RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430824.2

CAPN8-204, Transcript of calpain 8, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN8, Length 695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8-204ENST00000430824 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPN8-204ENST00000430824 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPN8-204ENST00000430824 ABCC9O60706 1549 aa26.82■■□□□ 1.88
CAPN8-204ENST00000430824 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPN8-204ENST00000430824 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPN8-204ENST00000430824 NACADO15069 1562 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPN8-204ENST00000430824 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CAPN8-204ENST00000430824 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPN8-204ENST00000430824 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPN8-204ENST00000430824 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPN8-204ENST00000430824 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
CAPN8-204ENST00000430824 SCRIBQ14160 1630 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPN8-204ENST00000430824 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPN8-204ENST00000430824 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.7■■□□□ 1.55
CAPN8-204ENST00000430824 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPN8-204ENST00000430824 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CAPN8-204ENST00000430824 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPN8-204ENST00000430824 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPN8-204ENST00000430824 SMARCA4P51532 1647 aa23.89■■□□□ 1.42
CAPN8-204ENST00000430824 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPN8-204ENST00000430824 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPN8-204ENST00000430824 NCAPD3P42695 1498 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPN8-204ENST00000430824 SMARCA2P51531 1590 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPN8-204ENST00000430824 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPN8-204ENST00000430824 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPN8-204ENST00000430824 HMGXB3Q12766 1538 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPN8-204ENST00000430824 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPN8-204ENST00000430824 WIZO95785 1651 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPN8-204ENST00000430824 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPN8-204ENST00000430824 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPN8-204ENST00000430824 NESP48681 1621 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPN8-204ENST00000430824 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPN8-204ENST00000430824 ERCC6Q03468 1493 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPN8-204ENST00000430824 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPN8-204ENST00000430824 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPN8-204ENST00000430824 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPN8-204ENST00000430824 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPN8-204ENST00000430824 CFTRP13569 1480 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPN8-204ENST00000430824 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPN8-204ENST00000430824 CUX2O14529 1486 aa22.86■■□□□ 1.25
CAPN8-204ENST00000430824 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPN8-204ENST00000430824 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPN8-204ENST00000430824 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPN8-204ENST00000430824 PRDM2Q13029 1718 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPN8-204ENST00000430824 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPN8-204ENST00000430824 WDR62O43379 1518 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPN8-204ENST00000430824 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CAPN8-204ENST00000430824 ABCC8Q09428 1581 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPN8-204ENST00000430824 TOPBP1Q92547 1522 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPN8-204ENST00000430824 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPN8-204ENST00000430824 IFT140Q96RY7 1462 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPN8-204ENST00000430824 CUX1P39880 1505 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPN8-204ENST00000430824 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPN8-204ENST00000430824 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CAPN8-204ENST00000430824 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN8-204ENST00000430824 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPN8-204ENST00000430824 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPN8-204ENST00000430824 SOGA1O94964 1423 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPN8-204ENST00000430824 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPN8-204ENST00000430824 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
CAPN8-204ENST00000430824 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPN8-204ENST00000430824 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CAPN8-204ENST00000430824 TOP2BQ02880 1626 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN8-204ENST00000430824 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN8-204ENST00000430824 SYNJ1O43426 1573 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPN8-204ENST00000430824 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CAPN8-204ENST00000430824 WDR97A6NE52 1622 aa22■■□□□ 1.11
CAPN8-204ENST00000430824 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPN8-204ENST00000430824 OSCARQ8IYS5 282 aa21.95■■□□□ 1.1
CAPN8-204ENST00000430824 GRIN2BQ13224 1484 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN8-204ENST00000430824 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPN8-204ENST00000430824 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPN8-204ENST00000430824 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPN8-204ENST00000430824 FBLN2P98095 1184 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPN8-204ENST00000430824 PBRM1Q86U86 1689 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPN8-204ENST00000430824 CHD1O14646 1710 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPN8-204ENST00000430824 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPN8-204ENST00000430824 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CAPN8-204ENST00000430824 SYNJ2O15056 1496 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPN8-204ENST00000430824 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPN8-204ENST00000430824 ADAMTS12P58397 1594 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPN8-204ENST00000430824 KIF27Q86VH2 1401 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPN8-204ENST00000430824 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPN8-204ENST00000430824 TRIM41Q8WV44 630 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPN8-204ENST00000430824 GRIN2AQ12879 1464 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPN8-204ENST00000430824 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPN8-204ENST00000430824 IGF1RP08069 1367 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPN8-204ENST00000430824 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPN8-204ENST00000430824 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPN8-204ENST00000430824 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPN8-204ENST00000430824 ARHGEF11O15085 1522 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPN8-204ENST00000430824 CUL7Q14999 1698 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPN8-204ENST00000430824 NUP160Q12769 1436 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN8-204ENST00000430824 CEP170Q5SW79 1584 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPN8-204ENST00000430824 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN8-204ENST00000430824 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPN8-204ENST00000430824 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPN8-204ENST00000430824 ARAP1Q96P48 1450 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPN8-204ENST00000430824 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPN8-204ENST00000430824 SHROOM2Q13796 1616 aa21.35■■□□□ 1.01
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