RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465822.5

C1orf159-211, Transcript of chromosome 1 open reading frame 159, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf159, Length 1,933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf159-211ENST00000465822 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.57■■■■□ 3.29
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C1orf159-211ENST00000465822 SMARCA2P51531 1590 aa26.8■■□□□ 1.88
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C1orf159-211ENST00000465822 HMGXB3Q12766 1538 aa26.5■■□□□ 1.83
C1orf159-211ENST00000465822 NCAPD3P42695 1498 aa26.5■■□□□ 1.83
C1orf159-211ENST00000465822 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.36■■□□□ 1.81
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C1orf159-211ENST00000465822 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.87■■□□□ 1.73
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C1orf159-211ENST00000465822 KIF27Q86VH2 1401 aa25.39■■□□□ 1.66
C1orf159-211ENST00000465822 TOPBP1Q92547 1522 aa25.37■■□□□ 1.65
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C1orf159-211ENST00000465822 CEP162Q5TB80 1403 aa25.32■■□□□ 1.64
C1orf159-211ENST00000465822 CUX2O14529 1486 aa25.31■■□□□ 1.64
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C1orf159-211ENST00000465822 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 ARAP1Q96P48 1450 aa24.8■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 PBRM1Q86U86 1689 aa24.8■■□□□ 1.56
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C1orf159-211ENST00000465822 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.76■■□□□ 1.55
C1orf159-211ENST00000465822 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 45.4
C1orf159-211ENST00000465822 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.74■■□□□ 1.55
C1orf159-211ENST00000465822 APLP2Q06481 763 aa24.71■■□□□ 1.55
C1orf159-211ENST00000465822 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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