RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443099.6

TMX3-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMX3, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-202ENST00000443099 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
TMX3-202ENST00000443099 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.76■■■□□ 2.35
TMX3-202ENST00000443099 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.67■■■□□ 2.34
TMX3-202ENST00000443099 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.7■■□□□ 1.86
TMX3-202ENST00000443099 ABCC9O60706 1549 aa26.39■■□□□ 1.81
TMX3-202ENST00000443099 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
TMX3-202ENST00000443099 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
TMX3-202ENST00000443099 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.29■■□□□ 1.64
TMX3-202ENST00000443099 NACADO15069 1562 aa25.14■■□□□ 1.62
TMX3-202ENST00000443099 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.03■■□□□ 1.6
TMX3-202ENST00000443099 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.83■■□□□ 1.57
TMX3-202ENST00000443099 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.72■■□□□ 1.55
TMX3-202ENST00000443099 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TMX3-202ENST00000443099 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.61■■□□□ 1.53
TMX3-202ENST00000443099 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
TMX3-202ENST00000443099 FOXD1Q16676 465 aa24.49■■□□□ 1.51
TMX3-202ENST00000443099 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.45■■□□□ 1.5
TMX3-202ENST00000443099 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.4■■□□□ 1.5
TMX3-202ENST00000443099 SCRIBQ14160 1630 aa24.32■■□□□ 1.48
TMX3-202ENST00000443099 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.22■■□□□ 1.47
TMX3-202ENST00000443099 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.9■■□□□ 1.42
TMX3-202ENST00000443099 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.88■■□□□ 1.41
TMX3-202ENST00000443099 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TMX3-202ENST00000443099 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.75■■□□□ 1.39
TMX3-202ENST00000443099 SMARCA4P51532 1647 aa23.21■■□□□ 1.31
TMX3-202ENST00000443099 NCAPD3P42695 1498 aa23.14■■□□□ 1.29
TMX3-202ENST00000443099 SMARCA2P51531 1590 aa23.14■■□□□ 1.29
TMX3-202ENST00000443099 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
TMX3-202ENST00000443099 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.11■■□□□ 1.29
TMX3-202ENST00000443099 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.11■■□□□ 1.29
TMX3-202ENST00000443099 ADRA2BP18089 450 aa23.09■■□□□ 1.29
TMX3-202ENST00000443099 HMGXB3Q12766 1538 aa23.06■■□□□ 1.28
TMX3-202ENST00000443099 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TMX3-202ENST00000443099 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TMX3-202ENST00000443099 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.95■■□□□ 1.26
TMX3-202ENST00000443099 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.92■■□□□ 1.26
TMX3-202ENST00000443099 MSH5O43196 834 aa22.86■■□□□ 1.25
TMX3-202ENST00000443099 ERCC6Q03468 1493 aa22.84■■□□□ 1.25
TMX3-202ENST00000443099 NESP48681 1621 aa22.71■■□□□ 1.23
TMX3-202ENST00000443099 WIZO95785 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
TMX3-202ENST00000443099 CUX2O14529 1486 aa22.67■■□□□ 1.22
TMX3-202ENST00000443099 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.66■■□□□ 1.22
TMX3-202ENST00000443099 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
TMX3-202ENST00000443099 POTEDQ86YR6 584 aa22.51■■□□□ 1.19
TMX3-202ENST00000443099 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TMX3-202ENST00000443099 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.5■■□□□ 1.19
TMX3-202ENST00000443099 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TMX3-202ENST00000443099 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.46■■□□□ 1.19
TMX3-202ENST00000443099 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TMX3-202ENST00000443099 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.3■■□□□ 1.16
TMX3-202ENST00000443099 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.29■■□□□ 1.16
TMX3-202ENST00000443099 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.28■■□□□ 1.16
TMX3-202ENST00000443099 CFTRP13569 1480 aa22.25■■□□□ 1.15
TMX3-202ENST00000443099 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.24■■□□□ 1.15
TMX3-202ENST00000443099 WDR62O43379 1518 aa22.23■■□□□ 1.15
TMX3-202ENST00000443099 PRDM2Q13029 1718 aa22.22■■□□□ 1.15
TMX3-202ENST00000443099 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.13■■□□□ 1.13
TMX3-202ENST00000443099 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TMX3-202ENST00000443099 ABCC8Q09428 1581 aa21.84■■□□□ 1.09
TMX3-202ENST00000443099 TOPBP1Q92547 1522 aa21.84■■□□□ 1.09
TMX3-202ENST00000443099 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.82■■□□□ 1.08
TMX3-202ENST00000443099 IFT140Q96RY7 1462 aa21.79■■□□□ 1.08
TMX3-202ENST00000443099 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TMX3-202ENST00000443099 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TMX3-202ENST00000443099 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TMX3-202ENST00000443099 OSCARQ8IYS5 282 aa21.64■■□□□ 1.05
TMX3-202ENST00000443099 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TMX3-202ENST00000443099 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TMX3-202ENST00000443099 CUX1P39880 1505 aa21.54■■□□□ 1.04
TMX3-202ENST00000443099 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.53■■□□□ 1.04
TMX3-202ENST00000443099 SOGA1O94964 1423 aa21.53■■□□□ 1.04
TMX3-202ENST00000443099 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.044e-8■■■■□ 24.7
TMX3-202ENST00000443099 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.52■■□□□ 1.03
TMX3-202ENST00000443099 TRIM41Q8WV44 630 aa21.5■■□□□ 1.03
TMX3-202ENST00000443099 CHD1O14646 1710 aa21.49■■□□□ 1.03
TMX3-202ENST00000443099 WDR97A6NE52 1622 aa21.49■■□□□ 1.03
TMX3-202ENST00000443099 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TMX3-202ENST00000443099 FBLN2P98095 1184 aa21.39■■□□□ 1.01
TMX3-202ENST00000443099 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.38■■□□□ 1.01
TMX3-202ENST00000443099 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.38■■□□□ 1.01
TMX3-202ENST00000443099 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.38■■□□□ 1.01
TMX3-202ENST00000443099 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.36■■□□□ 1.01
TMX3-202ENST00000443099 PBRM1Q86U86 1689 aa21.35■■□□□ 1.01
TMX3-202ENST00000443099 GRIN2BQ13224 1484 aa21.34■■□□□ 1.01
TMX3-202ENST00000443099 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 ARHGEF11O15085 1522 aa21.32■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.32■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.29■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 TOP2BQ02880 1626 aa21.29■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.29■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.28■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
TMX3-202ENST00000443099 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
TMX3-202ENST00000443099 SYNJ1O43426 1573 aa21.26■□□□□ 0.99
TMX3-202ENST00000443099 SYNJ2O15056 1496 aa21.24■□□□□ 0.99
TMX3-202ENST00000443099 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
TMX3-202ENST00000443099 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.17■□□□□ 0.98
TMX3-202ENST00000443099 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.11■□□□□ 0.97
TMX3-202ENST00000443099 ADAMTS12P58397 1594 aa21.1■□□□□ 0.97
TMX3-202ENST00000443099 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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