RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448726.5

PRRG3-204, Transcript of proline rich and Gla domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene PRRG3, Length 339 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRG3-204ENST00000448726 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.64■■■■■ 7.62
PRRG3-204ENST00000448726 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.76■■■■■ 6.52
PRRG3-204ENST00000448726 ABCC9O60706 1549 aa54.25■■■■■ 6.28
PRRG3-204ENST00000448726 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.36■■■■■ 5.97
PRRG3-204ENST00000448726 NACADO15069 1562 aa52.34■■■■■ 5.97
PRRG3-204ENST00000448726 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.24■■■■■ 5.95
PRRG3-204ENST00000448726 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.12■■■■■ 5.93
PRRG3-204ENST00000448726 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52■■■■■ 5.91
PRRG3-204ENST00000448726 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.93■■■■■ 5.9
PRRG3-204ENST00000448726 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.24■■■■■ 5.79
PRRG3-204ENST00000448726 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.77■■■■■ 5.72
PRRG3-204ENST00000448726 SCRIBQ14160 1630 aa50.75■■■■■ 5.71
PRRG3-204ENST00000448726 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.61■■■■■ 5.69
PRRG3-204ENST00000448726 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.34■■■■■ 5.65
PRRG3-204ENST00000448726 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.63■■■■■ 5.54
PRRG3-204ENST00000448726 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
PRRG3-204ENST00000448726 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.17■■■■■ 5.46
PRRG3-204ENST00000448726 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.77■■■■■ 5.4
PRRG3-204ENST00000448726 SMARCA4P51532 1647 aa48.61■■■■■ 5.37
PRRG3-204ENST00000448726 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.57■■■■■ 5.37
PRRG3-204ENST00000448726 SMARCA2P51531 1590 aa48.27■■■■■ 5.32
PRRG3-204ENST00000448726 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.27■■■■■ 5.32
PRRG3-204ENST00000448726 NCAPD3P42695 1498 aa48.25■■■■■ 5.31
PRRG3-204ENST00000448726 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.24■■■■■ 5.31
PRRG3-204ENST00000448726 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.2■■■■■ 5.31
PRRG3-204ENST00000448726 HMGXB3Q12766 1538 aa48.09■■■■■ 5.29
PRRG3-204ENST00000448726 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
PRRG3-204ENST00000448726 WIZO95785 1651 aa47.75■■■■■ 5.23
PRRG3-204ENST00000448726 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.71■■■■■ 5.23
PRRG3-204ENST00000448726 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
PRRG3-204ENST00000448726 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.01■■■■■ 5.12
PRRG3-204ENST00000448726 NESP48681 1621 aa46.99■■■■■ 5.11
PRRG3-204ENST00000448726 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.8■■■■■ 5.08
PRRG3-204ENST00000448726 ERCC6Q03468 1493 aa46.76■■■■■ 5.08
PRRG3-204ENST00000448726 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.65■■■■■ 5.06
PRRG3-204ENST00000448726 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.61■■■■■ 5.05
PRRG3-204ENST00000448726 CFTRP13569 1480 aa46.59■■■■■ 5.05
PRRG3-204ENST00000448726 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.55■■■■■ 5.04
PRRG3-204ENST00000448726 PRDM2Q13029 1718 aa46.4■■■■■ 5.02
PRRG3-204ENST00000448726 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
PRRG3-204ENST00000448726 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
PRRG3-204ENST00000448726 CUX2O14529 1486 aa46.33■■■■■ 5.01
PRRG3-204ENST00000448726 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.28■■■■■ 5
PRRG3-204ENST00000448726 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.23■■■■■ 4.99
PRRG3-204ENST00000448726 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.15■■■■■ 4.98
PRRG3-204ENST00000448726 WDR62O43379 1518 aa46.04■■■■■ 4.96
PRRG3-204ENST00000448726 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
