RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453601.5

VLDLR-AS1-204, VLDLR antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VLDLR-AS1, Length 887 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.26■■■■■ 6.6
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.05■■■■■ 5.12
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 NACADO15069 1562 aa46.99■■■■■ 5.11
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.98■■■■■ 5.11
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.09
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.69■■■■■ 5.07
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.52■■■■■ 5.04
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SCRIBQ14160 1630 aa45.68■■■■■ 4.9
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.67■■■■■ 4.9
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.11■■■■■ 4.81
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.87■■■■■ 4.77
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.26■■■■■ 4.68
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.94■■■■■ 4.62
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SMARCA4P51532 1647 aa43.66■■■■■ 4.58
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.4■■■■■ 4.54
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.38■■■■■ 4.54
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 NCAPD3P42695 1498 aa43.35■■■■■ 4.53
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SMARCA2P51531 1590 aa43.34■■■■■ 4.53
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.21■■■■■ 4.51
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 HMGXB3Q12766 1538 aa43.16■■■■■ 4.5
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 WIZO95785 1651 aa42.94■■■■■ 4.46
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 NESP48681 1621 aa42.36■■■■■ 4.37
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.22■■■■■ 4.35
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ERCC6Q03468 1493 aa42.15■■■■■ 4.34
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.09■■■■■ 4.33
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.94■■■■■ 4.3
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.91■■■■■ 4.3
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.88■■■■■ 4.29
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CFTRP13569 1480 aa41.86■■■■■ 4.29
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CUX2O14529 1486 aa41.67■■■■■ 4.26
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.63■■■■■ 4.25
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 PRDM2Q13029 1718 aa41.61■■■■■ 4.25
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.58■■■■■ 4.25
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.52■■■■■ 4.24
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 WDR62O43379 1518 aa41.39■■■■■ 4.22
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 TOPBP1Q92547 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.94■■■■■ 4.14
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ABCC8Q09428 1581 aa40.92■■■■■ 4.14
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CUX1P39880 1505 aa40.7■■■■■ 4.11
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 IFT140Q96RY7 1462 aa40.7■■■■■ 4.11
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.55■■■■■ 4.08
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.47■■■■■ 4.07
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SOGA1O94964 1423 aa40.44■■■■■ 4.06
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SYNJ1O43426 1573 aa40.36■■■■■ 4.05
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.35■■■■■ 4.05
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.35■■■■■ 4.05
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 TOP2BQ02880 1626 aa40.34■■■■■ 4.05
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.31■■■■■ 4.04
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 WDR97A6NE52 1622 aa40.24■■■■■ 4.03
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.14■■■■■ 4.02
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40■■■■□ 3.99
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.99■■■■□ 3.99
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 GRIN2BQ13224 1484 aa39.97■■■■□ 3.99
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 PBRM1Q86U86 1689 aa39.96■■■■□ 3.99
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.94■■■■□ 3.98
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 OSCARQ8IYS5 282 aa39.93■■■■□ 3.98
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CHD1O14646 1710 aa39.91■■■■□ 3.98
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.44■■■■□ 3.9
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VLDLR-AS1-204ENST00000453601 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ARHGEF11O15085 1522 aa39.34■■■■□ 3.89
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CUL7Q14999 1698 aa39.32■■■■□ 3.88
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CEP170Q5SW79 1584 aa39.3■■■■□ 3.88
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 NUP160Q12769 1436 aa39.29■■■■□ 3.88
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.26■■■■□ 3.88
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.17■■■■□ 3.86
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 ARAP1Q96P48 1450 aa39.04■■■■□ 3.84
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.02■■■■□ 3.84
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 SHROOM2Q13796 1616 aa39.01■■■■□ 3.84
VLDLR-AS1-204ENST00000453601 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.95■■■■□ 3.83
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