RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468599.1

CNOT10-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT10, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-211ENST00000468599 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.43■■□□□ 1.98
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CNOT10-211ENST00000468599 ABCC9O60706 1549 aa23.85■■□□□ 1.41
CNOT10-211ENST00000468599 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CNOT10-211ENST00000468599 NACADO15069 1562 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT10-211ENST00000468599 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.77■■□□□ 1.24
CNOT10-211ENST00000468599 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.7■■□□□ 1.22
CNOT10-211ENST00000468599 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.69■■□□□ 1.22
CNOT10-211ENST00000468599 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.63■■□□□ 1.21
CNOT10-211ENST00000468599 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CNOT10-211ENST00000468599 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.5■■□□□ 1.19
CNOT10-211ENST00000468599 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.44■■□□□ 1.18
CNOT10-211ENST00000468599 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.44■■□□□ 1.18
CNOT10-211ENST00000468599 SCRIBQ14160 1630 aa22.26■■□□□ 1.15
CNOT10-211ENST00000468599 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
CNOT10-211ENST00000468599 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.18■■□□□ 1.14
CNOT10-211ENST00000468599 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.84■■□□□ 1.09
CNOT10-211ENST00000468599 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CNOT10-211ENST00000468599 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.49■■□□□ 1.03
CNOT10-211ENST00000468599 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.45■■□□□ 1.03
CNOT10-211ENST00000468599 SMARCA4P51532 1647 aa21.3■■□□□ 1
CNOT10-211ENST00000468599 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CNOT10-211ENST00000468599 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.19■□□□□ 0.98
CNOT10-211ENST00000468599 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.07■□□□□ 0.96
CNOT10-211ENST00000468599 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.07■□□□□ 0.96
CNOT10-211ENST00000468599 SMARCA2P51531 1590 aa21.04■□□□□ 0.96
CNOT10-211ENST00000468599 WIZO95785 1651 aa21■□□□□ 0.95
CNOT10-211ENST00000468599 NCAPD3P42695 1498 aa20.99■□□□□ 0.95
CNOT10-211ENST00000468599 HMGXB3Q12766 1538 aa20.98■□□□□ 0.95
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CNOT10-211ENST00000468599 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
CNOT10-211ENST00000468599 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.58■□□□□ 0.89
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CNOT10-211ENST00000468599 NESP48681 1621 aa20.52■□□□□ 0.88
CNOT10-211ENST00000468599 CUX2O14529 1486 aa20.49■□□□□ 0.87
CNOT10-211ENST00000468599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.46■□□□□ 0.87
CNOT10-211ENST00000468599 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.45■□□□□ 0.86
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CNOT10-211ENST00000468599 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.35■□□□□ 0.85
CNOT10-211ENST00000468599 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.35■□□□□ 0.85
CNOT10-211ENST00000468599 PRDM2Q13029 1718 aa20.34■□□□□ 0.85
CNOT10-211ENST00000468599 CFTRP13569 1480 aa20.33■□□□□ 0.85
CNOT10-211ENST00000468599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CNOT10-211ENST00000468599 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.2■□□□□ 0.82
CNOT10-211ENST00000468599 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.18■□□□□ 0.82
CNOT10-211ENST00000468599 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.14■□□□□ 0.81
CNOT10-211ENST00000468599 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.08■□□□□ 0.81
CNOT10-211ENST00000468599 WDR62O43379 1518 aa20.06■□□□□ 0.8
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CNOT10-211ENST00000468599 TOPBP1Q92547 1522 aa19.91■□□□□ 0.78
CNOT10-211ENST00000468599 CUX1P39880 1505 aa19.86■□□□□ 0.77
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CNOT10-211ENST00000468599 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.77■□□□□ 0.76
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CNOT10-211ENST00000468599 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.73■□□□□ 0.75
CNOT10-211ENST00000468599 TOP2BQ02880 1626 aa19.73■□□□□ 0.75
CNOT10-211ENST00000468599 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
CNOT10-211ENST00000468599 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
CNOT10-211ENST00000468599 WDR97A6NE52 1622 aa19.69■□□□□ 0.74
CNOT10-211ENST00000468599 IFT140Q96RY7 1462 aa19.68■□□□□ 0.74
CNOT10-211ENST00000468599 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.66■□□□□ 0.74
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
CNOT10-211ENST00000468599 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
CNOT10-211ENST00000468599 OSCARQ8IYS5 282 aa19.62■□□□□ 0.73
CNOT10-211ENST00000468599 SOGA1O94964 1423 aa19.59■□□□□ 0.73
CNOT10-211ENST00000468599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.54■□□□□ 0.72
CNOT10-211ENST00000468599 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.53■□□□□ 0.72
CNOT10-211ENST00000468599 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.718e-7■■■■□ 23.9
CNOT10-211ENST00000468599 PBRM1Q86U86 1689 aa19.49■□□□□ 0.71
CNOT10-211ENST00000468599 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CNOT10-211ENST00000468599 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.4■□□□□ 0.7
CNOT10-211ENST00000468599 CHD1O14646 1710 aa19.37■□□□□ 0.69
CNOT10-211ENST00000468599 GRIN2BQ13224 1484 aa19.37■□□□□ 0.69
CNOT10-211ENST00000468599 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.37■□□□□ 0.69
CNOT10-211ENST00000468599 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.33■□□□□ 0.68
CNOT10-211ENST00000468599 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.33■□□□□ 0.68
CNOT10-211ENST00000468599 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.33■□□□□ 0.68
CNOT10-211ENST00000468599 ADAMTS12P58397 1594 aa19.32■□□□□ 0.68
CNOT10-211ENST00000468599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
CNOT10-211ENST00000468599 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.3■□□□□ 0.68
CNOT10-211ENST00000468599 FBLN2P98095 1184 aa19.29■□□□□ 0.68
CNOT10-211ENST00000468599 ARHGEF11O15085 1522 aa19.26■□□□□ 0.67
CNOT10-211ENST00000468599 KIF27Q86VH2 1401 aa19.25■□□□□ 0.67
CNOT10-211ENST00000468599 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.25■□□□□ 0.67
CNOT10-211ENST00000468599 SYNJ2O15056 1496 aa19.23■□□□□ 0.67
CNOT10-211ENST00000468599 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.21■□□□□ 0.67
CNOT10-211ENST00000468599 CUL7Q14999 1698 aa19.2■□□□□ 0.66
CNOT10-211ENST00000468599 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.17■□□□□ 0.66
CNOT10-211ENST00000468599 GRIN2AQ12879 1464 aa19.16■□□□□ 0.66
CNOT10-211ENST00000468599 IGF1RP08069 1367 aa19.16■□□□□ 0.66
CNOT10-211ENST00000468599 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CNOT10-211ENST00000468599 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.13■□□□□ 0.65
CNOT10-211ENST00000468599 CEP170Q5SW79 1584 aa19.13■□□□□ 0.65
CNOT10-211ENST00000468599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CNOT10-211ENST00000468599 ARAP1Q96P48 1450 aa19.09■□□□□ 0.65
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