PRRG3-204ENST00000448726 ABCC8Q09428 1581 aa45.6■■■■■ 4.89
PRRG3-204ENST00000448726 TOPBP1Q92547 1522 aa45.57■■■■■ 4.89
PRRG3-204ENST00000448726 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.57■■■■■ 4.89
PRRG3-204ENST00000448726 IFT140Q96RY7 1462 aa45.27■■■■■ 4.84
PRRG3-204ENST00000448726 CUX1P39880 1505 aa45.26■■■■■ 4.84
PRRG3-204ENST00000448726 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
PRRG3-204ENST00000448726 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
PRRG3-204ENST00000448726 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.08■■■■■ 4.81
PRRG3-204ENST00000448726 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
PRRG3-204ENST00000448726 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.98■■■■■ 4.79
PRRG3-204ENST00000448726 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.98■■■■■ 4.79
PRRG3-204ENST00000448726 TOP2BQ02880 1626 aa44.95■■■■■ 4.79
PRRG3-204ENST00000448726 SOGA1O94964 1423 aa44.94■■■■■ 4.79
PRRG3-204ENST00000448726 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
PRRG3-204ENST00000448726 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.92■■■■■ 4.78
PRRG3-204ENST00000448726 SYNJ1O43426 1573 aa44.91■■■■■ 4.78
PRRG3-204ENST00000448726 WDR97A6NE52 1622 aa44.85■■■■■ 4.77
PRRG3-204ENST00000448726 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.72■■■■■ 4.75
PRRG3-204ENST00000448726 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.7■■■■■ 4.75
PRRG3-204ENST00000448726 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.67■■■■■ 4.74
PRRG3-204ENST00000448726 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
PRRG3-204ENST00000448726 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.55■■■■■ 4.72
PRRG3-204ENST00000448726 PBRM1Q86U86 1689 aa44.47■■■■■ 4.71
PRRG3-204ENST00000448726 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.47■■■■■ 4.71
PRRG3-204ENST00000448726 GRIN2BQ13224 1484 aa44.46■■■■■ 4.71
PRRG3-204ENST00000448726 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.38■■■■■ 4.69
PRRG3-204ENST00000448726 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
PRRG3-204ENST00000448726 CHD1O14646 1710 aa44.35■■■■■ 4.69
PRRG3-204ENST00000448726 OSCARQ8IYS5 282 aa44.29■■■■■ 4.68
PRRG3-204ENST00000448726 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.19■■■■■ 4.66
PRRG3-204ENST00000448726 SYNJ2O15056 1496 aa44.17■■■■■ 4.66
PRRG3-204ENST00000448726 ADAMTS12P58397 1594 aa44.1■■■■■ 4.65
PRRG3-204ENST00000448726 FBLN2P98095 1184 aa44.06■■■■■ 4.64
PRRG3-204ENST00000448726 KIF27Q86VH2 1401 aa44.03■■■■■ 4.64
PRRG3-204ENST00000448726 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
PRRG3-204ENST00000448726 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.97■■■■■ 4.63
PRRG3-204ENST00000448726 GRIN2AQ12879 1464 aa43.9■■■■■ 4.62
PRRG3-204ENST00000448726 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.87■■■■■ 4.61
PRRG3-204ENST00000448726 TRIM41Q8WV44 630 aa43.85■■■■■ 4.61
PRRG3-204ENST00000448726 CUL7Q14999 1698 aa43.83■■■■■ 4.61
PRRG3-204ENST00000448726 IGF1RP08069 1367 aa43.81■■■■■ 4.6
PRRG3-204ENST00000448726 NUP160Q12769 1436 aa43.73■■■■■ 4.59
PRRG3-204ENST00000448726 CEP170Q5SW79 1584 aa43.7■■■■■ 4.59
PRRG3-204ENST00000448726 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
PRRG3-204ENST00000448726 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
PRRG3-204ENST00000448726 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.7■■■■■ 4.59
PRRG3-204ENST00000448726 ARHGEF11O15085 1522 aa43.68■■■■■ 4.58
PRRG3-204ENST00000448726 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.61■■■■■ 4.57
PRRG3-204ENST00000448726 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.55■■■■■ 4.56
PRRG3-204ENST00000448726 SHROOM2Q13796 1616 aa43.44■■■■■ 4.55
PRRG3-204ENST00000448726 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.41■■■■■ 4.54
PRRG3-204ENST00000448726 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.35■■■■■ 4.53
PRRG3-204ENST00000448726 ARAP1Q96P48 1450 aa43.33■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms