RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434181.5

CSMD2-AS1-205, CSMD2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CSMD2-AS1, Length 655 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.33■■■□□ 2.29
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.12■■□□□ 1.77
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ABCC9O60706 1549 aa25.47■■□□□ 1.67
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.47■■□□□ 1.51
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 NACADO15069 1562 aa24.44■■□□□ 1.5
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.3■■□□□ 1.48
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.24■■□□□ 1.47
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.22■■□□□ 1.47
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.17■■□□□ 1.46
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.91■■□□□ 1.42
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SCRIBQ14160 1630 aa23.87■■□□□ 1.41
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.46■■□□□ 1.35
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.36■■□□□ 1.33
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.09■■□□□ 1.29
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.91■■□□□ 1.26
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SMARCA4P51532 1647 aa22.82■■□□□ 1.24
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.67■■□□□ 1.22
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.6■■□□□ 1.21
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.57■■□□□ 1.2
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 NCAPD3P42695 1498 aa22.54■■□□□ 1.2
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SMARCA2P51531 1590 aa22.53■■□□□ 1.2
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 HMGXB3Q12766 1538 aa22.51■■□□□ 1.19
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 WIZO95785 1651 aa22.46■■□□□ 1.19
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 NESP48681 1621 aa22.13■■□□□ 1.13
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.98■■□□□ 1.11
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.93■■□□□ 1.1
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.85■■□□□ 1.09
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ERCC6Q03468 1493 aa21.84■■□□□ 1.09
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.84■■□□□ 1.09
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CFTRP13569 1480 aa21.79■■□□□ 1.08
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 PRDM2Q13029 1718 aa21.78■■□□□ 1.08
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.69■■□□□ 1.06
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.65■■□□□ 1.06
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CUX2O14529 1486 aa21.64■■□□□ 1.05
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.61■■□□□ 1.05
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.6■■□□□ 1.05
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 WDR62O43379 1518 aa21.6■■□□□ 1.05
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 TOPBP1Q92547 1522 aa21.35■■□□□ 1.01
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.34■■□□□ 1.01
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CUX1P39880 1505 aa21.26■□□□□ 0.99
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ABCC8Q09428 1581 aa21.18■□□□□ 0.98
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SYNJ1O43426 1573 aa21.14■□□□□ 0.97
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.13■□□□□ 0.97
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 IFT140Q96RY7 1462 aa21.13■□□□□ 0.97
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 WDR97A6NE52 1622 aa21.12■□□□□ 0.97
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.11■□□□□ 0.97
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.1■□□□□ 0.97
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 TOP2BQ02880 1626 aa21.06■□□□□ 0.96
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CSMD2-AS1-205ENST00000434181 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.93■□□□□ 0.94
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 PBRM1Q86U86 1689 aa20.91■□□□□ 0.94
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.9■□□□□ 0.94
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.9■□□□□ 0.94
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CHD1O14646 1710 aa20.88■□□□□ 0.93
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CSMD2-AS1-205ENST00000434181 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.77■□□□□ 0.92
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 GRIN2BQ13224 1484 aa20.75■□□□□ 0.91
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ADAMTS12P58397 1594 aa20.72■□□□□ 0.91
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SYNJ2O15056 1496 aa20.64■□□□□ 0.89
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.63■□□□□ 0.89
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.62■□□□□ 0.89
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 OSCARQ8IYS5 282 aa20.58■□□□□ 0.89
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 GRIN2AQ12879 1464 aa20.56■□□□□ 0.88
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CEP170Q5SW79 1584 aa20.55■□□□□ 0.88
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.55■□□□□ 0.88
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.55■□□□□ 0.88
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.55■□□□□ 0.88
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 FBLN2P98095 1184 aa20.53■□□□□ 0.88
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.53■□□□□ 0.88
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.52■□□□□ 0.87
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CUL7Q14999 1698 aa20.5■□□□□ 0.87
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 KIF27Q86VH2 1401 aa20.5■□□□□ 0.87
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ARHGEF11O15085 1522 aa20.49■□□□□ 0.87
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 NUP160Q12769 1436 aa20.46■□□□□ 0.87
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 IGF1RP08069 1367 aa20.46■□□□□ 0.87
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 SHROOM2Q13796 1616 aa20.4■□□□□ 0.86
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.4■□□□□ 0.86
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 ARAP1Q96P48 1450 aa20.37■□□□□ 0.85
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 TRIM41Q8WV44 630 aa20.36■□□□□ 0.85
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.29■□□□□ 0.84
CSMD2-AS1-205ENST00000434181 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.25■□□□□ 0.83
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