RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442150.1

MDC1-AS1-201, MDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MDC1-AS1, Length 738 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1-AS1-201ENST00000442150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.5■■□□□ 1.19
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 ABCC9O60706 1549 aa20.17■□□□□ 0.82
MDC1-AS1-201ENST00000442150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.25■□□□□ 0.67
MDC1-AS1-201ENST00000442150 NACADO15069 1562 aa19.14■□□□□ 0.65
MDC1-AS1-201ENST00000442150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.95■□□□□ 0.62
MDC1-AS1-201ENST00000442150 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.94■□□□□ 0.62
MDC1-AS1-201ENST00000442150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.91■□□□□ 0.62
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.65■□□□□ 0.58
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.21■□□□□ 0.51
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 SMARCA4P51532 1647 aa17.53■□□□□ 0.4
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 CUX2O14529 1486 aa17.49■□□□□ 0.39
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 MRC2Q9UBG0 1479 aa17■□□□□ 0.31
MDC1-AS1-201ENST00000442150 WDR62O43379 1518 aa16.97■□□□□ 0.31
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.97■□□□□ 0.31
MDC1-AS1-201ENST00000442150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CFTRP13569 1480 aa16.93■□□□□ 0.3
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.9■□□□□ 0.3
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.69■□□□□ 0.26
MDC1-AS1-201ENST00000442150 PRDM2Q13029 1718 aa16.67■□□□□ 0.26
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 ABCC8Q09428 1581 aa16.6■□□□□ 0.25
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
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MDC1-AS1-201ENST00000442150 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.39■□□□□ 0.21
MDC1-AS1-201ENST00000442150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.39■□□□□ 0.21
MDC1-AS1-201ENST00000442150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
MDC1-AS1-201ENST00000442150 ARHGEF11O15085 1522 aa16.36■□□□□ 0.21
MDC1-AS1-201ENST00000442150 SOGA1O94964 1423 aa16.34■□□□□ 0.21
MDC1-AS1-201ENST00000442150 WDR97A6NE52 1622 aa16.33■□□□□ 0.2
MDC1-AS1-201ENST00000442150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.3■□□□□ 0.2
MDC1-AS1-201ENST00000442150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.29■□□□□ 0.2
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CHD1O14646 1710 aa16.28■□□□□ 0.2
MDC1-AS1-201ENST00000442150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CUX1P39880 1505 aa16.26■□□□□ 0.19
MDC1-AS1-201ENST00000442150 FBLN2P98095 1184 aa16.25■□□□□ 0.19
MDC1-AS1-201ENST00000442150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
MDC1-AS1-201ENST00000442150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.22■□□□□ 0.19
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.22■□□□□ 0.19
MDC1-AS1-201ENST00000442150 GRIN2BQ13224 1484 aa16.22■□□□□ 0.19
MDC1-AS1-201ENST00000442150 ARAP1Q96P48 1450 aa16.2■□□□□ 0.18
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.17■□□□□ 0.18
MDC1-AS1-201ENST00000442150 SYNJ2O15056 1496 aa16.16■□□□□ 0.18
MDC1-AS1-201ENST00000442150 SYNJ1O43426 1573 aa16.16■□□□□ 0.18
MDC1-AS1-201ENST00000442150 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.14■□□□□ 0.17
MDC1-AS1-201ENST00000442150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.14■□□□□ 0.17
MDC1-AS1-201ENST00000442150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
MDC1-AS1-201ENST00000442150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.08■□□□□ 0.17
MDC1-AS1-201ENST00000442150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
MDC1-AS1-201ENST00000442150 PBRM1Q86U86 1689 aa16.07■□□□□ 0.16
MDC1-AS1-201ENST00000442150 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MDC1-AS1-201ENST00000442150 TOP2BQ02880 1626 aa16.01■□□□□ 0.15
MDC1-AS1-201ENST00000442150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16■□□□□ 0.15
MDC1-AS1-201ENST00000442150 GRIN2AQ12879 1464 aa15.99■□□□□ 0.15
MDC1-AS1-201ENST00000442150 NUP160Q12769 1436 aa15.97■□□□□ 0.15
MDC1-AS1-201ENST00000442150 ADAMTS12P58397 1594 aa15.96■□□□□ 0.15
MDC1-AS1-201ENST00000442150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.95■□□□□ 0.14
MDC1-AS1-201ENST00000442150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.94■□□□□ 0.14
MDC1-AS1-201ENST00000442150 CEP170Q5SW79 1584 aa15.9■□□□□ 0.14
MDC1-AS1-201ENST00000442150 SHROOM2Q13796 1616 aa15.87■□□□□ 0.13
MDC1-AS1-201ENST00000442150 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.85■□□□□ 0.13
MDC1-AS1-201ENST00000442150 JPH4Q96JJ6 628 aa15.79■□□□□ 0.12
MDC1-AS1-201ENST00000442150 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
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