RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439350.1

ATP6AP1L-202, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6AP1L, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1L-202ENST00000439350 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.99■■■□□ 2.23
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1L-202ENST00000439350 NACADO15069 1562 aa24.25■■□□□ 1.47
ATP6AP1L-202ENST00000439350 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ATP6AP1L-202ENST00000439350 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ATP6AP1L-202ENST00000439350 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.16■■□□□ 1.46
ATP6AP1L-202ENST00000439350 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.05■■□□□ 1.44
ATP6AP1L-202ENST00000439350 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24■■□□□ 1.43
ATP6AP1L-202ENST00000439350 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.76■■□□□ 1.39
ATP6AP1L-202ENST00000439350 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1L-202ENST00000439350 SCRIBQ14160 1630 aa23.48■■□□□ 1.35
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.46■■□□□ 1.35
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.97■■□□□ 1.27
ATP6AP1L-202ENST00000439350 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.6■■□□□ 1.21
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 SMARCA2P51531 1590 aa22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1L-202ENST00000439350 NCAPD3P42695 1498 aa22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1L-202ENST00000439350 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1L-202ENST00000439350 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1L-202ENST00000439350 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1L-202ENST00000439350 HMGXB3Q12766 1538 aa22.29■■□□□ 1.16
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 WIZO95785 1651 aa22.08■■□□□ 1.13
ATP6AP1L-202ENST00000439350 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ATP6AP1L-202ENST00000439350 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ATP6AP1L-202ENST00000439350 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.79■■□□□ 1.08
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.66■■□□□ 1.06
ATP6AP1L-202ENST00000439350 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.58■■□□□ 1.05
ATP6AP1L-202ENST00000439350 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CFTRP13569 1480 aa21.57■■□□□ 1.04
ATP6AP1L-202ENST00000439350 PRDM2Q13029 1718 aa21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1L-202ENST00000439350 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CUX2O14529 1486 aa21.5■■□□□ 1.03
ATP6AP1L-202ENST00000439350 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.41■■□□□ 1.02
ATP6AP1L-202ENST00000439350 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.38■■□□□ 1.01
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 IFT140Q96RY7 1462 aa20.96■□□□□ 0.95
ATP6AP1L-202ENST00000439350 CUX1P39880 1505 aa20.94■□□□□ 0.94
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ATP6AP1L-202ENST00000439350 WDR97A6NE52 1622 aa20.81■□□□□ 0.92
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.76■□□□□ 0.91
ATP6AP1L-202ENST00000439350 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.72■□□□□ 0.91
ATP6AP1L-202ENST00000439350 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 CHD1O14646 1710 aa20.56■□□□□ 0.88
ATP6AP1L-202ENST00000439350 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1L-202ENST00000439350 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.54■□□□□ 0.88
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.35■□□□□ 0.85
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1L-202ENST00000439350 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1L-202ENST00000439350 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.26■□□□□ 0.83
ATP6AP1L-202ENST00000439350 ARHGEF11O15085 1522 aa20.25■□□□□ 0.83
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 NUP160Q12769 1436 aa20.24■□□□□ 0.83
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ATP6AP1L-202ENST00000439350 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.13■□□□□ 0.81
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