RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465822.5

C1orf159-211, Transcript of chromosome 1 open reading frame 159, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf159, Length 1,933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf159-211ENST00000465822 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.57■■■■□ 3.29
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C1orf159-211ENST00000465822 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf159-211ENST00000465822 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.32■■■□□ 2.28
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C1orf159-211ENST00000465822 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.9■■■□□ 2.22
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C1orf159-211ENST00000465822 SCRIBQ14160 1630 aa28.56■■■□□ 2.16
C1orf159-211ENST00000465822 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.48■■■□□ 2.15
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C1orf159-211ENST00000465822 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.98■■■□□ 2.07
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C1orf159-211ENST00000465822 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.68■■■□□ 2.02
C1orf159-211ENST00000465822 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.61■■■□□ 2.01
C1orf159-211ENST00000465822 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.55■■■□□ 2
C1orf159-211ENST00000465822 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.53■■■□□ 2
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C1orf159-211ENST00000465822 SMARCA4P51532 1647 aa27.34■■□□□ 1.97
C1orf159-211ENST00000465822 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.12■■□□□ 1.93
C1orf159-211ENST00000465822 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
C1orf159-211ENST00000465822 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.92■■□□□ 1.9
C1orf159-211ENST00000465822 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.81■■□□□ 1.88
C1orf159-211ENST00000465822 SMARCA2P51531 1590 aa26.8■■□□□ 1.88
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C1orf159-211ENST00000465822 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.76■■□□□ 1.87
C1orf159-211ENST00000465822 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
C1orf159-211ENST00000465822 TRIM41Q8WV44 630 aa26.55■■□□□ 1.84
C1orf159-211ENST00000465822 HMGXB3Q12766 1538 aa26.5■■□□□ 1.83
C1orf159-211ENST00000465822 NCAPD3P42695 1498 aa26.5■■□□□ 1.83
C1orf159-211ENST00000465822 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.36■■□□□ 1.81
C1orf159-211ENST00000465822 ABCC8Q09428 1581 aa26.33■■□□□ 1.8
C1orf159-211ENST00000465822 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.16■■□□□ 1.78
C1orf159-211ENST00000465822 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
C1orf159-211ENST00000465822 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
C1orf159-211ENST00000465822 CFTRP13569 1480 aa25.99■■□□□ 1.75
C1orf159-211ENST00000465822 SYNJ1O43426 1573 aa25.98■■□□□ 1.75
C1orf159-211ENST00000465822 PRDM2Q13029 1718 aa25.94■■□□□ 1.74
C1orf159-211ENST00000465822 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.87■■□□□ 1.73
C1orf159-211ENST00000465822 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.85■■□□□ 1.73
C1orf159-211ENST00000465822 SOGA1O94964 1423 aa25.84■■□□□ 1.73
C1orf159-211ENST00000465822 TOP2BQ02880 1626 aa25.83■■□□□ 1.73
C1orf159-211ENST00000465822 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.8■■□□□ 1.72
C1orf159-211ENST00000465822 EEA1Q15075 1411 aa25.77■■□□□ 1.72
C1orf159-211ENST00000465822 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.75■■□□□ 1.71
C1orf159-211ENST00000465822 CUX1P39880 1505 aa25.72■■□□□ 1.71
C1orf159-211ENST00000465822 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.66■■□□□ 1.7
C1orf159-211ENST00000465822 NESP48681 1621 aa25.65■■□□□ 1.7
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C1orf159-211ENST00000465822 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.63■■□□□ 1.69
C1orf159-211ENST00000465822 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.6■■□□□ 1.69
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C1orf159-211ENST00000465822 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.44■■□□□ 1.66
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C1orf159-211ENST00000465822 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.41■■□□□ 1.66
C1orf159-211ENST00000465822 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.41■■□□□ 1.66
C1orf159-211ENST00000465822 KIF27Q86VH2 1401 aa25.39■■□□□ 1.66
C1orf159-211ENST00000465822 TOPBP1Q92547 1522 aa25.37■■□□□ 1.65
C1orf159-211ENST00000465822 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.35■■□□□ 1.65
C1orf159-211ENST00000465822 CEP162Q5TB80 1403 aa25.32■■□□□ 1.64
C1orf159-211ENST00000465822 CUX2O14529 1486 aa25.31■■□□□ 1.64
C1orf159-211ENST00000465822 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.31■■□□□ 1.64
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C1orf159-211ENST00000465822 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.23■■□□□ 1.63
C1orf159-211ENST00000465822 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.21■■□□□ 1.63
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C1orf159-211ENST00000465822 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.16■■□□□ 1.62
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C1orf159-211ENST00000465822 WDR97A6NE52 1622 aa25.09■■□□□ 1.61
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C1orf159-211ENST00000465822 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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C1orf159-211ENST00000465822 ERCC6Q03468 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
C1orf159-211ENST00000465822 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.96■■□□□ 1.59
C1orf159-211ENST00000465822 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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C1orf159-211ENST00000465822 WDR62O43379 1518 aa24.92■■□□□ 1.58
C1orf159-211ENST00000465822 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.91■■□□□ 1.58
C1orf159-211ENST00000465822 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.87■■□□□ 1.57
C1orf159-211ENST00000465822 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 ARAP1Q96P48 1450 aa24.8■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 PBRM1Q86U86 1689 aa24.8■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 IFT140Q96RY7 1462 aa24.8■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
C1orf159-211ENST00000465822 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.76■■□□□ 1.55
C1orf159-211ENST00000465822 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 45.4
C1orf159-211ENST00000465822 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.74■■□□□ 1.55
C1orf159-211ENST00000465822 APLP2Q06481 763 aa24.71■■□□□ 1.55
C1orf159-211ENST00000465822 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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