RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443546.1

TFAP2A-AS1-202, TFAP2A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TFAP2A-AS1, Length 910 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.27■■■■■ 4.04
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.52■■■■□ 3.28
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ABCC9O60706 1549 aa33.62■■■□□ 2.97
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.47■■■□□ 2.95
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.27■■■□□ 2.92
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.14■■■□□ 2.9
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 NACADO15069 1562 aa33.13■■■□□ 2.89
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.93■■■□□ 2.86
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SCRIBQ14160 1630 aa32.34■■■□□ 2.77
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.27■■■□□ 2.76
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.13■■■□□ 2.73
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.76■■■□□ 2.67
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.14■■■□□ 2.58
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SMARCA4P51532 1647 aa31.08■■■□□ 2.57
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.99■■■□□ 2.55
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.79■■■□□ 2.52
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 WIZO95785 1651 aa30.74■■■□□ 2.51
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SMARCA2P51531 1590 aa30.73■■■□□ 2.51
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.61■■■□□ 2.49
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.51■■■□□ 2.48
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 HMGXB3Q12766 1538 aa30.49■■■□□ 2.47
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 NCAPD3P42695 1498 aa30.48■■■□□ 2.47
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.09■■■□□ 2.41
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.79■■■□□ 2.36
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 PRDM2Q13029 1718 aa29.68■■■□□ 2.34
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CFTRP13569 1480 aa29.67■■■□□ 2.34
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.63■■■□□ 2.33
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.6■■■□□ 2.33
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.4■■■□□ 2.3
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.34■■■□□ 2.29
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 NESP48681 1621 aa29.34■■■□□ 2.29
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.29■■■□□ 2.28
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ABCC8Q09428 1581 aa29.27■■■□□ 2.28
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.22■■■□□ 2.27
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 TRIM41Q8WV44 630 aa29.21■■■□□ 2.27
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.14■■■□□ 2.26
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.14■■■□□ 2.26
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 TOP2BQ02880 1626 aa29.12■■■□□ 2.25
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SYNJ1O43426 1573 aa29.09■■■□□ 2.25
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.05■■■□□ 2.24
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CUX1P39880 1505 aa29.04■■■□□ 2.24
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ERCC6Q03468 1493 aa29■■■□□ 2.23
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.96■■■□□ 2.23
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 TOPBP1Q92547 1522 aa28.93■■■□□ 2.22
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 WDR62O43379 1518 aa28.83■■■□□ 2.21
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.82■■■□□ 2.2
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 EEA1Q15075 1411 aa28.79■■■□□ 2.2
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SOGA1O94964 1423 aa28.64■■■□□ 2.18
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.63■■■□□ 2.17
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 KIF27Q86VH2 1401 aa28.61■■■□□ 2.17
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 WDR97A6NE52 1622 aa28.6■■■□□ 2.17
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 IFT140Q96RY7 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CUX2O14529 1486 aa28.54■■■□□ 2.16
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.53■■■□□ 2.16
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.46■■■□□ 2.15
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.45■■■□□ 2.14
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.43■■■□□ 2.14
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 KIF21BO75037 1637 aa28.37■■■□□ 2.13
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.35■■■□□ 2.13
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.34■■■□□ 2.13
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CUL7Q14999 1698 aa28.32■■■□□ 2.12
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 PBRM1Q86U86 1689 aa28.29■■■□□ 2.12
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 GOLGA3Q08378 1498 aa28.27■■■□□ 2.12
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 IGF1RP08069 1367 aa28.25■■■□□ 2.11
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 PRXQ9BXM0 1461 aa28.25■■■□□ 2.11
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 GRIN2BQ13224 1484 aa28.24■■■□□ 2.11
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.17■■■□□ 2.1
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.1■■■□□ 2.09
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 ADAMTS12P58397 1594 aa28.1■■■□□ 2.09
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.09■■■□□ 2.09
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.06■■■□□ 2.08
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.02■■■□□ 2.08
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.95■■■□□ 2.06
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 SYNJ2O15056 1496 aa27.94■■■□□ 2.06
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.92■■■□□ 2.06
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 GRIN2AQ12879 1464 aa27.86■■■□□ 2.05
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CEP162Q5TB80 1403 aa27.82■■■□□ 2.04
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TFAP2A-AS1-202ENST00000443546 CHD1O14646 1710 aa27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms