RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466195.1

TSPAN13-202, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN13, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSPAN13-202ENST00000466195 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSPAN13-202ENST00000466195 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPAN13-202ENST00000466195 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPAN13-202ENST00000466195 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.17■■□□□ 1.3
TSPAN13-202ENST00000466195 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.15■■□□□ 1.3
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TSPAN13-202ENST00000466195 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.01■■□□□ 1.27
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TSPAN13-202ENST00000466195 IFT140Q96RY7 1462 aa22.71■■□□□ 1.23
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TSPAN13-202ENST00000466195 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.45■■□□□ 1.18
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TSPAN13-202ENST00000466195 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.93■■□□□ 1.1
TSPAN13-202ENST00000466195 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSPAN13-202ENST00000466195 ARAP1Q96P48 1450 aa21.89■■□□□ 1.09
TSPAN13-202ENST00000466195 KIF27Q86VH2 1401 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN13-202ENST00000466195 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN13-202ENST00000466195 CEP170Q5SW79 1584 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN13-202ENST00000466195 NUP160Q12769 1436 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN13-202ENST00000466195 CUL7Q14999 1698 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN13-202ENST00000466195 IGF1RP08069 1367 aa21.74■■□□□ 1.07
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