 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
GALE-211ENST00000469556 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.73■■■□□ 2.03
GALE-211ENST00000469556 FBLN2P98095 1184 aa27.72■■■□□ 2.03
GALE-211ENST00000469556 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.68■■■□□ 2.02
GALE-211ENST00000469556 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
GALE-211ENST00000469556 SYNJ2O15056 1496 aa27.64■■■□□ 2.02
GALE-211ENST00000469556 CHD1O14646 1710 aa27.63■■■□□ 2.01
GALE-211ENST00000469556 PBRM1Q86U86 1689 aa27.6■■■□□ 2.01
GALE-211ENST00000469556 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.52■■■□□ 2
GALE-211ENST00000469556 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.48■■□□□ 1.99
GALE-211ENST00000469556 ARHGEF11O15085 1522 aa27.46■■□□□ 1.99
GALE-211ENST00000469556 ADAMTS12P58397 1594 aa27.43■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 KIF27Q86VH2 1401 aa27.43■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.42■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 TRIM41Q8WV44 630 aa27.42■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 GRIN2AQ12879 1464 aa27.42■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.41■■□□□ 1.98
GALE-211ENST00000469556 NUP160Q12769 1436 aa27.32■■□□□ 1.96
GALE-211ENST00000469556 IGF1RP08069 1367 aa27.29■■□□□ 1.96
GALE-211ENST00000469556 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.24■■□□□ 1.95
GALE-211ENST00000469556 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.22■■□□□ 1.95
GALE-211ENST00000469556 CEP170Q5SW79 1584 aa27.22■■□□□ 1.95
GALE-211ENST00000469556 CUL7Q14999 1698 aa27.21■■□□□ 1.95
GALE-211ENST00000469556 ARAP1Q96P48 1450 aa27.2■■□□□ 1.95
GALE-211ENST00000469556 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.14■■□□□ 1.94
GALE-211ENST00000469556 JPH4Q96JJ6 628 aa27.07■■□□□ 1.92
GALE-211ENST00000469556 SHROOM2Q13796 1616 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.1 ms